import jalview.analysis.AnnotationSorter.SequenceAnnotationOrder;
import jalview.api.SplitContainerI;
import jalview.bin.Cache;
+import jalview.bin.Jalview;
import jalview.gui.JvSwingUtils;
import jalview.gui.Preferences;
import jalview.io.FileFormats;
protected JCheckBoxMenuItem hiddenMarkers = new JCheckBoxMenuItem();
- protected JTabbedPane tabbedPane = jalview.jbgui.swing.JTabbedPane.createTabbedPane();
+ protected JTabbedPane tabbedPane = jalview.jbgui.GDesktop.createTabbedPane();
protected JMenuItem reload = new JMenuItem();
alignFrameMenuBar.add(formatMenu);
alignFrameMenuBar.add(colourMenu);
alignFrameMenuBar.add(calculateMenu);
- alignFrameMenuBar.add(webService);
+ if (!Jalview.isJS())
+ {
+ alignFrameMenuBar.add(webService);
+ }
fileMenu.add(fetchSequence);
fileMenu.add(addSequenceMenu);
fileMenu.add(exportAnnotations);
fileMenu.add(loadTreeMenuItem);
fileMenu.add(associatedData);
- /*
- * No VCF import in Jalview-JS
- * @j2sNative
- */
+ if (!Jalview.isJS())
{
fileMenu.add(loadVcf);
}
hideMenu.add(hideAllSelection);
hideMenu.add(hideAllButSelection);
viewMenu.add(newView);
- viewMenu.add(expandViews);
- viewMenu.add(gatherViews);
+ if (!Jalview.isJS())
+ {
+ viewMenu.add(expandViews);
+ viewMenu.add(gatherViews);
+ }
viewMenu.addSeparator();
viewMenu.add(showMenu);
viewMenu.add(hideMenu);
calculateMenu.addSeparator();
calculateMenu.add(expandAlignment);
calculateMenu.add(extractScores);
- calculateMenu.addSeparator();
- calculateMenu.add(runGroovy);
+ if (!Jalview.isJS())
+ {
+ calculateMenu.addSeparator();
+ calculateMenu.add(runGroovy);
+ }
webServiceNoServices = new JMenuItem(
MessageManager.getString("label.no_services"));
webService.add(webServiceNoServices);
- exportImageMenu.add(htmlMenuItem);
+ if (!Jalview.isJS())
+ {
+ exportImageMenu.add(htmlMenuItem);
+ }
exportImageMenu.add(epsFile);
exportImageMenu.add(createPNG);
exportImageMenu.add(createBioJS);
- exportImageMenu.add(createSVG);
+ if (!Jalview.isJS())
+ {
+ exportImageMenu.add(createSVG);
+ }
addSequenceMenu.add(addFromFile);
addSequenceMenu.add(addFromText);
addSequenceMenu.add(addFromURL);