JAL-1690 'scale protein as cDNA' options in Preferences, FontChooser
[jalview.git] / src / jalview / gui / FontChooser.java
index 6e99d91..72b7bd6 100755 (executable)
@@ -1,29 +1,36 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
- * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
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- * modify it under the terms of the GNU General Public License
- * as published by the Free Software Foundation; either version 2
- * of the License, or (at your option) any later version.
+ * This file is part of Jalview.
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- * GNU General Public License for more details.
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- * along with this program; if not, write to the Free Software
- * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  */
 package jalview.gui;
 
-import java.awt.*;
-import java.awt.event.*;
-import javax.swing.*;
+import java.awt.Font;
+import java.awt.FontMetrics;
+import java.awt.event.ActionEvent;
+
+import javax.swing.JInternalFrame;
+import javax.swing.JLayeredPane;
+import javax.swing.JOptionPane;
 
-import jalview.bin.*;
-import jalview.jbgui.*;
+import jalview.bin.Cache;
+import jalview.jbgui.GFontChooser;
+import jalview.util.MessageManager;
 
 /**
  * DOCUMENT ME!
@@ -39,6 +46,8 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
 
   Font oldFont;
 
+  boolean oldProteinScale;
+
   boolean init = true;
 
   JInternalFrame frame;
@@ -47,7 +56,7 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
    * Creates a new FontChooser object.
    * 
    * @param ap
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   public FontChooser(TreePanel tp)
   {
@@ -63,11 +72,13 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
    * Creates a new FontChooser object.
    * 
    * @param ap
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   public FontChooser(AlignmentPanel ap)
   {
     oldFont = ap.av.getFont();
+    oldProteinScale = ap.av.isScaleProteinAsCdna();
+
     this.ap = ap;
     init();
   }
@@ -79,14 +90,28 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
 
     smoothFont.setSelected(ap.av.antiAlias);
 
+    /*
+     * Enable 'scale protein as cDNA' in protein half of a SplitFrame view. The
+     * selection is stored in the ViewStyle of the Viewport
+     */
+    if (ap.av.getCodingComplement() != null
+            && !ap.av.getAlignment().isNucleotide())
+    {
+      scaleAsCdna.setVisible(true);
+      scaleAsCdna.setSelected(ap.av.isScaleProteinAsCdna());
+    }
+
     if (tp != null)
     {
-      Desktop.addInternalFrame(frame, "Change Font (Tree Panel)", 340, 170,
-              false);
+      Desktop.addInternalFrame(frame,
+              MessageManager.getString("action.change_font_tree_panel"),
+              400, 200, false);
     }
     else
     {
-      Desktop.addInternalFrame(frame, "Change Font", 340, 170, false);
+      Desktop.addInternalFrame(frame,
+              MessageManager.getString("action.change_font"), 380, 200,
+              false);
     }
 
     frame.setLayer(JLayeredPane.PALETTE_LAYER);
@@ -101,7 +126,7 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
 
     for (int i = 1; i < 51; i++)
     {
-      fontSize.addItem(i + "");
+      fontSize.addItem(i);
     }
 
     fontStyle.addItem("plain");
@@ -109,7 +134,7 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
     fontStyle.addItem("italic");
 
     fontName.setSelectedItem(oldFont.getName());
-    fontSize.setSelectedItem(oldFont.getSize() + "");
+    fontSize.setSelectedItem(oldFont.getSize());
     fontStyle.setSelectedIndex(oldFont.getStyle());
 
     FontMetrics fm = getGraphics().getFontMetrics(oldFont);
@@ -123,7 +148,7 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
   public void smoothFont_actionPerformed(ActionEvent e)
   {
     ap.av.antiAlias = smoothFont.isSelected();
-    ap.annotationPanel.image = null;
+    ap.getAnnotationPanel().image = null;
     ap.paintAlignment(true);
   }
 
@@ -131,7 +156,7 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param e
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   protected void ok_actionPerformed(ActionEvent e)
   {
@@ -155,13 +180,14 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param e
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   protected void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)
   {
     if (ap != null)
     {
-      ap.av.setFont(oldFont);
+      ap.av.setFont(oldFont, true);
+      ap.av.setScaleProteinAsCdna(oldProteinScale);
       ap.paintAlignment(true);
     }
     else if (tp != null)
@@ -169,7 +195,7 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
       tp.setTreeFont(oldFont);
     }
     fontName.setSelectedItem(oldFont.getName());
-    fontSize.setSelectedItem(oldFont.getSize() + "");
+    fontSize.setSelectedItem(oldFont.getSize());
     fontStyle.setSelectedIndex(oldFont.getStyle());
 
     try
@@ -180,37 +206,70 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
     }
   }
 
+  private Font lastSelected = null;
+
+  private int lastSelStyle = 0;
+
+  private int lastSelSize = 0;
+
+  private boolean lastSelMono = false;
+
   /**
    * DOCUMENT ME!
    */
   void changeFont()
   {
+    if (lastSelected == null)
+    {
+      // initialise with original font
+      lastSelected = oldFont;
+      lastSelSize = oldFont.getSize();
+      lastSelStyle = oldFont.getStyle();
+      FontMetrics fm = getGraphics().getFontMetrics(oldFont);
+      double mw = fm.getStringBounds("M", getGraphics()).getWidth(), iw = fm
+              .getStringBounds("I", getGraphics()).getWidth();
+      lastSelMono = mw == iw;
+    }
+
     Font newFont = new Font(fontName.getSelectedItem().toString(),
-            fontStyle.getSelectedIndex(), Integer.parseInt(fontSize
-                    .getSelectedItem().toString()));
+            fontStyle.getSelectedIndex(),
+            (Integer) fontSize.getSelectedItem());
+    FontMetrics fm = getGraphics().getFontMetrics(newFont);
+    double mw = fm.getStringBounds("M", getGraphics()).getWidth(), iw = fm
+            .getStringBounds("I", getGraphics()).getWidth();
+    if (mw < 1 || iw < 1)
+    {
+      fontName.setSelectedItem(lastSelected.getName());
+      fontStyle.setSelectedIndex(lastSelStyle);
+      fontSize.setSelectedItem(lastSelSize);
+      monospaced.setSelected(lastSelMono);
+      JOptionPane
+              .showInternalMessageDialog(
+                      this,
+                      MessageManager.getString("label.font_doesnt_have_letters_defined"),
+                      MessageManager.getString("label.invalid_font"), JOptionPane.WARNING_MESSAGE);
+      return;
+    }
     if (tp != null)
     {
       tp.setTreeFont(newFont);
     }
     else if (ap != null)
     {
-      ap.av.setFont(newFont);
+      ap.av.setFont(newFont, true);
       ap.fontChanged();
     }
 
-    FontMetrics fm = getGraphics().getFontMetrics(newFont);
-
-    monospaced.setSelected(fm.getStringBounds("M", getGraphics())
-            .getWidth() == fm.getStringBounds("|", getGraphics())
-            .getWidth());
-
+    monospaced.setSelected(mw == iw);
+    // remember last selected
+    lastSelected = newFont;
   }
 
   /**
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param e
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   protected void fontName_actionPerformed(ActionEvent e)
   {
@@ -226,7 +285,7 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param e
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   protected void fontSize_actionPerformed(ActionEvent e)
   {
@@ -242,7 +301,7 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param e
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   protected void fontStyle_actionPerformed(ActionEvent e)
   {
@@ -258,14 +317,26 @@ public class FontChooser extends GFontChooser
    * DOCUMENT ME!
    * 
    * @param e
-   *                DOCUMENT ME!
+   *          DOCUMENT ME!
    */
   public void defaultButton_actionPerformed(ActionEvent e)
   {
     Cache.setProperty("FONT_NAME", fontName.getSelectedItem().toString());
     Cache.setProperty("FONT_STYLE", fontStyle.getSelectedIndex() + "");
     Cache.setProperty("FONT_SIZE", fontSize.getSelectedItem().toString());
-    Cache.setProperty("ANTI_ALIAS", Boolean.toString(smoothFont
-            .isSelected()));
+    Cache.setProperty("ANTI_ALIAS",
+            Boolean.toString(smoothFont.isSelected()));
+  }
+
+  /**
+   * Turn on/off scaling of protein characters to 3 times the width of cDNA
+   * characters
+   */
+  @Override
+  protected void scaleAsCdna_actionPerformed(ActionEvent e)
+  {
+    ap.av.setScaleProteinAsCdna(scaleAsCdna.isSelected());
+    ((SplitFrame) ap.alignFrame.getSplitViewContainer()).adjustLayout();
+    ap.paintAlignment(true);
   }
 }