todo
[jalview.git] / src / jalview / io / AnnotationFile.java
index f1a7caf..5266d08 100755 (executable)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*\r
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)\r
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
  * \r
  * This file is part of Jalview.\r
  * \r
@@ -1343,7 +1343,7 @@ public class AnnotationFile
                   sg.getStartRes(), sg.getEndRes() + 1);\r
 \r
           c.calculate();\r
-          c.verdict(false, 25);\r
+          c.verdict(false, 25); // TODO: refer to conservation percent threshold\r
 \r
           sg.cs.setConservation(c);\r
 \r