JAL-2388 Working hidden regions hide/show in desktop
[jalview.git] / src / jalview / gui / ScalePanel.java
index 316b6be..90f7cd2 100755 (executable)
@@ -21,6 +21,7 @@
 package jalview.gui;
 
 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
+import jalview.datamodel.HiddenColumns;
 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
 import jalview.renderer.ScaleRenderer;
@@ -43,6 +44,7 @@ import java.util.List;
 import javax.swing.JMenuItem;
 import javax.swing.JPanel;
 import javax.swing.JPopupMenu;
+import javax.swing.SwingUtilities;
 import javax.swing.ToolTipManager;
 
 /**
@@ -100,12 +102,12 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
   @Override
   public void mousePressed(MouseEvent evt)
   {
-    int x = (evt.getX() / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();
+    int x = (evt.getX() / av.getCharWidth()) + av.getRanges().getStartRes();
     final int res;
 
     if (av.hasHiddenColumns())
     {
-      x = av.getColumnSelection().adjustForHiddenColumns(x);
+      x = av.getAlignment().getHiddenColumns().adjustForHiddenColumns(x);
     }
 
     if (x >= av.getAlignment().getWidth())
@@ -120,10 +122,19 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
     min = res;
     max = res;
 
-    if (evt.isPopupTrigger())
+    if (evt.isPopupTrigger()) // Mac: mousePressed
     {
       rightMouseButtonPressed(evt, res);
     }
+    else if (SwingUtilities.isRightMouseButton(evt) && !Platform.isAMac())
+    {
+      /*
+       * defer right-mouse click handling to mouse up on Windows
+       * (where isPopupTrigger() will answer true)
+       * but accept Cmd-click on Mac which passes isRightMouseButton
+       */
+      return;
+    }
     else
     {
       leftMouseButtonPressed(evt, res);
@@ -162,7 +173,7 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
       });
       pop.add(item);
 
-      if (av.getColumnSelection().hasHiddenColumns())
+      if (av.getAlignment().getHiddenColumns().hasHiddenColumns())
       {
         item = new JMenuItem(MessageManager.getString("action.reveal_all"));
         item.addActionListener(new ActionListener()
@@ -222,6 +233,11 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
    */
   protected void leftMouseButtonPressed(MouseEvent evt, final int res)
   {
+    /*
+     * Ctrl-click/Cmd-click adds to the selection
+     * Shift-click extends the selection
+     */
+    // TODO Problem: right-click on Windows not reported until mouseReleased?!?
     if (!Platform.isControlDown(evt) && !evt.isShiftDown())
     {
       av.getColumnSelection().clear();
@@ -267,11 +283,13 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
   {
     mouseDragging = false;
 
-    int res = (evt.getX() / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();
+    int res = (evt.getX() / av.getCharWidth())
+            + av.getRanges().getStartRes();
 
     if (av.hasHiddenColumns())
     {
-      res = av.getColumnSelection().adjustForHiddenColumns(res);
+      res = av.getAlignment().getHiddenColumns()
+              .adjustForHiddenColumns(res);
     }
 
     if (res >= av.getAlignment().getWidth())
@@ -281,8 +299,14 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
 
     if (!stretchingGroup)
     {
-      ap.paintAlignment(false);
-
+      if (evt.isPopupTrigger()) // Windows: mouseReleased
+      {
+        rightMouseButtonPressed(evt, res);
+      }
+      else
+      {
+        ap.paintAlignment(false);
+      }
       return;
     }
 
@@ -305,77 +329,31 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
   }
 
   /**
-   * DOCUMENT ME!
+   * Action on dragging the mouse in the scale panel is to expand or shrink the
+   * selection group range (including any hidden columns that it spans)
    * 
    * @param evt
-   *          DOCUMENT ME!
    */
   @Override
   public void mouseDragged(MouseEvent evt)
   {
     mouseDragging = true;
+    ColumnSelection cs = av.getColumnSelection();
+    HiddenColumns hidden = av.getAlignment().getHiddenColumns();
 
-    int res = (evt.getX() / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();
-    if (res < 0)
-    {
-      res = 0;
-    }
-
-    if (av.hasHiddenColumns())
-    {
-      res = av.getColumnSelection().adjustForHiddenColumns(res);
-    }
-
-    if (res >= av.getAlignment().getWidth())
-    {
-      res = av.getAlignment().getWidth() - 1;
-    }
-
-    if (res < min)
-    {
-      min = res;
-    }
-
-    if (res > max)
-    {
-      max = res;
-    }
+    int res = (evt.getX() / av.getCharWidth())
+            + av.getRanges().getStartRes();
+    res = Math.max(0, res);
+    res = hidden.adjustForHiddenColumns(res);
+    res = Math.min(res, av.getAlignment().getWidth() - 1);
+    min = Math.min(res, min);
+    max = Math.max(res, max);
 
     SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();
-
     if (sg != null)
     {
       stretchingGroup = true;
-
-      if (!av.getColumnSelection().contains(res))
-      {
-        av.getColumnSelection().addElement(res);
-      }
-
-      if (res > sg.getStartRes())
-      {
-        sg.setEndRes(res);
-      }
-      if (res < sg.getStartRes())
-      {
-        sg.setStartRes(res);
-      }
-
-      int col;
-      for (int i = min; i <= max; i++)
-      {
-        col = i; // av.getColumnSelection().adjustForHiddenColumns(i);
-
-        if ((col < sg.getStartRes()) || (col > sg.getEndRes()))
-        {
-          av.getColumnSelection().removeElement(col);
-        }
-        else
-        {
-          av.getColumnSelection().addElement(col);
-        }
-      }
-
+      cs.stretchGroup(res, sg, min, max);
       ap.paintAlignment(false);
     }
   }
@@ -403,6 +381,9 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
   {
   }
 
+  /**
+   * Creates a tooltip when the mouse is over a hidden columns marker
+   */
   @Override
   public void mouseMoved(MouseEvent evt)
   {
@@ -413,13 +394,15 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
       return;
     }
 
-    int res = (evt.getX() / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();
+    int res = (evt.getX() / av.getCharWidth())
+            + av.getRanges().getStartRes();
 
-    res = av.getColumnSelection().adjustForHiddenColumns(res);
+    res = av.getAlignment().getHiddenColumns().adjustForHiddenColumns(res);
 
-    if (av.getColumnSelection().getHiddenColumns() != null)
+    if (av.getAlignment().getHiddenColumns().getHiddenRegions() != null)
     {
-      for (int[] region : av.getColumnSelection().getHiddenColumns())
+      for (int[] region : av.getAlignment().getHiddenColumns()
+              .getHiddenRegions())
       {
         if (res + 1 == region[0] || res - 1 == region[1])
         {
@@ -427,11 +410,11 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
           ToolTipManager.sharedInstance().registerComponent(this);
           this.setToolTipText(MessageManager
                   .getString("label.reveal_hidden_columns"));
-          break;
+          repaint();
+          return;
         }
       }
     }
-    repaint();
   }
 
   /**
@@ -443,7 +426,8 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
   @Override
   public void paintComponent(Graphics g)
   {
-    drawScale(g, av.getStartRes(), av.getEndRes(), getWidth(), getHeight());
+    drawScale(g, av.getRanges().getStartRes(), av.getRanges().getEndRes(),
+            getWidth(), getHeight());
   }
 
   // scalewidth will normally be screenwidth,
@@ -466,7 +450,9 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
 
     // Fill the selected columns
     ColumnSelection cs = av.getColumnSelection();
-    int avCharWidth = av.getCharWidth(), avCharHeight = av.getCharHeight();
+    HiddenColumns hidden = av.getAlignment().getHiddenColumns();
+    int avCharWidth = av.getCharWidth();
+    int avCharHeight = av.getCharHeight();
 
     if (cs != null)
     {
@@ -479,9 +465,9 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
 
         if (av.hasHiddenColumns())
         {
-          if (cs.isVisible(sel))
+          if (hidden.isVisible(sel))
           {
-            sel = cs.findColumnPosition(sel);
+            sel = hidden.findColumnPosition(sel);
           }
           else
           {
@@ -508,13 +494,13 @@ public class ScalePanel extends JPanel implements MouseMotionListener,
       // draw any hidden column markers
       gg.setColor(Color.blue);
       int res;
-      if (av.getShowHiddenMarkers()
-              && av.getColumnSelection().getHiddenColumns() != null)
+
+      if (av.getShowHiddenMarkers() && hidden.getHiddenRegions() != null)
       {
-        for (int i = 0; i < av.getColumnSelection().getHiddenColumns()
+        for (int i = 0; i < hidden.getHiddenRegions()
                 .size(); i++)
         {
-          res = av.getColumnSelection().findHiddenRegionPosition(i)
+          res = hidden.findHiddenRegionPosition(i)
                   - startx;
 
           if (res < 0 || res > widthx)