JAL-2189 format tests
[jalview.git] / test / jalview / io / AnnotatedPDBFileInputTest.java
index f3504e9..b8c12c6 100644 (file)
@@ -32,6 +32,7 @@ import jalview.datamodel.SequenceFeature;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
 import jalview.gui.AlignFrame;
 import jalview.structure.StructureImportSettings;
+import jalview.structure.StructureImportSettings.StructureParser;
 
 import java.io.File;
 
@@ -84,8 +85,8 @@ public class AnnotatedPDBFileInputTest
     {
       for (int q = p + 1; q < avec.length; q++)
       {
-        assertTrue("Found a duplicate annotation row "
-                + avec[p].label, avec[p] != avec[q]);
+        assertTrue("Found a duplicate annotation row " + avec[p].label,
+                avec[p] != avec[q]);
       }
     }
   }
@@ -100,11 +101,11 @@ public class AnnotatedPDBFileInputTest
       {
 
         System.out.println("CalcId: " + aa.getCalcId());
-        // if (StructureImportSettings.getDefaultPDBFileParser().equals(
-        // StructureParser.JALVIEW_PARSER))
-        // {
-        // assertTrue(MCview.PDBfile.isCalcIdForFile(aa, pdbId));
-        // }
+        if (StructureImportSettings.getDefaultPDBFileParser().equals(
+                StructureParser.JALVIEW_PARSER))
+        {
+          assertTrue(MCview.PDBfile.isCalcIdForFile(aa, pdbId));
+        }
       }
     }
   }