\r
public Color findColour(String s, int j)\r
{\r
+ char res = s.charAt(0);\r
+ if ('a' <= res && res <= 'z' )\r
+ {\r
+ s = Character.toString( res -= ('a' - 'A') );\r
+ }\r
+\r
+\r
if ( (threshold != 0) && !aboveThreshold(s, j))\r
{\r
return Color.white;\r
}\r
\r
-\r
- if (!jalview.util.Comparison.isGap( (s.charAt(0))))\r
+ if (!jalview.util.Comparison.isGap( res ))\r
{\r
String max = (String) consensus[j].get("maxResidue");\r
\r