JAL-653 JAL-1780 refactor getGroups so HTMLfile/JSONfile adopt same pattern as other...
[jalview.git] / src / jalview / viewmodel / PCAModel.java
index a501793..c1175b7 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
- * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -47,7 +47,7 @@ public class PCAModel
   AlignmentView seqstrings;
 
   SequenceI[] seqs;
-  
+
   /**
    * Score matrix used to calculate PC
    */
@@ -70,7 +70,8 @@ public class PCAModel
   public void run()
   {
 
-    pca = new PCA(seqstrings.getSequenceStrings(' '), nucleotide, score_matrix);
+    pca = new PCA(seqstrings.getSequenceStrings(' '), nucleotide,
+            score_matrix);
     pca.setJvCalcMode(jvCalcMode);
     pca.run();
 
@@ -241,5 +242,5 @@ public class PCAModel
   {
     this.score_matrix = score_matrix;
   }
-  
+
 }