JAL-3070 JAL-3066 AlignmentI.findOrAddAnnotation(AlignmentAnnotation ala) - calls...
[jalview.git] / src / jalview / schemes / HmmerColourScheme.java
index 0f81ec1..05c9b66 100644 (file)
@@ -1,8 +1,8 @@
 package jalview.schemes;
 
+import jalview.api.AlignViewportI;
 import jalview.datamodel.AnnotatedCollectionI;
 import jalview.datamodel.HiddenMarkovModel;
-import jalview.datamodel.SequenceCollectionI;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
 import jalview.util.ColorUtils;
 import jalview.util.Comparison;
@@ -145,8 +145,8 @@ public abstract class HmmerColourScheme extends ResidueColourScheme
    * in ac that has an HMM
    */
   @Override
-  public ColourSchemeI getInstance(AnnotatedCollectionI ac,
-          Map<SequenceI, SequenceCollectionI> hiddenRepSequences)
+  public ColourSchemeI getInstance(AlignViewportI viewport,
+          AnnotatedCollectionI ac)
   {
     return newInstance(ac);
   }