JAL-2512 And corresponding test
[jalview.git] / test / jalview / gui / SequenceRendererTest.java
index 0c2009d..c80b830 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9.0b1)
- * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -30,11 +30,19 @@ import jalview.schemes.ZappoColourScheme;
 
 import java.awt.Color;
 
+import org.testng.annotations.BeforeClass;
 import org.testng.annotations.Test;
 
 public class SequenceRendererTest
 {
 
+  @BeforeClass(alwaysRun = true)
+  public void setUpJvOptionPane()
+  {
+    JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
+    JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
+  }
+
   @Test(groups = { "Functional" })
   public void testGetResidueBoxColour_zappo()
   {
@@ -45,11 +53,29 @@ public class SequenceRendererTest
     av.setGlobalColourScheme(new ZappoColourScheme());
 
     // @see ResidueProperties.zappo
-    assertEquals(Color.pink, sr.getResidueColour(seq, 0, null)); // M
-    assertEquals(Color.green, sr.getResidueColour(seq, 2, null)); // T
-    assertEquals(Color.magenta, sr.getResidueColour(seq, 5, null)); // G
-    assertEquals(Color.orange, sr.getResidueColour(seq, 12, null)); // F
+    assertEquals(Color.pink, sr.getResidueBoxColour(seq, 0)); // M
+    assertEquals(Color.green, sr.getResidueBoxColour(seq, 2)); // T
+    assertEquals(Color.magenta, sr.getResidueBoxColour(seq, 5)); // G
+    assertEquals(Color.orange, sr.getResidueBoxColour(seq, 12)); // F
   }
+
+  @Test(groups = { "Functional" })
+  public void testGetResidueBoxColour_none()
+  {
+    SequenceI seq = new Sequence("name", "MA--TVLGSPRAPAFF");
+    AlignmentI al = new Alignment(new SequenceI[] { seq });
+    final AlignViewport av = new AlignViewport(al);
+    SequenceRenderer sr = new SequenceRenderer(av);
+
+    assertEquals(Color.white, sr.getResidueBoxColour(seq, 0));
+    assertEquals(Color.white, sr.getResidueBoxColour(seq, 2));
+
+    // set for overview
+    sr.forOverview = true;
+    assertEquals(Color.lightGray, sr.getResidueBoxColour(seq, 0));
+    assertEquals(Color.white, sr.getResidueBoxColour(seq, 2));
+  }
+
   // TODO more tests for getResidueBoxColour covering groups, feature rendering,
   // gaps, overview...