j2sNative references moved to Platform
[jalview.git] / src / jalview / jbgui / GPreferences.java
index dfd2c2d..1e01cc3 100755 (executable)
@@ -26,6 +26,7 @@ import jalview.fts.service.pdb.PDBFTSRestClient;
 import jalview.gui.JvSwingUtils;
 import jalview.gui.StructureViewer.ViewerType;
 import jalview.util.MessageManager;
+import jalview.util.Platform;
 
 import java.awt.BorderLayout;
 import java.awt.Color;
@@ -231,6 +232,10 @@ public class GPreferences extends JPanel
    */
   protected JComboBox<Object> epsRendering = new JComboBox<>();
 
+  protected JComboBox<Object> htmlRendering = new JComboBox<>();
+
+  protected JComboBox<Object> svgRendering = new JComboBox<>();
+
   protected JLabel userIdWidthlabel = new JLabel();
 
   protected JCheckBox autoIdWidth = new JCheckBox();
@@ -264,10 +269,6 @@ public class GPreferences extends JPanel
 
   protected JCheckBox sortByTree = new JCheckBox();
 
-  /*
-   * DAS Settings tab
-   */
-  protected JPanel dasTab = new JPanel();
 
   /*
    * Web Services tab
@@ -295,7 +296,7 @@ public class GPreferences extends JPanel
    */
   private void jbInit() throws Exception
   {
-    final JTabbedPane tabbedPane = new JTabbedPane();
+    final JTabbedPane tabbedPane = jalview.jbgui.GDesktop.createTabbedPane();
     this.setLayout(new BorderLayout());
     JPanel okCancelPanel = initOkCancelPanel();
     this.add(tabbedPane, BorderLayout.CENTER);
@@ -326,16 +327,13 @@ public class GPreferences extends JPanel
             MessageManager.getString("label.editing"));
 
     /*
-     * See DasSourceBrowser for the real work of configuring this tab.
-     */
-    dasTab.setLayout(new BorderLayout());
-    tabbedPane.add(dasTab, MessageManager.getString("label.das_settings"));
-
-    /*
      * See WsPreferences for the real work of configuring this tab.
      */
-    wsTab.setLayout(new BorderLayout());
-    tabbedPane.add(wsTab, MessageManager.getString("label.web_services"));
+    if (!Platform.isJS())
+    {
+      wsTab.setLayout(new BorderLayout());
+      tabbedPane.add(wsTab, MessageManager.getString("label.web_services"));
+    }
 
     /*
      * Handler to validate a tab before leaving it - currently only for
@@ -393,7 +391,7 @@ public class GPreferences extends JPanel
   }
 
   /**
-   * Initialises the Output tabbed panel.
+   * Initialises the Output tab
    * 
    * @return
    */
@@ -401,18 +399,35 @@ public class GPreferences extends JPanel
   {
     JPanel outputTab = new JPanel();
     outputTab.setLayout(null);
-    JLabel epsLabel = new JLabel();
+
+    JLabel epsLabel = new JLabel(
+            MessageManager.formatMessage("label.rendering_style", "EPS"));
     epsLabel.setFont(LABEL_FONT);
     epsLabel.setHorizontalAlignment(SwingConstants.RIGHT);
-    epsLabel.setText(MessageManager.getString("label.eps_rendering_style"));
-    epsLabel.setBounds(new Rectangle(9, 31, 140, 24));
+    epsLabel.setBounds(new Rectangle(9, 31, 160, 24));
     epsRendering.setFont(LABEL_FONT);
-    epsRendering.setBounds(new Rectangle(154, 34, 187, 21));
+    epsRendering.setBounds(new Rectangle(174, 34, 187, 21));
+    JLabel htmlLabel = new JLabel(
+            MessageManager.formatMessage("label.rendering_style", "HTML"));
+    htmlLabel.setFont(LABEL_FONT);
+    htmlLabel.setHorizontalAlignment(SwingConstants.RIGHT);
+    htmlLabel.setBounds(new Rectangle(9, 55, 160, 24));
+    htmlRendering.setFont(LABEL_FONT);
+    htmlRendering.setBounds(new Rectangle(174, 58, 187, 21));
+    JLabel svgLabel = new JLabel(
+            MessageManager.formatMessage("label.rendering_style", "SVG"));
+    svgLabel.setFont(LABEL_FONT);
+    svgLabel.setHorizontalAlignment(SwingConstants.RIGHT);
+    svgLabel.setBounds(new Rectangle(9, 79, 160, 24));
+    svgRendering.setFont(LABEL_FONT);
+    svgRendering.setBounds(new Rectangle(174, 82, 187, 21));
+
     JLabel jLabel1 = new JLabel();
     jLabel1.setFont(LABEL_FONT);
     jLabel1.setHorizontalAlignment(SwingConstants.CENTER);
     jLabel1.setText(MessageManager.getString("label.append_start_end"));
     jLabel1.setFont(LABEL_FONT);
+
     fastajv.setFont(LABEL_FONT);
     fastajv.setHorizontalAlignment(SwingConstants.LEFT);
     clustaljv.setText(MessageManager.getString("label.clustal") + "     ");
@@ -429,7 +444,7 @@ public class GPreferences extends JPanel
     TitledBorder titledBorder2 = new TitledBorder(
             MessageManager.getString("label.file_output"));
     jPanel11.setBorder(titledBorder2);
-    jPanel11.setBounds(new Rectangle(30, 72, 196, 182));
+    jPanel11.setBounds(new Rectangle(30, 120, 196, 182));
     GridLayout gridLayout3 = new GridLayout();
     jPanel11.setLayout(gridLayout3);
     gridLayout3.setRows(8);
@@ -448,7 +463,7 @@ public class GPreferences extends JPanel
             MessageManager.getString("label.automatically_set_id_width"));
     autoIdWidth.setToolTipText(JvSwingUtils.wrapTooltip(true, MessageManager
             .getString("label.adjusts_width_generated_eps_png")));
-    autoIdWidth.setBounds(new Rectangle(228, 96, 188, 23));
+    autoIdWidth.setBounds(new Rectangle(228, 144, 320, 23));
     autoIdWidth.addActionListener(new ActionListener()
     {
 
@@ -466,10 +481,10 @@ public class GPreferences extends JPanel
     userIdWidthlabel.setToolTipText(
             JvSwingUtils.wrapTooltip(true, MessageManager.getString(
                     "label.manually_specify_width_left_column")));
-    userIdWidthlabel.setBounds(new Rectangle(236, 120, 168, 23));
+    userIdWidthlabel.setBounds(new Rectangle(236, 168, 320, 23));
     userIdWidth.setFont(JvSwingUtils.getTextAreaFont());
     userIdWidth.setText("");
-    userIdWidth.setBounds(new Rectangle(232, 144, 84, 23));
+    userIdWidth.setBounds(new Rectangle(232, 192, 84, 23));
     userIdWidth.addActionListener(new ActionListener()
     {
 
@@ -482,10 +497,10 @@ public class GPreferences extends JPanel
     modellerOutput.setFont(LABEL_FONT);
     modellerOutput
             .setText(MessageManager.getString("label.use_modeller_output"));
-    modellerOutput.setBounds(new Rectangle(228, 226, 168, 23));
+    modellerOutput.setBounds(new Rectangle(228, 274, 320, 23));
     embbedBioJSON.setFont(LABEL_FONT);
     embbedBioJSON.setText(MessageManager.getString("label.embbed_biojson"));
-    embbedBioJSON.setBounds(new Rectangle(228, 200, 250, 23));
+    embbedBioJSON.setBounds(new Rectangle(228, 248, 250, 23));
 
     jPanel11.add(jLabel1);
     jPanel11.add(blcjv);
@@ -499,9 +514,19 @@ public class GPreferences extends JPanel
     outputTab.add(userIdWidth);
     outputTab.add(userIdWidthlabel);
     outputTab.add(modellerOutput);
-    outputTab.add(embbedBioJSON);
-    outputTab.add(epsLabel);
-    outputTab.add(epsRendering);
+    if (!Platform.isJS())
+    {
+      /*
+       * JalviewJS doesn't support Lineart option or SVG output
+       */
+      outputTab.add(embbedBioJSON);
+      outputTab.add(epsLabel);
+      outputTab.add(epsRendering);
+      outputTab.add(htmlLabel);
+      outputTab.add(htmlRendering);
+      outputTab.add(svgLabel);
+      outputTab.add(svgRendering);
+    }
     outputTab.add(jPanel11);
     return outputTab;
   }
@@ -524,7 +549,9 @@ public class GPreferences extends JPanel
             MessageManager.getString("label.default_browser_unix"));
     defaultBrowser.setFont(LABEL_FONT);
     defaultBrowser.setText("");
-
+    final String tooltip = JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
+            MessageManager.getString("label.double_click_to_browse"));
+    defaultBrowser.setToolTipText(tooltip);
     defaultBrowser.addMouseListener(new MouseAdapter()
     {
       @Override
@@ -1021,18 +1048,22 @@ public class GPreferences extends JPanel
             MessageManager.getString("label.ov_legacy_gap"));
     useLegacyGap.setFont(LABEL_FONT);
     useLegacyGap.setHorizontalAlignment(SwingConstants.LEFT);
+    useLegacyGap.setVerticalTextPosition(SwingConstants.TOP);
     gapLabel = new JLabel(
             MessageManager.getString("label.gap_colour"));
     gapLabel.setFont(LABEL_FONT);
     gapLabel.setHorizontalAlignment(SwingConstants.LEFT);
+    gapLabel.setVerticalTextPosition(SwingConstants.TOP);
     showHiddenAtStart = new JCheckBox(
             MessageManager.getString("label.ov_show_hide_default"));
     showHiddenAtStart.setFont(LABEL_FONT);
     showHiddenAtStart.setHorizontalAlignment(SwingConstants.LEFT);
+    showHiddenAtStart.setVerticalTextPosition(SwingConstants.TOP);
     JLabel hiddenLabel = new JLabel(
             MessageManager.getString("label.hidden_colour"));
     hiddenLabel.setFont(LABEL_FONT);
     hiddenLabel.setHorizontalAlignment(SwingConstants.LEFT);
+    hiddenLabel.setVerticalTextPosition(SwingConstants.TOP);
 
     useLegacyGap.addActionListener(new ActionListener()
     {
@@ -1202,14 +1233,14 @@ public class GPreferences extends JPanel
     pathLabel.setFont(new java.awt.Font("SansSerif", 0, 11));
     pathLabel.setHorizontalAlignment(SwingConstants.LEFT);
     pathLabel.setText(MessageManager.getString("label.chimera_path"));
-    final String tooltip = JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
-            MessageManager.getString("label.chimera_path_tip"));
-    pathLabel.setToolTipText(tooltip);
     pathLabel.setBounds(new Rectangle(10, ypos, 140, height));
     structureTab.add(pathLabel);
 
     chimeraPath.setFont(LABEL_FONT);
     chimeraPath.setText("");
+    final String tooltip = JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
+            MessageManager.getString("label.chimera_path_tip"));
+    chimeraPath.setToolTipText(tooltip);
     chimeraPath.setBounds(new Rectangle(160, ypos, 300, height));
     chimeraPath.addMouseListener(new MouseAdapter()
     {
@@ -1255,6 +1286,17 @@ public class GPreferences extends JPanel
     docFieldPref.setBounds(new Rectangle(10, ypos, 450, 120));
     structureTab.add(docFieldPref);
 
+    /*
+     * hide Chimera options in JalviewJS
+     */
+    if (Platform.isJS()) 
+    {
+      pathLabel.setVisible(false);
+      chimeraPath.setVisible(false);
+      viewerLabel.setVisible(false);
+      structViewer.setVisible(false);
+    }
+    
     return structureTab;
   }
 
@@ -1508,6 +1550,9 @@ public class GPreferences extends JPanel
     startupCheckbox.setSelected(true);
     startupFileTextfield.setFont(LABEL_FONT);
     startupFileTextfield.setBounds(new Rectangle(172, 310, 330, 20));
+    final String tooltip = JvSwingUtils.wrapTooltip(true,
+            MessageManager.getString("label.double_click_to_browse"));
+    startupFileTextfield.setToolTipText(tooltip);
     startupFileTextfield.addMouseListener(new MouseAdapter()
     {
       @Override
@@ -1628,6 +1673,13 @@ public class GPreferences extends JPanel
     visualTab.add(fontNameCB);
     visualTab.add(fontSizeCB);
     visualTab.add(fontStyleCB);
+    
+    if (Platform.isJS())
+    {
+      startupCheckbox.setVisible(false);
+      startupFileTextfield.setVisible(false);
+    }
+    
     return visualTab;
   }