unnecessary code
[jalview.git] / src / jalview / ws / dbsources / Uniprot.java
index 814c534..3331756 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
- * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Development Version 2.4.1)
+ * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License
@@ -76,7 +76,7 @@ public class Uniprot extends DbSourceProxyImpl implements DbSourceProxy
    */
   public Regex getAccessionValidator()
   {
-    return null;
+    return new Regex("([A-Z]+[0-9]+[A-Z0-9]+|[A-Z0-9]+_[A-Z0-9]+)");
   }
 
   /*
@@ -277,7 +277,8 @@ public class Uniprot extends DbSourceProxyImpl implements DbSourceProxy
    */
   public boolean isValidReference(String accession)
   {
-    return true;
+    // TODO: make the following a standard validator
+    return (accession==null || accession.length()<2) ? false : getAccessionValidator().search(accession);
   }
 
   /**