JAL-4386 Fixed failed test cases
[jalview.git] / test / jalview / io / gff / GffTests.java
index f0381e7..0bfb033 100644 (file)
@@ -33,11 +33,13 @@ import jalview.datamodel.Sequence;
 import jalview.datamodel.SequenceDummy;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
 import jalview.gui.AlignFrame;
+import jalview.gui.JvOptionPane;
 import jalview.io.DataSourceType;
 import jalview.io.FileLoader;
 
 import java.util.List;
 
+import org.testng.annotations.BeforeClass;
 import org.testng.annotations.Test;
 
 /**
@@ -47,6 +49,14 @@ import org.testng.annotations.Test;
  */
 public class GffTests
 {
+
+  @BeforeClass(alwaysRun = true)
+  public void setUpJvOptionPane()
+  {
+    JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
+    JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
+  }
+
   /**
    * Test the case where we load a protein ('query') sequence, then exonerateGff
    * describing its mapping to cDNA, and then a DNA sequence including the
@@ -56,8 +66,8 @@ public class GffTests
   public void testResolveExonerateGff()
   {
     String proteinSeq = ">prot1/10-16\nYCWRSGA";
-    AlignFrame af = new FileLoader(false).LoadFileWaitTillLoaded(
-            proteinSeq, DataSourceType.PASTE);
+    AlignFrame af = new FileLoader(false).LoadFileWaitTillLoaded(proteinSeq,
+            DataSourceType.PASTE);
 
     /*
      * exonerate GFF output mapping residues 11-15 (CWRSG)