Edited wiki page RIO through web user interface.
authorcmzmasek@gmail.com <cmzmasek@gmail.com@ca865154-3058-d1c3-3e42-d8f55a55bdbd>
Wed, 12 Dec 2012 05:08:54 +0000 (05:08 +0000)
committercmzmasek@gmail.com <cmzmasek@gmail.com@ca865154-3058-d1c3-3e42-d8f55a55bdbd>
Wed, 12 Dec 2012 05:08:54 +0000 (05:08 +0000)
wiki/RIO.wiki

index 107deca..e9ca2dd 100644 (file)
@@ -19,7 +19,7 @@ java -Xmx2048m -cp forester.jar org.forester.application.rio [options] <gene tre
   
 ==== Gene trees ====
 The gene trees ideally are in [http://www.biomedcentral.com/1471-2105/10/356/ phyloXML] format, with taxonomy and sequence data in appropriate fields; but can also be in New Hamphshire (Newick) or Nexus format, as long as species information can be extracted from the gene names (e.g. "HUMAN" from "BCL2_HUMAN") ([http://forester.googlecode.com/files/gene_trees_rio.nh example]).
-All gene trees must be completely binary.
+All gene trees must be *completely binary*.
 
 
 ==== Species tree ====