JAL-1807 explicit imports (jalview.ws.*)
[jalview.git] / src / jalview / ws / dbsources / Xfam.java
index 756ca1b..30dfd06 100644 (file)
@@ -1,25 +1,28 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.1)
- * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
  *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  */
 package jalview.ws.dbsources;
 
 import jalview.datamodel.AlignmentI;
 import jalview.datamodel.DBRefEntry;
+import jalview.io.FormatAdapter;
 import jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxyImpl;
 
 /**
@@ -49,8 +52,8 @@ public abstract class Xfam extends DbSourceProxyImpl
     // retrieved.
     startQuery();
     // TODO: trap HTTP 404 exceptions and return null
-    AlignmentI rcds = new jalview.io.FormatAdapter().readFile(getXFAMURL()
-            + queries.trim().toUpperCase(), jalview.io.FormatAdapter.URL,
+    AlignmentI rcds = new FormatAdapter().readFile(getXFAMURL()
+            + queries.trim().toUpperCase(), FormatAdapter.URL,
             "STH");
     for (int s = 0, sNum = rcds.getHeight(); s < sNum; s++)
     {