JAL-1645 Version-Rel Version 2.9 Year-Rel 2015 Licensing glob
[jalview.git] / test / jalview / ws / jabaws / RNAStructExportImport.java
index dc33cbf..745e37d 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
- * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9)
+ * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
  * 
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  * 
@@ -49,6 +49,7 @@ import org.testng.annotations.Test;
 
 import compbio.metadata.WrongParameterException;
 
+
 public class RNAStructExportImport
 {
   public static String testseqs = "examples/RF00031_folded.stk";
@@ -61,7 +62,7 @@ public class RNAStructExportImport
 
   public static jalview.gui.AlignFrame af = null;
 
-  @BeforeClass
+  @BeforeClass(alwaysRun = true)
   public static void setUpBeforeClass() throws Exception
   {
 
@@ -118,7 +119,7 @@ public class RNAStructExportImport
     }
   }
 
-  @Test(groups ={ "Functional" })
+  @Test(groups = { "Functional" })
   public void testRNAAliFoldValidStructure()
   {
 
@@ -138,7 +139,7 @@ public class RNAStructExportImport
     } while (af.getViewport().getCalcManager().isWorking());
 
     AlignmentI orig_alig = af.getViewport().getAlignment();
-    for (AlignmentAnnotation aa:orig_alig.getAlignmentAnnotation())
+    for (AlignmentAnnotation aa : orig_alig.getAlignmentAnnotation())
     {
       if (alifoldClient.involves(aa))
       {
@@ -152,7 +153,7 @@ public class RNAStructExportImport
     }
   }
 
-  @Test(groups ={ "Functional" })
+  @Test(groups = { "Functional" })
   public void testRNAStructExport()
   {
 
@@ -223,7 +224,7 @@ public class RNAStructExportImport
             + "\nCouldn't complete Annotation file roundtrip input/output/input test.");
   }
 
-  @Test(groups ={ "Functional" })
+  @Test(groups = { "Functional" })
   public void testRnaalifoldSettingsRecovery()
   {
     List<compbio.metadata.Argument> opts = new ArrayList<compbio.metadata.Argument>();