JAL-2416 format matrix more readably
authorgmungoc <g.m.carstairs@dundee.ac.uk>
Tue, 28 Mar 2017 15:40:38 +0000 (16:40 +0100)
committergmungoc <g.m.carstairs@dundee.ac.uk>
Tue, 28 Mar 2017 15:40:38 +0000 (16:40 +0100)
resources/scoreModel/dna.scm

index c490931..0d7cbc1 100644 (file)
@@ -13,17 +13,15 @@ ScoreMatrix DNA
 #
 # Values may be integer or floating point, delimited by tab, space, comma or combinations
 #
-       A       C       G       T       U       I       X       R       Y       N       -
-A      10      -8      -8      -8      -8      1       1       1       -8      1       1 
-C      -8      10      -8      -8      -8      1       1       -8      1       1       1
-G      -8      -8      10      -8      -8      1       1       1       -8      1       1
-T      -8      -8      -8      10      10      1       1       -8      1       1       1
-U      -8      -8      -8      10      10      1       1       -8      1       1       1
-I      1       1       1       1       1       10      0       0       0       1       1
-X      1       1       1       1       1       0       10      0       0       1       1
-R      1       -8      1       -8      -8      0       0       10      -8      1       1
-Y      -8      1       -8      1       1       0       0       -8      10      1       1
-N      1       1       1       1       1       1       1       1       1       10      1
--      1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
-#
-#      A       C       G       T       U       I       X       R       Y       N               -
+        A       C       G       T       U       I       X       R       Y       N      -
+A      10      -8      -8      -8      -8       1       1       1      -8       1      1 
+C      -8      10      -8      -8      -8       1       1      -8       1       1      1
+G      -8      -8      10      -8      -8       1       1       1      -8       1      1
+T      -8      -8      -8      10      10       1       1      -8       1       1      1
+U      -8      -8      -8      10      10       1       1      -8       1       1      1
+I       1       1       1       1       1      10       0       0       0       1      1
+X       1       1       1       1       1       0      10       0       0       1      1
+R       1      -8       1      -8      -8       0       0      10      -8       1      1
+Y      -8       1      -8       1       1       0       0      -8      10       1      1
+N       1       1       1       1       1       1       1       1       1      10      1
+-       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1      1