H key added
authoramwaterhouse <Andrew Waterhouse>
Tue, 15 Aug 2006 11:14:25 +0000 (11:14 +0000)
committeramwaterhouse <Andrew Waterhouse>
Tue, 15 Aug 2006 11:14:25 +0000 (11:14 +0000)
help/html/features/hiddenRegions.html
help/html/keys.html

index 511d80e..27f5682 100644 (file)
@@ -2,6 +2,7 @@
 <head><title>Hidden Regions</title></head>\r
 <body>\r
 <p><strong>Hidden Regions</strong> </p>\r
+<p>Use the keyboard key &quot;H&quot; to hide / reveal selected columns and sequences.</p>\r
 <p>To <strong>hide selected sequences </strong>from an alignment, use the &quot;View \r
   -&gt; Hide -&gt; Selected Sequences&quot; menu item or simply select &quot;Hide \r
   Sequences&quot; from the Popup menu after a right click on the sequence Ids. \r
index 6db5df4..1eefe2b 100755 (executable)
@@ -8,59 +8,88 @@ keyboard operation. The <em>F2</em> key switches between 'Normal' and
 <a href="features/cursorMode.html">'Cursor'</a> mode operation.\r
 </p>\r
 <table border="1">\r
-<tr>\r
-<td><strong>Key</strong></td><td><strong>Which Mode</strong></td><td><strong>Action</strong></td>\r
-</tr>\r
-<!--<tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>Key</strong></td>\r
+    <td><strong>Which Mode</strong></td>\r
+    <td><strong>Action</strong></td>\r
+  </tr>\r
+  <!--<tr>\r
 <td><strong>Escape</strong></td><td>Both</td>\r
 <td>The Panic button.</td></tr>\r
 <tr> -->\r
-<td><strong>\r
-Escape</strong></td><td>Normal</td>\r
-<td>Clears the current selection region,\r
-highlighted columns and highlghted residues.\r
-</td></tr><tr>\r
-<td><strong>Escape</strong></td><td>Cursor</td>\r
-As in normal mode, but also cancels any partially entered commands</td>\r
-</tr>\r
-<tr>\r
-<td><strong><em>F1</em></strong></td><td>Both</td>Show Help Documentation</td></tr>\r
-<tr>\r
-<td><strong><em>F2</em></strong></td><td></td><td>Toggle Cursor mode on / off</td>\r
-</tr>\r
-<tr>\r
-<td><strong>Control 'Z'</strong></td><td>Both</td><td>Undoes the last sequence edit</td>\r
-</tr>\r
-<tr>\r
-<td><strong>Up Arrow</strong></td><td>Normal</td>Moves selected sequence(s) up the\r
-alignment</td></tr>\r
-<tr>\r
-<td><strong>Down Arrow</strong></td><td>Normal</td>Moves selected sequence(s) down the\r
-alignment.</td></tr>\r
-<tr><strong>Cursor Keys<br>(Arrow Keys)</strong></td><td>Cursor</td><td>Move cursor around alignment</td>\r
-</tr>\r
-<tr>\r
-<td><strong>Control 'A'</strong></td><td>Both</td><td>Selects all sequences in the alignment</td>\r
-</tr>\r
-<tr>\r
-<td><strong>Control 'C'</strong></td><td>Both</td><td>Copies the selected region into\r
-the clipboard as a Fasta format file<br><em>nb. not available in applet, as no clipboard is available</em></td>\r
-</tr>\r
-<tr><td><strong>Control 'V'</strong></td><td>Both</td>Pastes the contents of the clipboard\r
-to a new \r
-  alignment window. (same as the Alignment Window menu Edit->Paste\r
-  command)<br><em>nb. if the paste is from a Jalview alignment, any\r
-  sequence and alignment annotations will also be copied over.</em></td>\r
-</tr>\r
-<tr>\r
-<td><strong>Control 'X'</strong></td><td>Both</td><td>Cuts the (fully) selected\r
-sequences from the alignment.<!-- not yet in this version \r
+  <td><strong> Escape</strong></td>\r
+  <td>Normal</td>\r
+  <td>Clears the current selection region, highlighted columns and highlghted \r
+    residues. </td>\r
+  </tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>Escape</strong></td>\r
+    <td>Cursor</td>\r
+    As in normal mode, but also cancels any partially entered commands</td></tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong><em>F1</em></strong></td>\r
+    <td>Both</td>\r
+    Show Help Documentation</td></tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong><em>F2</em></strong></td>\r
+    <td></td>\r
+    <td>Toggle Cursor mode on / off</td>\r
+  </tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>Control 'Z'</strong></td>\r
+    <td>Both</td>\r
+    <td>Undoes the last sequence edit</td>\r
+  </tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>Up Arrow</strong></td>\r
+    <td>Normal</td>\r
+    Moves selected sequence(s) up the alignment</td></tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>Down Arrow</strong></td>\r
+    <td>Normal</td>\r
+    Moves selected sequence(s) down the alignment.</td></tr>\r
+  <tr><strong>Cursor Keys<br>\r
+    (Arrow Keys)</strong></td>\r
+    <td>Cursor</td>\r
+    <td>Move cursor around alignment</td>\r
+  </tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>Control 'A'</strong></td>\r
+    <td>Both</td>\r
+    <td>Selects all sequences in the alignment</td>\r
+  </tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>Control 'C'</strong></td>\r
+    <td>Both</td>\r
+    <td>Copies the selected region into the clipboard as a Fasta format file<br> \r
+      <em>nb. not available in applet, as no clipboard is available</em></td>\r
+  </tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>Control 'V'</strong></td>\r
+    <td>Both</td>\r
+    Pastes the contents of the clipboard to a new alignment window. (same as the \r
+    Alignment Window menu Edit->Paste command)<br>\r
+    <em>nb. if the paste is from a Jalview alignment, any sequence and alignment \r
+    annotations will also be copied over.</em></td></tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>Control 'X'</strong></td>\r
+    <td>Both</td>\r
+    <td>Cuts the (fully) selected sequences from the alignment. \r
+      <!-- not yet in this version \r
 This will not happen if only some\r
-columns are selected, you should use the <a href="features/regionHiding.html">Hide Regions feature</a> instead.--></td>\r
-</tr>\r
-<tr>\r
-<td><strong>Control 'F'</strong></td><td>Both</td><td>Launches the search\r
-window</td></tr>\r
+columns are selected, you should use the <a href="features/regionHiding.html">Hide Regions feature</a> instead.-->\r
+    </td>\r
+  </tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>Control 'F'</strong></td>\r
+    <td>Both</td>\r
+    <td>Launches the search window</td>\r
+  </tr>\r
+  <tr> \r
+    <td><strong>H</strong></td>\r
+    <td>Both</td>\r
+    <td>Hides / Reveals selected columns and sequences</td>\r
+  </tr>\r
 </table>\r
 <p>The compound commands available in the Cursor mode are summarised\r
 below. Single letter commands can be prefixed by digits to specify a repetition\r