git://source.jalview.org / jalview.git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: e7fe72e)
JAL-1645 licencing for doc directory files
authorJim Procter <jprocter@issues.jalview.org>
Thu, 10 Sep 2015 10:00:58 +0000 (11:00 +0100)
committerJim Procter <jprocter@issues.jalview.org>
Thu, 10 Sep 2015 10:06:10 +0000 (11:06 +0100)
doc/AnnotationPostAnalysis.txt patch | blob | history
doc/biojsmsa-templates.html patch | blob | history
doc/developing.html patch | blob | history
doc/i18n.html patch | blob | history
doc/index.html patch | blob | history

diff --git a/doc/AnnotationPostAnalysis.txt b/doc/AnnotationPostAnalysis.txt
index f53533f..8755577 100644 (file)
--- a/doc/AnnotationPostAnalysis.txt
+++ b/doc/AnnotationPostAnalysis.txt
@@ -1,3 +1,23 @@
+##
+# Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+# Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+# 
+# This file is part of Jalview.
+# 
+# Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+# modify it under the terms of the GNU General Public License 
+# as published by the Free Software Foundation, either version 3
+# of the License, or (at your option) any later version.
+#  
+# Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+# WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+# of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+# PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+# 
+# You should have received a copy of the GNU General Public License
+# along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+# The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+##
 Init.
 optimise rendering - use same model as alignment but with vertical binary sweep to select range of annotation to render:
 Vertical interval list
@@ -36,4 +56,4 @@ Sliding window over alignment doing pca at each point. Analyse trajectories thro
 { Desktop -> File, Tools, ... }
 { other areas more distant - e.g. sequence/annotation ID popup from middle of alignment/annotation area }
  
- 
\ No newline at end of file
+ 
diff --git a/doc/biojsmsa-templates.html b/doc/biojsmsa-templates.html
index 40e326d..161c309 100644 (file)
--- a/doc/biojsmsa-templates.html
+++ b/doc/biojsmsa-templates.html
@@ -1,4 +1,24 @@
 <html>
+<!--
+ *Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ *Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ *
+ *This file is part of Jalview.
+ *
+ *Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ *modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ *as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ *of the License, or (at your option) any later version.
+ * 
+ *Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ *WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ *of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ *PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ *
+ *You should have received a copy of the GNU General Public License
+ *along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ *The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+-->
 <title>The BioJS MSA Templating System</title>
 <body>
   <h2>BioJS MSA Templates</h2>
@@ -78,4 +98,4 @@
   </ol>
 
 </body>
-</html>
\ No newline at end of file
+</html>
diff --git a/doc/developing.html b/doc/developing.html
index b7f1d51..bba990e 100644 (file)
--- a/doc/developing.html
+++ b/doc/developing.html
@@ -1,3 +1,23 @@
+<!--
+ *Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ *Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ *
+ *This file is part of Jalview.
+ *
+ *Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ *modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ *as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ *of the License, or (at your option) any later version.
+ * 
+ *Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ *WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ *of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ *PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ *
+ *You should have received a copy of the GNU General Public License
+ *along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ *The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+-->
 <!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
 <!--
  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
diff --git a/doc/i18n.html b/doc/i18n.html
index 46f951d..7b031eb 100644 (file)
--- a/doc/i18n.html
+++ b/doc/i18n.html
@@ -1,3 +1,23 @@
+<!--
+ *Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ *Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ *
+ *This file is part of Jalview.
+ *
+ *Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ *modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ *as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ *of the License, or (at your option) any later version.
+ * 
+ *Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ *WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ *of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ *PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ *
+ *You should have received a copy of the GNU General Public License
+ *along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ *The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+-->
 <!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
 <!--
  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
diff --git a/doc/index.html b/doc/index.html
index 793fd11..54df81a 100644 (file)
--- a/doc/index.html
+++ b/doc/index.html
@@ -1,3 +1,23 @@
+<!--
+ *Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ *Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ *
+ *This file is part of Jalview.
+ *
+ *Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ *modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ *as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ *of the License, or (at your option) any later version.
+ * 
+ *Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ *WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ *of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ *PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ *
+ *You should have received a copy of the GNU General Public License
+ *along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ *The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+-->
 <!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
 <!--
  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)