JAL-1925 update source version in license
[jalview.git] / src / jalview / gui / StructureViewer.java
index 2285765..fa0e91f 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
- * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9.0b2)
+ * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  */
 package jalview.gui;
 
-import java.awt.Rectangle;
-import java.util.ArrayList;
-import java.util.List;
-
 import jalview.api.structures.JalviewStructureDisplayI;
 import jalview.bin.Cache;
 import jalview.datamodel.PDBEntry;
@@ -31,6 +27,10 @@ import jalview.datamodel.SequenceI;
 import jalview.datamodel.StructureViewerModel;
 import jalview.structure.StructureSelectionManager;
 
+import java.awt.Rectangle;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.List;
+
 /**
  * proxy for handling structure viewers.
  * 
@@ -98,8 +98,7 @@ public class StructureViewer
    * @return
    */
   private JalviewStructureDisplayI onlyOnePdb(PDBEntry[] pdbs,
-          SequenceI[][] seqsForPdbs,
-          AlignmentPanel ap)
+          SequenceI[][] seqsForPdbs, AlignmentPanel ap)
   {
     List<SequenceI> seqs = new ArrayList<SequenceI>();
     if (pdbs == null || pdbs.length == 0)
@@ -190,8 +189,8 @@ public class StructureViewer
    */
   public JalviewStructureDisplayI createView(ViewerType type,
           String[] pdbf, String[] id, SequenceI[][] sq,
-          AlignmentPanel alignPanel, StructureViewerModel viewerData, String fileloc,
-          Rectangle rect, String vid)
+          AlignmentPanel alignPanel, StructureViewerModel viewerData,
+          String fileloc, Rectangle rect, String vid)
   {
     final boolean useinViewerSuperpos = viewerData.isAlignWithPanel();
     final boolean usetoColourbyseq = viewerData.isColourWithAlignPanel();