JAL-1645 source formatting and organise imports
[jalview.git] / src / jalview / schemes / RNAHelicesColour.java
index 74cc803..d17f510 100644 (file)
@@ -40,7 +40,6 @@ import java.util.Map;
 public class RNAHelicesColour extends ResidueColourScheme
 {
 
-
   /**
    * Maps sequence positions to the RNA helix they belong to. Key: position,
    * Value: helix TODO: Revise or drop in favour of annotation position numbers
@@ -61,12 +60,14 @@ public class RNAHelicesColour extends ResidueColourScheme
   {
     super(ResidueProperties.nucleotideIndex);
     this.annotation = annotation;
+    ColourSchemeProperty.resetRnaHelicesShading();
     refresh();
   }
 
   public RNAHelicesColour(AnnotatedCollectionI alignment)
   {
     super(ResidueProperties.nucleotideIndex);
+    ColourSchemeProperty.resetRnaHelicesShading();
     alignmentChanged(alignment, null);
   }