JAL-3026 alignmentFrame.statusBar.setText -> .setStatus
authorhansonr <hansonr@STO24954W.ad.stolaf.edu>
Mon, 27 Aug 2018 16:09:53 +0000 (11:09 -0500)
committerhansonr <hansonr@STO24954W.ad.stolaf.edu>
Mon, 27 Aug 2018 16:09:53 +0000 (11:09 -0500)
src/jalview/appletgui/AlignFrame.java
src/jalview/gui/AlignFrame.java
src/jalview/gui/AlignViewport.java
src/jalview/gui/AnnotationPanel.java
src/jalview/gui/CutAndPasteTransfer.java
src/jalview/gui/SeqPanel.java
src/jalview/gui/SequenceFetcher.java
src/jalview/io/FileLoader.java

index 8740f51..6a90bb5 100644 (file)
@@ -416,7 +416,7 @@ public class AlignFrame extends EmbmenuFrame implements ActionListener,
         viewport.featureSettings.refreshTable();
       }
       alignPanel.paintAlignment(true, true);
-      statusBar.setText(MessageManager
+      setStatus(MessageManager
               .getString("label.successfully_added_features_alignment"));
     }
     return featuresFile;
@@ -574,7 +574,7 @@ public class AlignFrame extends EmbmenuFrame implements ActionListener,
 
     case KeyEvent.VK_F2:
       viewport.cursorMode = !viewport.cursorMode;
-      statusBar.setText(MessageManager
+      setStatus(MessageManager
               .formatMessage("label.keyboard_editing_mode", new String[]
               { (viewport.cursorMode ? "on" : "off") }));
       if (viewport.cursorMode)
@@ -2349,7 +2349,7 @@ public class AlignFrame extends EmbmenuFrame implements ActionListener,
                 column, al);
       }
 
-      statusBar.setText(MessageManager
+      setStatus(MessageManager
               .formatMessage("label.removed_columns", new String[]
               { Integer.valueOf(trimRegion.getSize()).toString() }));
       addHistoryItem(trimRegion);
@@ -2393,7 +2393,7 @@ public class AlignFrame extends EmbmenuFrame implements ActionListener,
 
     addHistoryItem(removeGapCols);
 
-    statusBar.setText(MessageManager
+    setStatus(MessageManager
             .formatMessage("label.removed_empty_columns", new String[]
             { Integer.valueOf(removeGapCols.getSize()).toString() }));
 
@@ -3815,7 +3815,7 @@ public class AlignFrame extends EmbmenuFrame implements ActionListener,
      */
     statusBar.setBackground(Color.white);
     statusBar.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
-    statusBar.setText(MessageManager.getString("label.status_bar"));
+    setStatus(MessageManager.getString("label.status_bar"));
     this.add(statusBar, BorderLayout.SOUTH);
   }
 
index 3db81f1..01464fd 100644 (file)
@@ -675,7 +675,7 @@ public class AlignFrame extends GAlignFrame implements DropTargetListener,
 
         case KeyEvent.VK_F2:
           viewport.cursorMode = !viewport.cursorMode;
-          statusBar.setText(MessageManager
+          setStatus(MessageManager
                   .formatMessage("label.keyboard_editing_mode", new String[]
                   { (viewport.cursorMode ? "on" : "off") }));
           if (viewport.cursorMode)
@@ -1204,7 +1204,7 @@ public class AlignFrame extends GAlignFrame implements DropTargetListener,
     else
     {
 
-      statusBar.setText(MessageManager.formatMessage(
+      setStatus(MessageManager.formatMessage(
               "label.successfully_saved_to_file_in_format", new Object[]
               { lastFilenameSaved, lastFormatSaved }));
 
@@ -1275,7 +1275,7 @@ public class AlignFrame extends GAlignFrame implements DropTargetListener,
             out.print(output);
             out.close();
             AlignFrame.this.setTitle(file);
-            statusBar.setText(MessageManager.formatMessage(
+            setStatus(MessageManager.formatMessage(
                     "label.successfully_saved_to_file_in_format",
                     new Object[]
                     { fileName, format.getName() }));
@@ -1938,7 +1938,7 @@ public class AlignFrame extends GAlignFrame implements DropTargetListener,
 
     Desktop.jalviewClipboard = new Object[] { seqs,
         viewport.getAlignment().getDataset(), hiddenColumns };
-    statusBar.setText(MessageManager.formatMessage(
+    setStatus(MessageManager.formatMessage(
             "label.copied_sequences_to_clipboard", new Object[]
             { Integer.valueOf(seqs.length).toString() }));
   }
@@ -2603,7 +2603,7 @@ public class AlignFrame extends GAlignFrame implements DropTargetListener,
                 column, viewport.getAlignment());
       }
 
-      statusBar.setText(MessageManager
+      setStatus(MessageManager
               .formatMessage("label.removed_columns", new String[]
               { Integer.valueOf(trimRegion.getSize()).toString() }));
 
@@ -2653,7 +2653,7 @@ public class AlignFrame extends GAlignFrame implements DropTargetListener,
 
     addHistoryItem(removeGapCols);
 
-    statusBar.setText(MessageManager
+    setStatus(MessageManager
             .formatMessage("label.removed_empty_columns", new Object[]
             { Integer.valueOf(removeGapCols.getSize()).toString() }));
 
@@ -4689,7 +4689,7 @@ public class AlignFrame extends GAlignFrame implements DropTargetListener,
               changeColour(
                       new TCoffeeColourScheme(viewport.getAlignment()));
               isAnnotation = true;
-              statusBar.setText(MessageManager.getString(
+              setStatus(MessageManager.getString(
                       "label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment"));
             }
             else
@@ -4732,7 +4732,7 @@ public class AlignFrame extends GAlignFrame implements DropTargetListener,
                     new FileParse(file, sourceType));
             sm.parse();
             // todo: i18n this message
-            statusBar.setText(MessageManager.formatMessage(
+            setStatus(MessageManager.formatMessage(
                     "label.successfully_loaded_matrix",
                     sm.getMatrixName()));
           }
index 35a0cd3..b357734 100644 (file)
@@ -819,7 +819,7 @@ public class AlignViewport extends AlignmentViewport
     AlignFrame newAlignFrame = new AlignFrame(al, AlignFrame.DEFAULT_WIDTH,
             AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);
     newAlignFrame.setTitle(title);
-    newAlignFrame.statusBar.setText(MessageManager
+    newAlignFrame.setStatus(MessageManager
             .formatMessage("label.successfully_loaded_file", new Object[]
             { title }));
 
index 5c46d95..b6967df 100755 (executable)
@@ -808,7 +808,7 @@ public class AnnotationPanel extends JPanel implements AwtRenderPanelI,
     else
     {
       this.setToolTipText(null);
-      ap.alignFrame.statusBar.setText(" ");
+      ap.alignFrame.setStatus(" ");
     }
   }
 
@@ -927,7 +927,7 @@ public class AnnotationPanel extends JPanel implements AwtRenderPanelI,
       }
     }
 
-    ap.alignFrame.statusBar.setText(text.toString());
+    ap.alignFrame.setStatus(text.toString());
   }
 
   /**
index 142dd75..d328a0d 100644 (file)
@@ -324,7 +324,7 @@ public class CutAndPasteTransfer extends GCutAndPasteTransfer
         af.currentFileFormat = format;
         Desktop.addInternalFrame(af, title, AlignFrame.DEFAULT_WIDTH,
                 AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);
-        af.statusBar.setText(MessageManager
+        af.setStatus(MessageManager
                 .getString("label.successfully_pasted_alignment_file"));
 
         try
index 1d943f0..5eb97e0 100644 (file)
@@ -1025,7 +1025,7 @@ public class SeqPanel extends JPanel
 
       text.append(" (").append(Integer.toString(residuePos)).append(")");
     }
-    ap.alignFrame.statusBar.setText(text.toString());
+    ap.alignFrame.setStatus(text.toString());
   }
 
   /**
@@ -1252,7 +1252,7 @@ public class SeqPanel extends JPanel
     }
 
     message.append(Math.abs(startres - lastres) + " gaps.");
-    ap.alignFrame.statusBar.setText(message.toString());
+    ap.alignFrame.setStatus(message.toString());
 
     // Are we editing within a selection group?
     if (groupEditing || (sg != null
index 7603242..118d877 100755 (executable)
@@ -1036,7 +1036,7 @@ public class SequenceFetcher extends JPanel implements Runnable
         Desktop.addInternalFrame(af, title, AlignFrame.DEFAULT_WIDTH,
                 AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);
 
-        af.statusBar.setText(MessageManager
+        af.setStatus(MessageManager
                 .getString("label.successfully_pasted_alignment_file"));
 
         try
index 4b2f797..dcfdd22 100755 (executable)
@@ -473,7 +473,7 @@ public class FileLoader implements Runnable
               alignFrame.getViewport()
                       .applyFeaturesStyle(proxyColourScheme);
             }
-            alignFrame.statusBar.setText(MessageManager.formatMessage(
+            alignFrame.setStatus(MessageManager.formatMessage(
                     "label.successfully_loaded_file", new String[]
                     { title }));