JAL-1925 update source version in license
[jalview.git] / src / jalview / gui / SeqPanel.java
index e922a0d..02b2078 100644 (file)
@@ -1,5 +1,5 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9)
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9.0b2)
  * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
@@ -680,7 +680,7 @@ public class SeqPanel extends JPanel implements MouseListener,
        * 
        * @see AlignmentPanel#adjustmentValueChanged
        */
-      ap.setFollowingComplementScroll(true);
+      ap.setDontScrollComplement(true);
       if (ap.scrollToPosition(results, false))
       {
         seqCanvas.revalidate();
@@ -904,7 +904,7 @@ public class SeqPanel extends JPanel implements MouseListener,
          * Convert position in sequence (base 1) to sequence character array
          * index (base 0)
          */
-        int start = m.getStart() - 1;
+        int start = m.getStart() - m.getSequence().getStart();
         setStatusMessage(seq, start, sequenceIndex);
         return;
       }