formatting
authorjprocter <jprocter@compbio.dundee.ac.uk>
Fri, 2 Mar 2012 16:23:28 +0000 (16:23 +0000)
committerjprocter <jprocter@compbio.dundee.ac.uk>
Fri, 2 Mar 2012 16:23:28 +0000 (16:23 +0000)
src/jalview/gui/AppVarna.java

index cbb3f95..7be007a 100644 (file)
@@ -76,7 +76,7 @@ public class AppVarna extends JInternalFrame implements
   public AppVarna(SequenceI seq, String strucseq, String struc,
           String name, AlignmentPanel ap)
   {
-    this.ap=ap;
+    this.ap = ap;
     ArrayList<RNA> rnaList = new ArrayList<RNA>();
     RNA rna1 = new RNA(name);
     try
@@ -304,12 +304,13 @@ public class AppVarna extends JInternalFrame implements
       if (_lastRNAhighlighted != null)
       {
         _lastRNAhighlighted.removeHighlightRegion(_lastHighlight);
-        if (vab!=null) {
+        if (vab != null)
+        {
           vab.updateSelectedRNA(_lastRNAhighlighted);
         }
         _lastRNAhighlighted = null;
         _lastHighlight = null;
-        
+
       }
     }
   }
@@ -404,8 +405,9 @@ public class AppVarna extends JInternalFrame implements
   @Override
   public void onSelectionChanged(BaseList arg0, BaseList arg1, BaseList arg2)
   {
-    // TODO translate selected regions in VARNA to a selection on the alignpanel.
-    
+    // TODO translate selected regions in VARNA to a selection on the
+    // alignpanel.
+
   }
 
 }