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[jalview.git] / src / jalview / io / StockholmFile.java
index 840041d..6b60cd5 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*\r
  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
- * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
  * \r
  * This file is part of Jalview.\r
  * \r
@@ -521,7 +521,7 @@ public class StockholmFile extends AlignFile
     }\r
   }\r
 \r
-  private AlignmentAnnotation parseAnnotationRow(Vector annotation,\r
+  protected static AlignmentAnnotation parseAnnotationRow(Vector annotation,\r
           String label, String annots)\r
   {\r
     String convert1, convert2 = null;\r
@@ -640,7 +640,7 @@ public class StockholmFile extends AlignFile
     }\r
   }\r
 \r
-  private String id2type(String id)\r
+  protected static String id2type(String id)\r
   {\r
     if (typeIds.containsKey(id))\r
     {\r