Merge branch 'bug/JAL-4353_cannot_output_multiple_different_structure_images_for_one_...
[jalview.git] / test / jalview / bin / CommandsTest2.java
index d6b6f3c..aa3c834 100644 (file)
@@ -1,3 +1,23 @@
+/*
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
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+ *  
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+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ */
 package jalview.bin;
 
 import java.util.Date;
@@ -65,7 +85,8 @@ public class CommandsTest2
     String[] args = cmdLine.split("\\s+");
 
     CommandsTest.callJalviewMain(args);
-    while (Desktop.instance!=null && Desktop.instance.operationsAreInProgress())
+    while (Desktop.instance != null
+            && Desktop.instance.operationsAreInProgress())
     {
       try
       {
@@ -78,7 +99,7 @@ public class CommandsTest2
     }
     ;
 
-    AlignFrame[] afs = Desktop.getAlignFrames();
+    AlignFrame[] afs = Desktop.getDesktopAlignFrames();
     Assert.assertNotNull(afs);
     Assert.assertTrue(afs.length > 0);