git://source.jalview.org / jalview.git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: 37cbc3f)
Edited wiki page GSDI through web user interface.
authorcmzmasek@gmail.com <cmzmasek@gmail.com@ca865154-3058-d1c3-3e42-d8f55a55bdbd>
Fri, 8 Jun 2012 18:52:17 +0000 (18:52 +0000)
committercmzmasek@gmail.com <cmzmasek@gmail.com@ca865154-3058-d1c3-3e42-d8f55a55bdbd>
Fri, 8 Jun 2012 18:52:17 +0000 (18:52 +0000)
wiki/GSDI.wiki patch | blob | history

diff --git a/wiki/GSDI.wiki b/wiki/GSDI.wiki
index 7c2f38c..2d6c3ae 100644 (file)
--- a/wiki/GSDI.wiki
+++ b/wiki/GSDI.wiki
@@ -26,6 +26,10 @@ In phyloXML format (unless option -q is used), with taxonomy data in appropriate
 In phyloXML format, with taxonomy and sequence data in appropriate fields. Must be rooted an binary (no polytomies).
 
 
+== Description ==
+
+Currently, GSDI strips the gene tree of nodes for which a matching species is not present in the species tree. 
+
 == Reference ==
 
 Zmasek CM and Eddy SR "A simple algorithm to infer gene duplication and speciation events on a gene tree" [http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/17/9/821.abstract Bioinformatics, 17, 821-828]