JAL-1691 applet SplitFrame scrolling; pull up of 5 fields to
[jalview.git] / src / jalview / gui / IdPanel.java
index 11cbd03..88d0c69 100755 (executable)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
- * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -27,6 +27,7 @@ import jalview.datamodel.SequenceI;
 import jalview.io.SequenceAnnotationReport;
 import jalview.util.MessageManager;
 import jalview.util.UrlLink;
+import jalview.viewmodel.AlignmentViewport;
 
 import java.awt.BorderLayout;
 import java.awt.event.MouseEvent;
@@ -54,7 +55,7 @@ public class IdPanel extends JPanel implements MouseListener,
 {
   private IdCanvas idCanvas;
 
-  protected AlignViewport av;
+  protected AlignmentViewport av;
 
   protected AlignmentPanel alignPanel;
 
@@ -110,7 +111,7 @@ public class IdPanel extends JPanel implements MouseListener,
       StringBuffer tip = new StringBuffer(64);
       seqAnnotReport
               .createSequenceAnnotationReport(tip, sequence,
-                      av.isShowDbRefs(), av.isShowNpFeats(),
+              av.isShowDBRefs(), av.isShowNPFeats(),
                       sp.seqCanvas.fr.getMinMax());
       setToolTipText("<html>" + sequence.getDisplayId(true) + " "
               + tip.toString() + "</html>");
@@ -362,6 +363,9 @@ public class IdPanel extends JPanel implements MouseListener,
     {
       selectSeq(seq);
     }
+    // TODO is this addition ok here?
+    av.isSelectionGroupChanged(true);
+
     alignPanel.paintAlignment(true);
   }