aaIndex replaces aaHash
[jalview.git] / src / jalview / schemes / PIDColourScheme.java
index a79f083..e09745a 100755 (executable)
@@ -21,6 +21,7 @@ package jalview.schemes;
 import java.awt.*;\r
 \r
 import jalview.datamodel.*;\r
+import jalview.analysis.AAFrequency;\r
 \r
 public class PIDColourScheme\r
     extends ResidueColourScheme\r
@@ -56,7 +57,7 @@ public class PIDColourScheme
     if(consensus.length<=j)\r
       return Color.white;\r
 \r
-      if ( (Integer.parseInt(consensus[j].get("maxCount").toString()) != -1) &&\r
+      if ( (Integer.parseInt(consensus[j].get(AAFrequency.MAXCOUNT).toString()) != -1) &&\r
           consensus[j].contains(s))\r
       {\r
         sc = ( (Float) consensus[j].get(ignoreGaps)).floatValue();\r