Merge branch 'develop' into update_212_Dec_merge_with_21125_chamges
[jalview.git] / src / jalview / urls / IdentifiersUrlProvider.java
index e898438..24d2406 100644 (file)
@@ -75,7 +75,7 @@ public class IdentifiersUrlProvider extends UrlProviderImpl
    * @return hashmap of identifiers.org data, keyed by MIRIAM id
    */
   @SuppressWarnings("unchecked")
-private HashMap<String, UrlLink> readIdentifiers(String idFileName)
+  private HashMap<String, UrlLink> readIdentifiers(String idFileName)
   {
     // identifiers.org data
     HashMap<String, UrlLink> idData = new HashMap<>();
@@ -83,11 +83,11 @@ private HashMap<String, UrlLink> readIdentifiers(String idFileName)
     String errorMessage = null;
     try
     {
-       // NOTE: THIS WILL FAIL IN SWINGJS BECAUSE IT INVOLVES A FILE READER
-    
+      // NOTE: THIS WILL FAIL IN SWINGJS BECAUSE IT INVOLVES A FILE READER
       FileReader reader = new FileReader(idFileName);
       String key = "";
-      Map<String, Object> obj = (Map<String, Object>) JSONUtils.parse(reader);
+      Map<String, Object> obj = (Map<String, Object>) JSONUtils
+              .parse(reader);
       if (obj.containsKey(ID_ORG_KEY))
       {
         key = ID_ORG_KEY;
@@ -124,7 +124,8 @@ private HashMap<String, UrlLink> readIdentifiers(String idFileName)
     // BH 2018 -- added more valuable report
     if (errorMessage != null)
     {
-      System.err.println("IdentifiersUrlProvider: cannot read " + idFileName + ": " + errorMessage);
+      System.err.println("IdentifiersUrlProvider: cannot read " + idFileName
+              + ": " + errorMessage);
     }
     return idData;
   }