Merge commit 'alpha/update_2_12_for_2_11_2_series_merge^2' into HEAD
[jalview.git] / test / jalview / gui / SeqCanvasTest.java
index aaacce0..98f2433 100644 (file)
 package jalview.gui;
 
 import static org.testng.Assert.assertEquals;
+import static org.testng.Assert.assertFalse;
+import static org.testng.Assert.assertNotNull;
+import static org.testng.Assert.assertNull;
+import static org.testng.Assert.assertTrue;
 
 import java.awt.Font;
 import java.awt.FontMetrics;
@@ -28,15 +32,26 @@ import java.awt.FontMetrics;
 import org.testng.annotations.BeforeMethod;
 import org.testng.annotations.Test;
 
+
 import jalview.bin.Cache;
 import jalview.datamodel.AlignmentI;
+import jalview.datamodel.SearchResults;
+import jalview.datamodel.SearchResultsI;
 import jalview.io.DataSourceType;
 import jalview.io.FileLoader;
+import jalview.util.Platform;
+import jalview.viewmodel.ViewportRanges;
 import junit.extensions.PA;
 
 public class SeqCanvasTest
 {
-  private AlignFrame af;
+  @BeforeClass(alwaysRun = true)
+  public void setUp()
+  {
+    Cache.loadProperties(null);
+    Cache.initLogger();
+    Desktop.getInstance().setVisible(false);
+  }
 
   /**
    * Test the method that computes wrapped width in residues, height of wrapped
@@ -57,8 +72,8 @@ public class SeqCanvasTest
     av.setFont(new Font("SansSerif", Font.PLAIN, 14), true);
     int charHeight = av.getCharHeight();
     int charWidth = av.getCharWidth();
-    assertEquals(charHeight, 17);
-    assertEquals(charWidth, 12);
+    assertEquals(charHeight, !Platform.isWin() ? 17 : 19);
+    assertEquals(charWidth, !Platform.isWin() ? 12 : 11);
 
     /*
      * first with scales above, left, right
@@ -69,7 +84,8 @@ public class SeqCanvasTest
     av.setScaleRightWrapped(true);
     FontMetrics fm = testee.getFontMetrics(av.getFont());
     int labelWidth = fm.stringWidth("000") + charWidth;
-    assertEquals(labelWidth, 39); // 3 x 9 + charWidth
+    assertEquals(labelWidth,
+            !Platform.isWin() ? 3 * 9 + charWidth : 3 * 8 + charWidth);
 
     /*
      * width 400 pixels leaves (400 - 2*labelWidth) for residue columns
@@ -191,7 +207,7 @@ public class SeqCanvasTest
     canvasWidth += 2;
     wrappedWidth = testee.calculateWrappedGeometry(canvasWidth,
             canvasHeight);
-    assertEquals(wrappedWidth, 24); // 2px not enough
+    assertEquals(wrappedWidth, !Platform.isWin() ? 24 : 25); // 2px not enough
     canvasWidth += 1;
     wrappedWidth = testee.calculateWrappedGeometry(canvasWidth,
             canvasHeight);
@@ -223,9 +239,8 @@ public class SeqCanvasTest
     av.setFont(new Font("SansSerif", Font.PLAIN, 14), true);
     int charHeight = av.getCharHeight();
     int charWidth = av.getCharWidth();
-    assertEquals(charHeight, 17);
-    assertEquals(charWidth, 12);
-  
+    assertEquals(charHeight, !Platform.isWin() ? 17 : 19);
+    assertEquals(charWidth, !Platform.isWin() ? 12 : 11);
     SeqCanvas testee = af.alignPanel.getSeqPanel().seqCanvas;
   
     /*
@@ -237,7 +252,8 @@ public class SeqCanvasTest
     av.setScaleRightWrapped(true);
     FontMetrics fm = testee.getFontMetrics(av.getFont());
     int labelWidth = fm.stringWidth("000") + charWidth;
-    assertEquals(labelWidth, 39); // 3 x 9 + charWidth
+    assertEquals(labelWidth,
+            !Platform.isWin() ? 3 * 9 + charWidth : 3 * 8 + charWidth);
     int annotationHeight = testee.getAnnotationHeight();
 
     /*
@@ -358,4 +374,26 @@ public class SeqCanvasTest
       }
     } while (af.getViewport().getCalcManager().isWorking());
   }
+  @Test(groups = "Functional")
+  public void testClear_HighlightAndSelection()
+  {
+    AlignFrame af = new FileLoader().LoadFileWaitTillLoaded(
+            "examples/uniref50.fa", DataSourceType.FILE);
+    AlignViewport av = af.getViewport();
+    SearchResultsI highlight = new SearchResults();
+    highlight.addResult(
+            av.getAlignment().getSequenceAt(1).getDatasetSequence(), 50,
+            80);
+    af.alignPanel.highlightSearchResults(highlight);
+    af.avc.markHighlightedColumns(false, false, false);
+    assertNotNull(av.getSearchResults(),
+            "No highlight was created on alignment");
+    assertFalse(av.getColumnSelection().isEmpty(),
+            "No selection was created from highlight");
+    af.deselectAllSequenceMenuItem_actionPerformed(null);
+    assertTrue(av.getColumnSelection().isEmpty(),
+            "No Selection should be present after deselecting all.");
+    assertNull(av.getSearchResults(),
+            "No higlighted search results should be present after deselecting all.");
+  }
 }