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authorcmzmasek@gmail.com <cmzmasek@gmail.com@ca865154-3058-d1c3-3e42-d8f55a55bdbd>
Fri, 29 Jun 2012 19:37:42 +0000 (19:37 +0000)
committercmzmasek@gmail.com <cmzmasek@gmail.com@ca865154-3058-d1c3-3e42-d8f55a55bdbd>
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index 8c611d8..cf2ec2f 100644 (file)
@@ -35,7 +35,7 @@ Besides the main output of a gene tree with duplications and speciations assigne
   * if the gene tree contains species with scientific species names such as "Pyrococcus horikoshii strain ATCC 700860" and if a mapping cannot be establish bases on these, GSDI will attempt to map by removing the "strain" (or "subspecies") information, these will be listed in a file ending in `"_gsdi_remapped.txt"`.
 
 === Example ===
-`gsdi -g -q gene_tree.xml tree_of_life.xml out.xml`
+`gsdi -g -q gene_tree.xml tree_of_life.nwk out.xml`