JAL-2282 Renamed internal use of sequence id / db accession for
[jalview.git] / src / jalview / gui / Preferences.java
index be0ac05..4f094e1 100755 (executable)
@@ -21,8 +21,8 @@
 package jalview.gui;
 
 import static jalview.util.UrlConstants.EMBLEBI_STRING;
+import static jalview.util.UrlConstants.DB_ACCESSION;
 import static jalview.util.UrlConstants.SEQUENCE_ID;
-import static jalview.util.UrlConstants.SEQUENCE_NAME;
 import static jalview.util.UrlConstants.SRS_STRING;
 
 import jalview.analysis.AnnotationSorter.SequenceAnnotationOrder;
@@ -126,10 +126,10 @@ public class Preferences extends GPreferences
         String name = st.nextToken();
         String url = st.nextToken();
         // check for '|' within a regex
-        int rxstart = url.indexOf("$" + SEQUENCE_ID + "$");
+        int rxstart = url.indexOf("$" + DB_ACCESSION + "$");
         if (rxstart == -1)
         {
-          rxstart = url.indexOf("$" + SEQUENCE_NAME + "$");
+          rxstart = url.indexOf("$" + SEQUENCE_ID + "$");
         }
         while (rxstart == -1 && url.indexOf("/=$") == -1)
         {