2.5.1 release branding
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / AnnotationElement.java
index 576b4ad..3432eef 100755 (executable)
@@ -1,26 +1,25 @@
 /*\r
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
- * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)\r
+ * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
  * \r
- * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
- * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
- * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
- * of the License, or (at your option) any later version.\r
+ * This file is part of Jalview.\r
  * \r
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
- * GNU General Public License for more details.\r
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  * \r
- * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
- * along with this program; if not, write to the Free Software\r
- * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
+ * \r
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  */\r
 package jalview.schemabinding.version2;\r
 \r
-// ---------------------------------/\r
-// - Imported classes and packages -/\r
-// ---------------------------------/\r
+//---------------------------------/\r
+//- Imported classes and packages -/\r
+//---------------------------------/\r
 \r
 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
@@ -96,21 +95,21 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
   // -----------/\r
 \r
   /**\r
-   */\r
+     */\r
   public void deleteColour()\r
   {\r
     this._has_colour = false;\r
   }\r
 \r
   /**\r
-   */\r
+     */\r
   public void deletePosition()\r
   {\r
     this._has_position = false;\r
   }\r
 \r
   /**\r
-   */\r
+     */\r
   public void deleteValue()\r
   {\r
     this._has_value = false;\r
@@ -228,11 +227,10 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
    * \r
    * @param out\r
    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
-   *                 if object is null or if any SAXException is thrown during\r
-   *                 marshaling\r
+   *           if object is null or if any SAXException is thrown during\r
+   *           marshaling\r
    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *                 if this object is an invalid instance according to the\r
-   *                 schema\r
+   *           if this object is an invalid instance according to the schema\r
    */\r
   public void marshal(final java.io.Writer out)\r
           throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
@@ -246,13 +244,12 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
    * \r
    * @param handler\r
    * @throws java.io.IOException\r
-   *                 if an IOException occurs during marshaling\r
+   *           if an IOException occurs during marshaling\r
    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *                 if this object is an invalid instance according to the\r
-   *                 schema\r
+   *           if this object is an invalid instance according to the schema\r
    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
-   *                 if object is null or if any SAXException is thrown during\r
-   *                 marshaling\r
+   *           if object is null or if any SAXException is thrown during\r
+   *           marshaling\r
    */\r
   public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
           throws java.io.IOException,\r
@@ -266,7 +263,7 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
    * Sets the value of field 'colour'.\r
    * \r
    * @param colour\r
-   *                the value of field 'colour'.\r
+   *          the value of field 'colour'.\r
    */\r
   public void setColour(final int colour)\r
   {\r
@@ -278,7 +275,7 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
    * Sets the value of field 'description'.\r
    * \r
    * @param description\r
-   *                the value of field 'description'.\r
+   *          the value of field 'description'.\r
    */\r
   public void setDescription(final java.lang.String description)\r
   {\r
@@ -289,7 +286,7 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
    * Sets the value of field 'displayCharacter'.\r
    * \r
    * @param displayCharacter\r
-   *                the value of field 'displayCharacter'\r
+   *          the value of field 'displayCharacter'\r
    */\r
   public void setDisplayCharacter(final java.lang.String displayCharacter)\r
   {\r
@@ -300,7 +297,7 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
    * Sets the value of field 'position'.\r
    * \r
    * @param position\r
-   *                the value of field 'position'.\r
+   *          the value of field 'position'.\r
    */\r
   public void setPosition(final int position)\r
   {\r
@@ -312,7 +309,7 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
    * Sets the value of field 'secondaryStructure'.\r
    * \r
    * @param secondaryStructure\r
-   *                the value of field 'secondaryStructure'.\r
+   *          the value of field 'secondaryStructure'.\r
    */\r
   public void setSecondaryStructure(\r
           final java.lang.String secondaryStructure)\r
@@ -324,7 +321,7 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
    * Sets the value of field 'value'.\r
    * \r
    * @param value\r
-   *                the value of field 'value'.\r
+   *          the value of field 'value'.\r
    */\r
   public void setValue(final float value)\r
   {\r
@@ -337,11 +334,10 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
    * \r
    * @param reader\r
    * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
-   *                 if object is null or if any SAXException is thrown during\r
-   *                 marshaling\r
+   *           if object is null or if any SAXException is thrown during\r
+   *           marshaling\r
    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *                 if this object is an invalid instance according to the\r
-   *                 schema\r
+   *           if this object is an invalid instance according to the schema\r
    * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement\r
    */\r
   public static jalview.schemabinding.version2.AnnotationElement unmarshal(\r
@@ -359,8 +355,7 @@ public class AnnotationElement implements java.io.Serializable
    * \r
    * \r
    * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *                 if this object is an invalid instance according to the\r
-   *                 schema\r
+   *           if this object is an invalid instance according to the schema\r
    */\r
   public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
   {\r