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[jalview.git] / src / jalview / io / BLCFile.java
index c7cf2d6..c0ecd58 100755 (executable)
@@ -48,15 +48,16 @@ public class BLCFile extends AlignFile
    * 
    * @param inFile
    *          DOCUMENT ME!
-   * @param type
+   * @param sourceType
    *          DOCUMENT ME!
    * 
    * @throws IOException
    *           DOCUMENT ME!
    */
-  public BLCFile(String inFile, String type) throws IOException
+  public BLCFile(String inFile, DataSourceType sourceType)
+          throws IOException
   {
-    super(inFile, type);
+    super(inFile, sourceType);
   }
 
   public BLCFile(FileParse source) throws IOException
@@ -67,6 +68,7 @@ public class BLCFile extends AlignFile
   /**
    * DOCUMENT ME!
    */
+  @Override
   public void initData()
   {
     super.initData();
@@ -89,6 +91,7 @@ public class BLCFile extends AlignFile
   /**
    * DOCUMENT ME!
    */
+  @Override
   public void parse() throws IOException
   {
     StringBuffer headerLines = new StringBuffer();
@@ -153,7 +156,7 @@ public class BLCFile extends AlignFile
         }
       } while (!idsFound);
       if (line == null)
-       {
+      {
         break; // end of file.
       }
       int starCol = line.indexOf("*");
@@ -217,6 +220,7 @@ public class BLCFile extends AlignFile
    * 
    * @return DOCUMENT ME!
    */
+  @Override
   public String print()
   {
     return print(getSeqsAsArray());