JAL-1713 update from Jalview 2.11.3 develop
[jalview.git] / src / jalview / xml / binding / uniprot / FeatureType.java
index fe9f4c4..0a6f7fe 100644 (file)
@@ -2,9 +2,10 @@
 // This file was generated by the JavaTM Architecture for XML Binding(JAXB) Reference Implementation, v2.2.8-b130911.1802 
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-// Generated on: 2019.04.05 at 08:01:44 AM BST 
+// Generated on: 2023.01.31 at 04:07:10 PM GMT 
 //
 
+
 package jalview.xml.binding.uniprot;
 
 import java.util.ArrayList;
@@ -15,16 +16,14 @@ import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
 
+
 /**
- * Describes different types of sequence annotations. Equivalent to the flat
- * file FT-line.
+ * Describes different types of sequence annotations.
+ *             Equivalent to the flat file FT-line.
  * 
- * <p>
- * Java class for featureType complex type.
+ * <p>Java class for featureType complex type.
  * 
- * <p>
- * The following schema fragment specifies the expected content contained within
- * this class.
+ * <p>The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
  * 
  * <pre>
  * &lt;complexType name="featureType">
@@ -101,259 +100,254 @@ import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  * 
  */
 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
-@XmlType(
-  name = "featureType",
-  propOrder =
-  { "original", "variation", "location" })
-public class FeatureType
-{
-
-  protected String original;
-
-  protected List<String> variation;
-
-  @XmlElement(required = true)
-  protected LocationType location;
-
-  @XmlAttribute(name = "type", required = true)
-  protected String type;
+@XmlType(name = "featureType", propOrder = {
+    "original",
+    "variation",
+    "location"
+})
+public class FeatureType {
 
-  @XmlAttribute(name = "status")
-  protected String status;
+    protected String original;
+    protected List<String> variation;
+    @XmlElement(required = true)
+    protected LocationType location;
+    @XmlAttribute(name = "type", required = true)
+    protected String type;
+    @XmlAttribute(name = "status")
+    protected String status;
+    @XmlAttribute(name = "id")
+    protected String id;
+    @XmlAttribute(name = "description")
+    protected String description;
+    @XmlAttribute(name = "evidence")
+    protected List<Integer> evidence;
+    @XmlAttribute(name = "ref")
+    protected String ref;
 
-  @XmlAttribute(name = "id")
-  protected String id;
-
-  @XmlAttribute(name = "description")
-  protected String description;
-
-  @XmlAttribute(name = "evidence")
-  protected List<Integer> evidence;
-
-  @XmlAttribute(name = "ref")
-  protected String ref;
-
-  /**
-   * Gets the value of the original property.
-   * 
-   * @return possible object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public String getOriginal()
-  {
-    return original;
-  }
+    /**
+     * Gets the value of the original property.
+     * 
+     * @return
+     *     possible object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public String getOriginal() {
+        return original;
+    }
 
-  /**
-   * Sets the value of the original property.
-   * 
-   * @param value
-   *          allowed object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public void setOriginal(String value)
-  {
-    this.original = value;
-  }
+    /**
+     * Sets the value of the original property.
+     * 
+     * @param value
+     *     allowed object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public void setOriginal(String value) {
+        this.original = value;
+    }
 
-  /**
-   * Gets the value of the variation property.
-   * 
-   * <p>
-   * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
-   * Therefore any modification you make to the returned list will be present
-   * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
-   * for the variation property.
-   * 
-   * <p>
-   * For example, to add a new item, do as follows:
-   * 
-   * <pre>
-   * getVariation().add(newItem);
-   * </pre>
-   * 
-   * 
-   * <p>
-   * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link String }
-   * 
-   * 
-   */
-  public List<String> getVariation()
-  {
-    if (variation == null)
-    {
-      variation = new ArrayList<String>();
+    /**
+     * Gets the value of the variation property.
+     * 
+     * <p>
+     * This accessor method returns a reference to the live list,
+     * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
+     * returned list will be present inside the JAXB object.
+     * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the variation property.
+     * 
+     * <p>
+     * For example, to add a new item, do as follows:
+     * <pre>
+     *    getVariation().add(newItem);
+     * </pre>
+     * 
+     * 
+     * <p>
+     * Objects of the following type(s) are allowed in the list
+     * {@link String }
+     * 
+     * 
+     */
+    public List<String> getVariation() {
+        if (variation == null) {
+            variation = new ArrayList<String>();
+        }
+        return this.variation;
     }
-    return this.variation;
-  }
 
-  /**
-   * Gets the value of the location property.
-   * 
-   * @return possible object is {@link LocationType }
-   * 
-   */
-  public LocationType getLocation()
-  {
-    return location;
-  }
+    /**
+     * Gets the value of the location property.
+     * 
+     * @return
+     *     possible object is
+     *     {@link LocationType }
+     *     
+     */
+    public LocationType getLocation() {
+        return location;
+    }
 
-  /**
-   * Sets the value of the location property.
-   * 
-   * @param value
-   *          allowed object is {@link LocationType }
-   * 
-   */
-  public void setLocation(LocationType value)
-  {
-    this.location = value;
-  }
+    /**
+     * Sets the value of the location property.
+     * 
+     * @param value
+     *     allowed object is
+     *     {@link LocationType }
+     *     
+     */
+    public void setLocation(LocationType value) {
+        this.location = value;
+    }
 
-  /**
-   * Gets the value of the type property.
-   * 
-   * @return possible object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public String getType()
-  {
-    return type;
-  }
+    /**
+     * Gets the value of the type property.
+     * 
+     * @return
+     *     possible object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public String getType() {
+        return type;
+    }
 
-  /**
-   * Sets the value of the type property.
-   * 
-   * @param value
-   *          allowed object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public void setType(String value)
-  {
-    this.type = value;
-  }
+    /**
+     * Sets the value of the type property.
+     * 
+     * @param value
+     *     allowed object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public void setType(String value) {
+        this.type = value;
+    }
 
-  /**
-   * Gets the value of the status property.
-   * 
-   * @return possible object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public String getStatus()
-  {
-    return status;
-  }
+    /**
+     * Gets the value of the status property.
+     * 
+     * @return
+     *     possible object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public String getStatus() {
+        return status;
+    }
 
-  /**
-   * Sets the value of the status property.
-   * 
-   * @param value
-   *          allowed object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public void setStatus(String value)
-  {
-    this.status = value;
-  }
+    /**
+     * Sets the value of the status property.
+     * 
+     * @param value
+     *     allowed object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public void setStatus(String value) {
+        this.status = value;
+    }
 
-  /**
-   * Gets the value of the id property.
-   * 
-   * @return possible object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public String getId()
-  {
-    return id;
-  }
+    /**
+     * Gets the value of the id property.
+     * 
+     * @return
+     *     possible object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public String getId() {
+        return id;
+    }
 
-  /**
-   * Sets the value of the id property.
-   * 
-   * @param value
-   *          allowed object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public void setId(String value)
-  {
-    this.id = value;
-  }
+    /**
+     * Sets the value of the id property.
+     * 
+     * @param value
+     *     allowed object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public void setId(String value) {
+        this.id = value;
+    }
 
-  /**
-   * Gets the value of the description property.
-   * 
-   * @return possible object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public String getDescription()
-  {
-    return description;
-  }
+    /**
+     * Gets the value of the description property.
+     * 
+     * @return
+     *     possible object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public String getDescription() {
+        return description;
+    }
 
-  /**
-   * Sets the value of the description property.
-   * 
-   * @param value
-   *          allowed object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public void setDescription(String value)
-  {
-    this.description = value;
-  }
+    /**
+     * Sets the value of the description property.
+     * 
+     * @param value
+     *     allowed object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public void setDescription(String value) {
+        this.description = value;
+    }
 
-  /**
-   * Gets the value of the evidence property.
-   * 
-   * <p>
-   * This accessor method returns a reference to the live list, not a snapshot.
-   * Therefore any modification you make to the returned list will be present
-   * inside the JAXB object. This is why there is not a <CODE>set</CODE> method
-   * for the evidence property.
-   * 
-   * <p>
-   * For example, to add a new item, do as follows:
-   * 
-   * <pre>
-   * getEvidence().add(newItem);
-   * </pre>
-   * 
-   * 
-   * <p>
-   * Objects of the following type(s) are allowed in the list {@link Integer }
-   * 
-   * 
-   */
-  public List<Integer> getEvidence()
-  {
-    if (evidence == null)
-    {
-      evidence = new ArrayList<Integer>();
+    /**
+     * Gets the value of the evidence property.
+     * 
+     * <p>
+     * This accessor method returns a reference to the live list,
+     * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
+     * returned list will be present inside the JAXB object.
+     * This is why there is not a <CODE>set</CODE> method for the evidence property.
+     * 
+     * <p>
+     * For example, to add a new item, do as follows:
+     * <pre>
+     *    getEvidence().add(newItem);
+     * </pre>
+     * 
+     * 
+     * <p>
+     * Objects of the following type(s) are allowed in the list
+     * {@link Integer }
+     * 
+     * 
+     */
+    public List<Integer> getEvidence() {
+        if (evidence == null) {
+            evidence = new ArrayList<Integer>();
+        }
+        return this.evidence;
     }
-    return this.evidence;
-  }
 
-  /**
-   * Gets the value of the ref property.
-   * 
-   * @return possible object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public String getRef()
-  {
-    return ref;
-  }
+    /**
+     * Gets the value of the ref property.
+     * 
+     * @return
+     *     possible object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public String getRef() {
+        return ref;
+    }
 
-  /**
-   * Sets the value of the ref property.
-   * 
-   * @param value
-   *          allowed object is {@link String }
-   * 
-   */
-  public void setRef(String value)
-  {
-    this.ref = value;
-  }
+    /**
+     * Sets the value of the ref property.
+     * 
+     * @param value
+     *     allowed object is
+     *     {@link String }
+     *     
+     */
+    public void setRef(String value) {
+        this.ref = value;
+    }
 
 }