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[jalview.git] / src / jalview / ws / rest / RestJobThread.java
index bdd20c9..858f5b5 100644 (file)
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 /*******************************************************************************
  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
- * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
  *
  * This file is part of Jalview.
  *
@@ -860,10 +860,8 @@ public class RestJobThread extends AWSThread
                 // TODO: cope with recovering hidden sequences from
                 // resultContext
                 {
-                  Vector sqs = sg.getSequences(null);
-                  for (int sqsi = 0, iSize = sqs.size(); sqsi < iSize; sqsi++)
+                  for (SequenceI oseq : sg.getSequences(null))
                   {
-                    SequenceI oseq = (SequenceI) sqs.get(sqsi);
                     SequenceI nseq = getNewSeq(oseq, rseqs[nrj],
                             ordermap[nrj], destAl);
                     if (nseq != null)