JAL-2110 random stuff
[jalview.git] / test / jalview / util / DBRefUtilsTest.java
index 6c39b9b..96935ce 100644 (file)
@@ -33,6 +33,8 @@ import jalview.datamodel.PDBEntry;
 import jalview.datamodel.Sequence;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
 
+import java.util.List;
+
 import org.testng.annotations.Test;
 
 public class DBRefUtilsTest
@@ -191,12 +193,13 @@ public class DBRefUtilsTest
     ref5.setMap(new Mapping(new MapList(new int[] { 1, 1 }, new int[] { 1,
         1 }, 1, 1)));
 
-    DBRefEntry[] matches = DBRefUtils.searchRefs(new DBRefEntry[] { ref1,
+    List<DBRefEntry> matches = DBRefUtils.searchRefs(new DBRefEntry[] {
+        ref1,
         ref2, ref3, ref4, ref5 }, target);
-    assertEquals(3, matches.length);
-    assertSame(ref1, matches[0]);
-    assertSame(ref2, matches[1]);
-    assertSame(ref5, matches[2]);
+    assertEquals(3, matches.size());
+    assertSame(ref1, matches.get(0));
+    assertSame(ref2, matches.get(1));
+    assertSame(ref5, matches.get(2));
   }
 
   /**
@@ -224,11 +227,12 @@ public class DBRefUtilsTest
             new int[] { 1, 1 }, 2, 2));
     ref3.setMap(map3);
 
-    DBRefEntry[] matches = DBRefUtils.searchRefs(new DBRefEntry[] { ref1,
+    List<DBRefEntry> matches = DBRefUtils.searchRefs(new DBRefEntry[] {
+        ref1,
         ref2, ref3 }, target);
-    assertEquals(2, matches.length);
-    assertSame(ref1, matches[0]);
-    assertSame(ref2, matches[1]);
+    assertEquals(2, matches.size());
+    assertSame(ref1, matches.get(0));
+    assertSame(ref2, matches.get(1));
   }
 
   /**
@@ -251,11 +255,11 @@ public class DBRefUtilsTest
   
     DBRefEntry[] dbrefs = new DBRefEntry[] { ref1,
         ref2, ref3, ref4, ref5 };
-    DBRefEntry[] matches = DBRefUtils.searchRefs(dbrefs, "A1234");
-    assertEquals(3, matches.length);
-    assertSame(ref1, matches[0]);
-    assertSame(ref2, matches[1]);
-    assertSame(ref5, matches[2]);
+    List<DBRefEntry> matches = DBRefUtils.searchRefs(dbrefs, "A1234");
+    assertEquals(3, matches.size());
+    assertSame(ref1, matches.get(0));
+    assertSame(ref2, matches.get(1));
+    assertSame(ref5, matches.get(2));
   }
 
   /**
@@ -278,12 +282,13 @@ public class DBRefUtilsTest
     ref5.setMap(new Mapping(new MapList(new int[] { 1, 1 }, new int[] { 1,
         1 }, 1, 1)));
   
-    DBRefEntry[] matches = DBRefUtils.searchRefs(new DBRefEntry[] { ref1,
+    List<DBRefEntry> matches = DBRefUtils.searchRefs(new DBRefEntry[] {
+        ref1,
         ref2, ref3, ref4, ref5 }, target);
-    assertEquals(4, matches.length);
-    assertSame(ref1, matches[0]);
-    assertSame(ref2, matches[1]);
-    assertSame(ref3, matches[2]);
-    assertSame(ref5, matches[3]);
+    assertEquals(4, matches.size());
+    assertSame(ref1, matches.get(0));
+    assertSame(ref2, matches.get(1));
+    assertSame(ref3, matches.get(2));
+    assertSame(ref5, matches.get(3));
   }
 }