JAL-2189 JAL-2092 popup show/hide cols with feature docs
authorJim Procter <jprocter@issues.jalview.org>
Thu, 22 Sep 2016 14:01:22 +0000 (15:01 +0100)
committerJim Procter <jprocter@issues.jalview.org>
Thu, 22 Sep 2016 14:01:43 +0000 (15:01 +0100)
help/html/features/featuresettings.html
help/html/releases.html

index 200fc8f..b7738cd 100755 (executable)
   </p>
   <p>
     <strong><em>Feature settings pop-up menu</em></strong><br> <strong>Right-click</strong>
-    on a feature to open a pop-up menu that allows you to sort the
-    alignment or current selection using that feature type (see below),
-    or toggle the type of colouring used for the feature. Features may
-    be highlighted with either a single colour or a <a
-      href="featureschemes.html"
-    >feature colourscheme</a> based on either the scores associated with
-    that feature or from the feature's description (e.g. to distinguish
+    on a feature to open a pop-up menu that allows you to<ul><li>Hide, show and
+    select columns containing that feature</li><li>Sort the alignment or
+    current selection using that feature type (see below)</li><li>Toggle the
+    type of colouring used for the feature</li></ul><p>Features may be highlighted
+    with either a single colour or a <a href="featureschemes.html">feature
+      colourscheme</a> based on either the scores associated with that
+    feature or from the feature's description (e.g. to distinguish
     different names associated with a DOMAIN feature).
   </p>
   <p>
index 475a8da..15873d0 100755 (executable)
             <li><!-- JAL-2202 -->Position/residue shown in status bar when mousing over sequence associated annotation</li>
             <li><!-- JAL-2171 -->Default RNA SS symbol to 'matching bracket' for manual entry</li>
             <li><!-- JAL-2214 -->RNA Structure consensus indicates wc-only '()', canonical '[]' and invalid '{}' base pair populations for each column</li>
+            <li><!-- JAL-2092 -->Feature settings popup menu options for showing or hiding columns containing a feature</li>
         </ul> <em>Application</em>
         <ul>
             <li><!-- JAL---></li>
             <li><!-- JAL---></li>
             <li><!-- JAL---></li>
             <li><!-- JAL---></li>
-            <li><!-- JAL---></li>
             <li><!-- JAL-2079 -->Updated download sites used for Rfam and Pfam sources to xfam.org</li>
             <li><!-- JAL-2084 -->Disabled Rfam(Full) in the sequence fetcher</li>
             <li><!-- JAL-2123 -->Show residue labels in Chimera when mousing over sequences in Jalview</li>
             <li><!--  JAL-1577 -->Colour by RNA Helices not enabled when user created annotation added to alignment</li>
             <li><!-- JAL-1841 -->RNA Structure consensus only computed for '()' base pair annotation</li>
             <li><!-- JAL-2215, JAL-1841 -->Enabling 'Ignore Gaps' results in zero scores for all base pairs in RNA Structure Consensus</li>
+            <li><!-- JAL-2174-->Extend selection with columns containing feature not working</li>
             
             
           </ul>