rio

diff --git a/forester/test_data/rio_Bcl-2_e1_20_mafft_05_40_fme.mlt b/forester/test_data/rio_Bcl-2_e1_20_mafft_05_40_fme.mlt
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+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.6083</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">97.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>1_PRIPA</name>\r
+                                            <branch_length>0.65812</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>PRIPA</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.51954</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>1_CAEBR</name>\r
+                                              <branch_length>0.03136</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>CAEBR</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>1_CAEEL</name>\r
+                                              <branch_length>0.14764</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>CAEEL</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>1_CIOIN</name>\r
+                                          <branch_length>0.64734</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>CIOIN</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <branch_length>0.2911</branch_length>\r
+                                      <confidence type="bootstrap">1.0</confidence>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.20168</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">2.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.3299</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">37.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.03716</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">4.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.04973</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">7.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.37453</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">97.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">29.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.12622</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">83.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.01607</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">68.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.01051</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">41.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>9_ANOCA</name>\r
+                                                          <branch_length>0.05093</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>ANOCA</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">35.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>8_CHICK</name>\r
+                                                            <branch_length>0.03048</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>CHICK</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>2_TAEGU</name>\r
+                                                            <branch_length>0.01005</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>TAEGU</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.01007</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">73.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>4_ORNAN</name>\r
+                                                          <branch_length>0.0105</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>ORNAN</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>7_MONDO</name>\r
+                                                          <branch_length>0.0197</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>MONDO</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.06719</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">85.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>3_FELCA</name>\r
+                                                        <branch_length>0.03096</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>FELCA</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.01007</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">54.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">34.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <branch_length>0.03987</branch_length>\r
+                                                            <confidence type="bootstrap">70.0</confidence>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>0.0084</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">50.0</confidence>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                <confidence type="bootstrap">82.0</confidence>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <name>4_RAT</name>\r
+                                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                  <taxonomy>\r
+                                                                    <code>RAT</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <name>10_MOUSE</name>\r
+                                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                  <taxonomy>\r
+                                                                    <code>MOUSE</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>2_CAVPO</name>\r
+                                                                <branch_length>0.03099</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>CAVPO</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <name>1B_HUMAN</name>\r
+                                                              <branch_length>0.01357</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>HUMAN</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>5_RAT</name>\r
+                                                            <branch_length>0.34153</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>RAT</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>10_BOVIN</name>\r
+                                                          <branch_length>0.03087</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>BOVIN</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.08788</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.02075</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">58.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.01141</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">61.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.02431</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">83.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>9_TETNG</name>\r
+                                                            <branch_length>0.01012</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>TETNG</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <branch_length>0.04695</branch_length>\r
+                                                            <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <name>F_FUGRU</name>\r
+                                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>FUGRU</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <name>E_FUGRU</name>\r
+                                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>FUGRU</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.02004</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">90.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>7_GASAC</name>\r
+                                                            <branch_length>0.03089</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>GASAC</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                            <confidence type="bootstrap">41.0</confidence>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <name>9_GASAC</name>\r
+                                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>GASAC</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <name>8_GASAC</name>\r
+                                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>GASAC</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>9_ORYLA</name>\r
+                                                        <branch_length>0.05164</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>ORYLA</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>B_DANRE</name>\r
+                                                      <branch_length>0.0111</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>DANRE</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.06515</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">40.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.15073</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.03533</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">65.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>5_GASAC</name>\r
+                                                        <branch_length>0.03221</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>GASAC</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.02025</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">91.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>1_TETNG</name>\r
+                                                          <branch_length>0.02019</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>TETNG</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.01077</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">96.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>C_FUGRU</name>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>FUGRU</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>D_FUGRU</name>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>FUGRU</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.06436</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>4_ORYLA</name>\r
+                                                        <branch_length>0.01131</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>ORYLA</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>5_ORYLA</name>\r
+                                                        <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>ORYLA</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>8_DANRE</name>\r
+                                                    <branch_length>0.18672</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>DANRE</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.06704</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">6.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.07452</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">8.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.21511</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">32.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.26878</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">76.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.04773</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">59.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.25645</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>1_NASVI</name>\r
+                                                            <branch_length>0.34539</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>NASVI</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>2_APIME</name>\r
+                                                            <branch_length>0.06441</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>APIME</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>1_TRICA</name>\r
+                                                          <branch_length>0.52909</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>TRICA</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.18131</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">55.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.08821</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">51.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <branch_length>0.0582</branch_length>\r
+                                                            <confidence type="bootstrap">48.0</confidence>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>0.06416</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>1_AEDAE</name>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>AEDAE</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>2_CULPI</name>\r
+                                                                <branch_length>0.06272</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>CULPI</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>0.2608</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>2_DROME</name>\r
+                                                                <branch_length>0.03968</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>DROME</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>1_DROPS</name>\r
+                                                                <branch_length>0.00373</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>DROPS</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <branch_length>0.17013</branch_length>\r
+                                                            <confidence type="bootstrap">89.0</confidence>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>0.25817</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>2_DROPS</name>\r
+                                                                <branch_length>0.05776</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>DROPS</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>1_DROME</name>\r
+                                                                <branch_length>0.00612</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>DROME</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
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+                                                            </clade>\r
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+                                                              <branch_length>0.18595</branch_length>\r
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+                                                                <name>1_ANOGA</name>\r
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+                                                                  <code>ANOGA</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
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+                                                                <branch_length>0.055</branch_length>\r
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+                                                                    <code>AEDAE</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <name>1_CULPI</name>\r
+                                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                  <taxonomy>\r
+                                                                    <code>CULPI</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>1_ACYPI</name>\r
+                                                          <branch_length>0.56903</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>ACYPI</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>1_IXOSC</name>\r
+                                                      <branch_length>0.24861</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>IXOSC</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>3_STRPU</name>\r
+                                                    <branch_length>0.65071</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>STRPU</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.02187</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">2.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.11346</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">3.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.30588</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">73.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>2_HELRO</name>\r
+                                                        <branch_length>0.51111</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>HELRO</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>8_HELRO</name>\r
+                                                        <branch_length>0.52865</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>HELRO</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">10.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.16696</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">41.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>7_CAP</name>\r
+                                                          <branch_length>0.39103</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>CAP</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.75729</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>4_LOTGI</name>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>LOTGI</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>3_LOTGI</name>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>LOTGI</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.22083</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">60.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.51631</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>1_CIOSA</name>\r
+                                                            <branch_length>0.06618</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>CIOSA</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>2_CIOIN</name>\r
+                                                            <branch_length>0.16174</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>CIOIN</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>4_CIOIN</name>\r
+                                                          <branch_length>0.45097</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>CIOIN</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.13638</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">32.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>A_STRPU</name>\r
+                                                      <branch_length>0.47454</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>STRPU</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>7_BRAFL</name>\r
+                                                      <branch_length>0.35386</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>BRAFL</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.24217</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">18.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>B_HYDMA</name>\r
+                                                <branch_length>0.71234</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>HYDMA</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>4_SACKO</name>\r
+                                                <branch_length>0.38661</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>SACKO</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.08445</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">5.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.14947</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">13.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.99928</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>7_HYDMA</name>\r
+                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>HYDMA</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>6_HYDMA</name>\r
+                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>HYDMA</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.02601</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">29.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.51274</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>4_NEMVE</name>\r
+                                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>NEMVE</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>A_NEMVE</name>\r
+                                                    <branch_length>0.03658</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>NEMVE</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.56095</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>7_NEMVE</name>\r
+                                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>NEMVE</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>6_NEMVE</name>\r
+                                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>NEMVE</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.1649</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">52.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>1_NEMVE</name>\r
+                                                <branch_length>0.42729</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>NEMVE</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>C_HYDMA</name>\r
+                                                <branch_length>0.67211</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>HYDMA</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.22185</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">12.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.16002</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">10.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.00734</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">4.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.22209</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">8.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>1.9E-4</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">7.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.2003</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">31.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.13403</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">79.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.14352</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">57.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>2_XENTR</name>\r
+                                                          <branch_length>0.15708</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>XENTR</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.07629</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">35.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <branch_length>0.19381</branch_length>\r
+                                                            <confidence type="bootstrap">85.0</confidence>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>0.00949</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">50.0</confidence>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <branch_length>0.02726</branch_length>\r
+                                                                <confidence type="bootstrap">20.0</confidence>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <branch_length>0.01978</branch_length>\r
+                                                                  <confidence type="bootstrap">21.0</confidence>\r
+                                                                  <clade>\r
+                                                                    <branch_length>0.01065</branch_length>\r
+                                                                    <confidence type="bootstrap">16.0</confidence>\r
+                                                                    <clade>\r
+                                                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                      <confidence type="bootstrap">17.0</confidence>\r
+                                                                      <clade>\r
+                                                                        <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                        <confidence type="bootstrap">33.0</confidence>\r
+                                                                        <clade>\r
+                                                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                          <confidence type="bootstrap">30.0</confidence>\r
+                                                                          <clade>\r
+                                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                            <confidence type="bootstrap">45.0</confidence>\r
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+                                                                              <branch_length>0.04675</branch_length>\r
+                                                                              <confidence type="bootstrap">56.0</confidence>\r
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+                                                                            </taxonomy>\r
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+                                                                        </clade>\r
+                                                                        <clade>\r
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+                                                                        </taxonomy>\r
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+                                                                        </taxonomy>\r
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+                                                                <clade>\r
+                                                                  <name>D_MONDO</name>\r
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+                                                                    <code>MONDO</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
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+                                                              </clade>\r
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+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
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+                                                                  </taxonomy>\r
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+                                                                <clade>\r
+                                                                  <branch_length>0.01068</branch_length>\r
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+                                                                  <clade>\r
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+                                                                      <code>RAT</code>\r
+                                                                    </taxonomy>\r
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+                                                                <code>RAT</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
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+                                                              <branch_length>0.10122</branch_length>\r
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+                                                                <code>TAEGU</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
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+                                                                <code>ANOCA</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
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+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.15885</branch_length>\r
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+                                                            <confidence type="bootstrap">55.0</confidence>\r
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+                                                              <name>1_ORYLA</name>\r
+                                                              <branch_length>0.18148</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>ORYLA</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>0.02447</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">99.0</confidence>\r
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+                                                                <name>2_GASAC</name>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>GASAC</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>3_GASAC</name>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>GASAC</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
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+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>14_FUGRU</name>\r
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+                                                              <code>FUGRU</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>A_DANRE</name>\r
+                                                          <branch_length>0.17072</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>DANRE</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>9_DANRE</name>\r
+                                                      <branch_length>0.88947</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>DANRE</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.05174</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">14.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.24925</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">55.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>2_NEMVE</name>\r
+                                                        <branch_length>0.22976</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>NEMVE</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>3_TRIAD</name>\r
+                                                        <branch_length>0.47884</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>TRIAD</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.08448</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">59.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.09925</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">70.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>2_LOTGI</name>\r
+                                                          <branch_length>0.33494</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>LOTGI</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.3076</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>1_CAP</name>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>CAP</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>D_CAP</name>\r
+                                                            <branch_length>0.01053</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>CAP</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.19263</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">81.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.26</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">97.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>3_SACKO</name>\r
+                                                            <branch_length>0.19116</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>SACKO</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>4_STRPU</name>\r
+                                                            <branch_length>0.32262</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>STRPU</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>3_CIOIN</name>\r
+                                                          <branch_length>0.33154</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>CIOIN</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.3287</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.12982</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">91.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>B_GASAC</name>\r
+                                                      <branch_length>0.1257</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>GASAC</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.0717</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">96.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>7_TETNG</name>\r
+                                                        <branch_length>0.0279</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>TETNG</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>1_FUGRU</name>\r
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+                                                          <code>FUGRU</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
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+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
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+                                                    <name>C_DANRE</name>\r
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+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.34116</branch_length>\r
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+                                                            <code>HELRO</code>\r
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+                                                        </clade>\r
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+                                                            <code>CAP</code>\r
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+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>BRAFL</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
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+                                                          <clade>\r
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+                                                            <code>STRPU</code>\r
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+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>A_MONDO</name>\r
+                                                            <branch_length>0.05225</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>MONDO</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.06414</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">96.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>7_ANOCA</name>\r
+                                                            <branch_length>0.09294</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>ANOCA</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <branch_length>0.10711</branch_length>\r
+                                                            <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <name>3_CHICK</name>\r
+                                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>CHICK</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <name>4_CHICK</name>\r
+                                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>CHICK</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>7_XENTR</name>\r
+                                                        <branch_length>0.38981</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>XENTR</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.06602</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">5.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>9_HELRO</name>\r
+                                                      <branch_length>0.48299</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>HELRO</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.0536</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">13.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.09304</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">35.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">36.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>8_NEMVE</name>\r
+                                                            <branch_length>0.25592</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>NEMVE</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>9_HYDMA</name>\r
+                                                            <branch_length>0.30348</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>HYDMA</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>8_HYDMA</name>\r
+                                                          <branch_length>0.68393</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>HYDMA</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>1_LOTGI</name>\r
+                                                        <branch_length>0.35219</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>LOTGI</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.15084</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">22.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>5_SCHMA</name>\r
+                                                    <branch_length>0.82449</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>SCHMA</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>5_SACKO</name>\r
+                                                    <branch_length>0.07545</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>SACKO</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.29833</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">23.0</confidence>\r
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+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>SCHMA</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>5_ANOCA</name>\r
+                                                  <branch_length>0.71231</branch_length>\r
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+                                                    <code>ANOCA</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.16588</branch_length>\r
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+                                                <confidence type="bootstrap">88.0</confidence>\r
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+                                                    <clade>\r
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+                                                          <branch_length>0.16515</branch_length>\r
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+                                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                  <confidence type="bootstrap">64.0</confidence>\r
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+                                                                    <branch_length>0.03294</branch_length>\r
+                                                                    <confidence type="bootstrap">99.0</confidence>\r
+                                                                    <clade>\r
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+                                                                  </clade>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <name>F_BOVIN</name>\r
+                                                                  <branch_length>0.1588</branch_length>\r
+                                                                  <taxonomy>\r
+                                                                    <code>BOVIN</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <branch_length>0.03698</branch_length>\r
+                                                                <confidence type="bootstrap">54.0</confidence>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <branch_length>0.08346</branch_length>\r
+                                                                  <confidence type="bootstrap">99.0</confidence>\r
+                                                                  <clade>\r
+                                                                    <name>9_MOUSE</name>\r
+                                                                    <branch_length>0.06287</branch_length>\r
+                                                                    <taxonomy>\r
+                                                                      <code>MOUSE</code>\r
+                                                                    </taxonomy>\r
+                                                                  </clade>\r
+                                                                  <clade>\r
+                                                                    <name>12_RAT</name>\r
+                                                                    <branch_length>0.06033</branch_length>\r
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+                                                                      <code>RAT</code>\r
+                                                                    </taxonomy>\r
+                                                                  </clade>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <name>5_CAVPO</name>\r
+                                                                  <branch_length>0.07608</branch_length>\r
+                                                                  <taxonomy>\r
+                                                                    <code>CAVPO</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <name>1_ORNAN</name>\r
+                                                              <branch_length>0.16296</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>ORNAN</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
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+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>0.15304</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>3_MONDO</name>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>MONDO</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>4_MONDO</name>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>MONDO</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>0.05677</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">73.0</confidence>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <branch_length>0.03226</branch_length>\r
+                                                                <confidence type="bootstrap">92.0</confidence>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <name>B_CHICK</name>\r
+                                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                  <taxonomy>\r
+                                                                    <code>CHICK</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <name>5_TAEGU</name>\r
+                                                                  <branch_length>0.03176</branch_length>\r
+                                                                  <taxonomy>\r
+                                                                    <code>TAEGU</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>4_ANOCA</name>\r
+                                                                <branch_length>0.11274</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>ANOCA</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.40052</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>5_XENTR</name>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>XENTR</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>6_XENTR</name>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>XENTR</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.1668</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">84.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>2_ORYLA</name>\r
+                                                          <branch_length>0.28798</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>ORYLA</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>5_DANRE</name>\r
+                                                          <branch_length>0.28675</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>DANRE</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.12907</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">47.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>7_HELRO</name>\r
+                                                        <branch_length>0.76642</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>HELRO</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>3_CAP</name>\r
+                                                        <branch_length>0.51598</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>CAP</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.21701</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">59.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.17935</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">63.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.60274</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>5_STRPU</name>\r
+                                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>STRPU</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>2_STRPU</name>\r
+                                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>STRPU</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>6_SACKO</name>\r
+                                                        <branch_length>0.31265</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>SACKO</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>8_CAP</name>\r
+                                                      <branch_length>0.93759</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>CAP</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>C_NEMVE</name>\r
+                                                  <branch_length>0.86569</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>NEMVE</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.51972</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">83.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>5_AMPQU</name>\r
+                                                  <branch_length>0.63334</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>AMPQU</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>7_AMPQU</name>\r
+                                                  <branch_length>0.75344</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>AMPQU</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.51433</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">55.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>1.01387</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>3_BRAFL</name>\r
+                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>BRAFL</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>6_BRAFL</name>\r
+                                                <branch_length>0.039</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>BRAFL</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.20328</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">74.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.03301</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">65.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>7_LOTGI</name>\r
+                                                  <branch_length>0.54356</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>LOTGI</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.14734</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">58.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>1_STRPU</name>\r
+                                                    <branch_length>0.52648</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>STRPU</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>1_SACKO</name>\r
+                                                    <branch_length>0.09572</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>SACKO</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.20614</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">42.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>1_DAPPU</name>\r
+                                                  <branch_length>0.6367</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>DAPPU</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>3_IXOSC</name>\r
+                                                  <branch_length>0.70159</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>IXOSC</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.14682</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">1.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.0929</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">1.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.1176</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">6.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.14143</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">26.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.42703</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">98.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.22762</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">85.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>6_MONDO</name>\r
+                                                    <branch_length>0.17995</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>MONDO</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.02937</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">44.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.1469</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">90.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.02576</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">45.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.05125</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                            <confidence type="bootstrap">97.0</confidence>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">99.0</confidence>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>9_PANTR</name>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>PANTR</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>16_HUMAN</name>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>HUMAN</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <name>8_PANTR</name>\r
+                                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>PANTR</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>15_HUMAN</name>\r
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+                                                              <code>HUMAN</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
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+                                                        </clade>\r
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+                                                            <branch_length>0.08631</branch_length>\r
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+                                                              <branch_length>0.02947</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">82.0</confidence>\r
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+                                                                <name>4_MOUSE</name>\r
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+                                                                  <code>MOUSE</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
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+                                                                    <code>MOUSE</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                                <clade>\r
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+                                                                      <code>MOUSE</code>\r
+                                                                    </taxonomy>\r
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+                                                              <branch_length>0.00934</branch_length>\r
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+                                                                <name>7_RAT</name>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
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+                                                                  <code>RAT</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>8_RAT</name>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
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+                                                                  <code>RAT</code>\r
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+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>6_CAVPO</name>\r
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+                                                              <code>CAVPO</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
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+                                                        <branch_length>0.05746</branch_length>\r
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+                                                            <branch_length>0.11489</branch_length>\r
+                                                            <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
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+                                                              <name>8_CANFA</name>\r
+                                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                              <taxonomy>\r
+                                                                <code>CANFA</code>\r
+                                                              </taxonomy>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <name>9_CANFA</name>\r
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+                                                              </taxonomy>\r
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+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <name>2_FELCA</name>\r
+                                                            <branch_length>0.08719</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>FELCA</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>4_BOVIN</name>\r
+                                                          <branch_length>0.15458</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>BOVIN</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>3_ORNAN</name>\r
+                                                      <branch_length>0.24371</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>ORNAN</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.00817</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">64.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>3_ANOCA</name>\r
+                                                    <branch_length>0.27284</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>ANOCA</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.27395</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>7_CHICK</name>\r
+                                                      <branch_length>0.03186</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>CHICK</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>4_TAEGU</name>\r
+                                                      <branch_length>0.04953</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>TAEGU</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>3_HELRO</name>\r
+                                                <branch_length>0.56794</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>HELRO</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.21479</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">42.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.37236</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">88.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.23374</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.07538</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">75.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.11045</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">93.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.095</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">85.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <branch_length>0.00385</branch_length>\r
+                                                          <confidence type="bootstrap">43.0</confidence>\r
+                                                          <clade>\r
+                                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                            <confidence type="bootstrap">43.0</confidence>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>0.01044</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">44.0</confidence>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <branch_length>0.06989</branch_length>\r
+                                                                <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <name>A_BOVIN</name>\r
+                                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                  <taxonomy>\r
+                                                                    <code>BOVIN</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                                <clade>\r
+                                                                  <name>9_BOVIN</name>\r
+                                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                  <taxonomy>\r
+                                                                    <code>BOVIN</code>\r
+                                                                  </taxonomy>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <name>6_BOVIN</name>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                                <taxonomy>\r
+                                                                  <code>BOVIN</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
+                                                              </clade>\r
+                                                            </clade>\r
+                                                            <clade>\r
+                                                              <branch_length>0.00912</branch_length>\r
+                                                              <confidence type="bootstrap">31.0</confidence>\r
+                                                              <clade>\r
+                                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
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+                                                                  <branch_length>0.0196</branch_length>\r
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+                                                                    <confidence type="bootstrap">65.0</confidence>\r
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+                                                                      <name>D_PANTR</name>\r
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+                                                                      <taxonomy>\r
+                                                                        <code>PANTR</code>\r
+                                                                      </taxonomy>\r
+                                                                    </clade>\r
+                                                                    <clade>\r
+                                                                      <name>1D_HUMAN</name>\r
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+                                                                  </clade>\r
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+                                                                    </taxonomy>\r
+                                                                  </clade>\r
+                                                                </clade>\r
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+                                                                  <branch_length>0.02281</branch_length>\r
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+                                                                        <code>RAT</code>\r
+                                                                      </taxonomy>\r
+                                                                    </clade>\r
+                                                                    <clade>\r
+                                                                      <name>C_RAT</name>\r
+                                                                      <branch_length>0.18742</branch_length>\r
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+                                                                      </taxonomy>\r
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+                                                                  </clade>\r
+                                                                  <clade>\r
+                                                                    <name>B_MOUSE</name>\r
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+                                                                      <code>MOUSE</code>\r
+                                                                    </taxonomy>\r
+                                                                  </clade>\r
+                                                                </clade>\r
+                                                              </clade>\r
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+                                                                <name>4_CANFA</name>\r
+                                                                <branch_length>0.00981</branch_length>\r
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+                                                                  <code>CANFA</code>\r
+                                                                </taxonomy>\r
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+                                                            </clade>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                          <clade>\r
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+                                                            <branch_length>0.01247</branch_length>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <code>FELCA</code>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>7_CAVPO</name>\r
+                                                          <branch_length>0.058</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>CAVPO</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>C_MONDO</name>\r
+                                                        <branch_length>0.03845</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>MONDO</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.09591</branch_length>\r
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+                                                        <name>2_ANOCA</name>\r
+                                                        <branch_length>0.2116</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>ANOCA</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.15607</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>2_CHICK</name>\r
+                                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>CHICK</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>1_CHICK</name>\r
+                                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>CHICK</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.36692</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>9_XENTR</name>\r
+                                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>XENTR</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>8_XENTR</name>\r
+                                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>XENTR</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.32863</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.06444</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">54.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.3335</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>4_DANRE</name>\r
+                                                        <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>DANRE</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>3_DANRE</name>\r
+                                                        <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>DANRE</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>7_DANRE</name>\r
+                                                      <branch_length>0.30119</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>DANRE</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.24728</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">98.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.06025</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">85.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>8_FUGRU</name>\r
+                                                        <branch_length>0.11951</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>FUGRU</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>8_TETNG</name>\r
+                                                        <branch_length>0.20312</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>TETNG</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.05869</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">55.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>3_ORYLA</name>\r
+                                                        <branch_length>0.25584</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>ORYLA</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>A_GASAC</name>\r
+                                                        <branch_length>0.10185</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>GASAC</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>6_HELRO</name>\r
+                                                <branch_length>0.21274</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>HELRO</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.14038</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">18.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.43798</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">52.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.28609</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">87.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.65063</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.21252</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">49.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.13503</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">49.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.1815</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>7_PANTR</name>\r
+                                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>PANTR</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>14_HUMAN</name>\r
+                                                          <branch_length>0.01097</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>HUMAN</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>8_CAVPO</name>\r
+                                                        <branch_length>0.67384</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>CAVPO</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.03734</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">44.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <branch_length>0.44798</branch_length>\r
+                                                        <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>2_BOVIN</name>\r
+                                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>BOVIN</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <name>B_BOVIN</name>\r
+                                                          <branch_length>0.01105</branch_length>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <code>BOVIN</code>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>7_FELCA</name>\r
+                                                        <branch_length>0.27983</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>FELCA</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.23041</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>2_MOUSE</name>\r
+                                                      <branch_length>0.28947</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>MOUSE</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>6_RAT</name>\r
+                                                      <branch_length>0.07258</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>RAT</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>9_MONDO</name>\r
+                                                  <branch_length>0.41517</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>MONDO</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.48089</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>6_DANRE</name>\r
+                                                  <branch_length>0.28032</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>DANRE</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.14953</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">97.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.00431</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">54.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>0.03421</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">46.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>4_TETNG</name>\r
+                                                        <branch_length>0.11146</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>TETNG</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>9_FUGRU</name>\r
+                                                        <branch_length>0.08347</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>FUGRU</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>C_GASAC</name>\r
+                                                      <branch_length>0.07308</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>GASAC</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>A_ORYLA</name>\r
+                                                    <branch_length>0.32477</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>ORYLA</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.52107</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>D_HYDMA</name>\r
+                                                <branch_length>0.02771</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>HYDMA</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.03633</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">95.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>5_HYDMA</name>\r
+                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>HYDMA</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>4_HYDMA</name>\r
+                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>HYDMA</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.22198</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">11.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.24375</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">61.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.25551</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">93.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>6_CAP</name>\r
+                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>CAP</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>C_CAP</name>\r
+                                                <branch_length>0.01739</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>CAP</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>9_CAP</name>\r
+                                              <branch_length>0.96202</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>CAP</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.80816</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>1_AMPQU</name>\r
+                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>AMPQU</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>2_AMPQU</name>\r
+                                              <branch_length>0.08018</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>AMPQU</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.31261</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">14.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>2_DAPPU</name>\r
+                                            <branch_length>0.77895</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>DAPPU</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>1_SCHMA</name>\r
+                                            <branch_length>1.01618</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>SCHMA</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.10278</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">1.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.3484</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">37.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.45469</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">97.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.22687</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>A_CAP</name>\r
+                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>CAP</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>2_CAP</name>\r
+                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>CAP</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>1_HELRO</name>\r
+                                              <branch_length>0.74601</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>HELRO</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>4_CAP</name>\r
+                                            <branch_length>0.73418</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>CAP</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.05482</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">2.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.05248</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">7.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>0.17293</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">25.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>9_NEMVE</name>\r
+                                                <branch_length>0.4809</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>NEMVE</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>B_NEMVE</name>\r
+                                                <branch_length>0.35322</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>NEMVE</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">8.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.08521</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">14.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.11271</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">31.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.12005</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">53.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>1_APIME</name>\r
+                                                      <branch_length>0.68149</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>APIME</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>6_LOTGI</name>\r
+                                                      <branch_length>0.37605</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>LOTGI</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <branch_length>0.34905</branch_length>\r
+                                                    <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                      <confidence type="bootstrap">50.0</confidence>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>8_BRAFL</name>\r
+                                                        <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>BRAFL</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>9_BRAFL</name>\r
+                                                        <branch_length>0.0995</branch_length>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <code>BRAFL</code>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <name>5_BRAFL</name>\r
+                                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <code>BRAFL</code>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>0.3377</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">99.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>8_SACKO</name>\r
+                                                    <branch_length>0.26008</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>SACKO</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>6_STRPU</name>\r
+                                                    <branch_length>0.43295</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>STRPU</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>0.14318</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">49.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>2_HYDMA</name>\r
+                                                  <branch_length>0.49357</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>HYDMA</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>D_NEMVE</name>\r
+                                                  <branch_length>0.29458</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>NEMVE</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.37798</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">39.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>3_AMPQU</name>\r
+                                              <branch_length>0.78089</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>AMPQU</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>E_HYDMA</name>\r
+                                              <branch_length>0.56876</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>HYDMA</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.21821</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">4.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>1_TRIAD</name>\r
+                                          <branch_length>0.92934</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>TRIAD</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.21916</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">23.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>1_HYDMA</name>\r
+                                            <branch_length>0.66723</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>HYDMA</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>4_AMPQU</name>\r
+                                            <branch_length>0.86981</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>AMPQU</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <branch_length>0.10013</branch_length>\r
+                                      <confidence type="bootstrap">7.0</confidence>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.10833</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">25.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.1436</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">87.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.28152</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>3_HYDMA</name>\r
+                                              <branch_length>0.21449</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>HYDMA</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>A_HYDMA</name>\r
+                                              <branch_length>0.03322</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>HYDMA</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>3_NEMVE</name>\r
+                                            <branch_length>0.32511</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>NEMVE</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>2_TRIAD</name>\r
+                                          <branch_length>0.4979</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>TRIAD</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>5_NEMVE</name>\r
+                                        <branch_length>0.54941</branch_length>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <code>NEMVE</code>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>2_IXOSC</name>\r
+                                    <branch_length>0.59258</branch_length>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <code>IXOSC</code>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                  <confidence type="bootstrap">10.0</confidence>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <branch_length>2.5E-4</branch_length>\r
+                                    <confidence type="bootstrap">33.0</confidence>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <branch_length>0.10151</branch_length>\r
+                                      <confidence type="bootstrap">24.0</confidence>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.07251</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">36.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.04957</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">52.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>2_SACKO</name>\r
+                                            <branch_length>0.1822</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>SACKO</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>1_BRAFL</name>\r
+                                            <branch_length>0.3735</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>BRAFL</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>B_CAP</name>\r
+                                          <branch_length>0.2093</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>CAP</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>4_HELRO</name>\r
+                                        <branch_length>0.32079</branch_length>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <code>HELRO</code>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>5_LOTGI</name>\r
+                                      <branch_length>0.32505</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>LOTGI</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>8_STRPU</name>\r
+                                    <branch_length>0.70633</branch_length>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <code>STRPU</code>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>5_MONDO</name>\r
+                                <branch_length>1.25971</branch_length>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <code>MONDO</code>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <branch_length>0.23147</branch_length>\r
+                              <confidence type="bootstrap">99.0</confidence>\r
+                              <clade>\r
+                                <branch_length>0.06794</branch_length>\r
+                                <confidence type="bootstrap">96.0</confidence>\r
+                                <clade>\r
+                                  <branch_length>0.056</branch_length>\r
+                                  <confidence type="bootstrap">70.0</confidence>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <branch_length>0.05853</branch_length>\r
+                                    <confidence type="bootstrap">99.0</confidence>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <branch_length>0.01039</branch_length>\r
+                                      <confidence type="bootstrap">75.0</confidence>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.01042</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">57.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">29.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">38.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">35.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">35.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">62.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>A_CANFA</name>\r
+                                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>CANFA</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>13_HUMAN</name>\r
+                                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>HUMAN</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>11_HUMAN</name>\r
+                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>HUMAN</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>12_HUMAN</name>\r
+                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>HUMAN</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>6_PANTR</name>\r
+                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>PANTR</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>0.01046</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">66.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>12_MOUSE</name>\r
+                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>MOUSE</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">66.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>11_MOUSE</name>\r
+                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>MOUSE</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>3_RAT</name>\r
+                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>RAT</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>3_CAVPO</name>\r
+                                          <branch_length>0.01042</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>CAVPO</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>1_BOVIN</name>\r
+                                        <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <code>BOVIN</code>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>2_MONDO</name>\r
+                                      <branch_length>0.02145</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>MONDO</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <branch_length>0.03588</branch_length>\r
+                                    <confidence type="bootstrap">60.0</confidence>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>6_ANOCA</name>\r
+                                      <branch_length>0.11258</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>ANOCA</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <confidence type="bootstrap">78.0</confidence>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.01662</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">96.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>9_CHICK</name>\r
+                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>CHICK</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>A_CHICK</name>\r
+                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>CHICK</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>1_TAEGU</name>\r
+                                        <branch_length>0.02522</branch_length>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <code>TAEGU</code>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <branch_length>0.16564</branch_length>\r
+                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                    <confidence type="bootstrap">99.0</confidence>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>A_XENTR</name>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>XENTR</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>C_XENTR</name>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>XENTR</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>B_XENTR</name>\r
+                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <code>XENTR</code>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <branch_length>0.12038</branch_length>\r
+                                <confidence type="bootstrap">94.0</confidence>\r
+                                <clade>\r
+                                  <branch_length>0.15021</branch_length>\r
+                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <branch_length>0.06188</branch_length>\r
+                                    <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>7_ORYLA</name>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>ORYLA</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>6_ORYLA</name>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>ORYLA</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <branch_length>0.04812</branch_length>\r
+                                    <confidence type="bootstrap">83.0</confidence>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>4_GASAC</name>\r
+                                      <branch_length>0.03723</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>GASAC</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <branch_length>0.02682</branch_length>\r
+                                      <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.01033</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">73.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>7_FUGRU</name>\r
+                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>FUGRU</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>6_FUGRU</name>\r
+                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>FUGRU</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>2_TETNG</name>\r
+                                        <branch_length>0.02089</branch_length>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <code>TETNG</code>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>1_DANRE</name>\r
+                                  <branch_length>0.22119</branch_length>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <code>DANRE</code>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <branch_length>0.23289</branch_length>\r
+                            <confidence type="bootstrap">67.0</confidence>\r
+                            <clade>\r
+                              <branch_length>0.13772</branch_length>\r
+                              <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>4_XENTR</name>\r
+                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <code>XENTR</code>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>3_XENTR</name>\r
+                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <code>XENTR</code>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <branch_length>0.16355</branch_length>\r
+                              <confidence type="bootstrap">65.0</confidence>\r
+                              <clade>\r
+                                <branch_length>0.01654</branch_length>\r
+                                <confidence type="bootstrap">92.0</confidence>\r
+                                <clade>\r
+                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                  <confidence type="bootstrap">44.0</confidence>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <branch_length>0.01297</branch_length>\r
+                                    <confidence type="bootstrap">39.0</confidence>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <branch_length>0.02081</branch_length>\r
+                                      <confidence type="bootstrap">33.0</confidence>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.01041</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">45.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">25.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>8_MOUSE</name>\r
+                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>MOUSE</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>7_MOUSE</name>\r
+                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>MOUSE</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <branch_length>0.01038</branch_length>\r
+                                          <confidence type="bootstrap">61.0</confidence>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                            <confidence type="bootstrap">49.0</confidence>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                              <confidence type="bootstrap">36.0</confidence>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                <confidence type="bootstrap">42.0</confidence>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                  <confidence type="bootstrap">45.0</confidence>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>5_BOVIN</name>\r
+                                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>BOVIN</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>8_FELCA</name>\r
+                                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <code>FELCA</code>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>A_PANTR</name>\r
+                                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <code>PANTR</code>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>1_CAVPO</name>\r
+                                                <branch_length>0.01038</branch_length>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <code>CAVPO</code>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>7_CANFA</name>\r
+                                              <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <code>CANFA</code>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>17_HUMAN</name>\r
+                                            <branch_length>0.01038</branch_length>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <code>HUMAN</code>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>2_RAT</name>\r
+                                        <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <code>RAT</code>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>8_MONDO</name>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>MONDO</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>A_RAT</name>\r
+                                    <branch_length>0.11022</branch_length>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <code>RAT</code>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>2_ORNAN</name>\r
+                                  <branch_length>0.04894</branch_length>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <code>ORNAN</code>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>1_MONDO</name>\r
+                                <branch_length>0.50996</branch_length>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <code>MONDO</code>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <branch_length>0.18861</branch_length>\r
+                          <confidence type="bootstrap">82.0</confidence>\r
+                          <clade>\r
+                            <branch_length>0.13716</branch_length>\r
+                            <confidence type="bootstrap">73.0</confidence>\r
+                            <clade>\r
+                              <branch_length>0.00838</branch_length>\r
+                              <confidence type="bootstrap">41.0</confidence>\r
+                              <clade>\r
+                                <branch_length>0.03447</branch_length>\r
+                                <confidence type="bootstrap">57.0</confidence>\r
+                                <clade>\r
+                                  <branch_length>0.04944</branch_length>\r
+                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <branch_length>0.01034</branch_length>\r
+                                    <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>A_FUGRU</name>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>FUGRU</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>B_FUGRU</name>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>FUGRU</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>3_TETNG</name>\r
+                                    <branch_length>0.02058</branch_length>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <code>TETNG</code>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>1_GASAC</name>\r
+                                  <branch_length>0.10467</branch_length>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <code>GASAC</code>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <branch_length>0.2413</branch_length>\r
+                                <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                <clade>\r
+                                  <branch_length>0.34453</branch_length>\r
+                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <branch_length>0.02952</branch_length>\r
+                                    <confidence type="bootstrap">49.0</confidence>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>2_FUGRU</name>\r
+                                      <branch_length>0.18275</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>FUGRU</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <confidence type="bootstrap">32.0</confidence>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <branch_length>0.11833</branch_length>\r
+                                        <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>11_FUGRU</name>\r
+                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>FUGRU</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>10_FUGRU</name>\r
+                                          <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <code>FUGRU</code>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>12_FUGRU</name>\r
+                                        <branch_length>0.0418</branch_length>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <code>FUGRU</code>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>13_FUGRU</name>\r
+                                    <branch_length>0.02614</branch_length>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <code>FUGRU</code>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <branch_length>0.34425</branch_length>\r
+                                  <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>6_TETNG</name>\r
+                                    <branch_length>0.01039</branch_length>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <code>TETNG</code>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>5_TETNG</name>\r
+                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <code>TETNG</code>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <name>8_ORYLA</name>\r
+                              <branch_length>0.23384</branch_length>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <code>ORYLA</code>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <branch_length>0.0148</branch_length>\r
+                            <confidence type="bootstrap">99.0</confidence>\r
+                            <clade>\r
+                              <branch_length>0.03242</branch_length>\r
+                              <confidence type="bootstrap">85.0</confidence>\r
+                              <clade>\r
+                                <branch_length>0.04182</branch_length>\r
+                                <confidence type="bootstrap">100.0</confidence>\r
+                                <clade>\r
+                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                  <confidence type="bootstrap">57.0</confidence>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                    <confidence type="bootstrap">80.0</confidence>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>4_FUGRU</name>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>FUGRU</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>5_FUGRU</name>\r
+                                      <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <code>FUGRU</code>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>A_TETNG</name>\r
+                                    <branch_length>0.01035</branch_length>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <code>TETNG</code>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>3_FUGRU</name>\r
+                                  <branch_length>1.0E-5</branch_length>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <code>FUGRU</code>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>6_GASAC</name>\r
+                                <branch_length>0.05469</branch_length>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <code>GASAC</code>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <name>2_DANRE</name>\r
+                              <branch_length>0.02902</branch_length>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <code>DANRE</code>\r
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+                                                              <code>TARSY</code>\r
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+                                                          <code>TUPBE</code>\r
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+                                                          <reference doi="10.1186/1471-2148-9-71">\r
+                                                            <desc>Rodent phylogeny revised: analysis of six nuclear genes from all major rodent clades.</desc>\r
+                                                          </reference>\r
+                                                          <clade>\r
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+                                                          <clade>\r
+                                                            <taxonomy>\r
+                                                              <id provider="uniprot">132908</id>\r
+                                                              <code>PTEVA</code>\r
+                                                              <scientific_name>Pteropus vampyrus</scientific_name>\r
+                                                              <common_name>Large flying fox</common_name>\r
+                                                              <rank>species</rank>\r
+                                                              <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5e/Pteropus_vampyrus1.jpg/412px-Pteropus_vampyrus1.jpg</uri>\r
+                                                            </taxonomy>\r
+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>Carnivora</name>\r
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+                                                          <scientific_name>Carnivora</scientific_name>\r
+                                                          <rank>order</rank>\r
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+                                                            <scientific_name>Caniformia</scientific_name>\r
+                                                            <rank>suborder</rank>\r
+                                                          </taxonomy>\r
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+                                                            <taxonomy>\r
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+                                                              <code>AILME</code>\r
+                                                              <scientific_name>Ailuropoda melanoleuca</scientific_name>\r
+                                                              <common_name>Giant panda</common_name>\r
+                                                              <rank>species</rank>\r
+                                                              <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3c/Giant_Panda_2004-03-2.jpg/800px-Giant_Panda_2004-03-2.jpg</uri>\r
+                                                            </taxonomy>\r
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+                                                          <clade>\r
+                                                            <taxonomy>\r
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+                                                              <code>CANFA</code>\r
+                                                              <scientific_name>Canis familiaris</scientific_name>\r
+                                                              <common_name>Dog</common_name>\r
+                                                              <synonym>Canis lupus familiaris</synonym>\r
+                                                              <rank>subspecies</rank>\r
+                                                              <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/ab/Wikilabrador_jardin.JPG</uri>\r
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+                                                          </clade>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                        <clade>\r
+                                                          <taxonomy>\r
+                                                            <id provider="uniprot">9685</id>\r
+                                                            <code>FELCA</code>\r
+                                                            <scientific_name>Felis catus</scientific_name>\r
+                                                            <common_name>Cat</common_name>\r
+                                                            <synonym>Felis silvestris catus</synonym>\r
+                                                            <rank>species</rank>\r
+                                                            <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9b/Domestic_cat_cropped.jpg/755px-Domestic_cat_cropped.jpg</uri>\r
+                                                          </taxonomy>\r
+                                                        </clade>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <id provider="uniprot">9362</id>\r
+                                                        <scientific_name>Insectivora</scientific_name>\r
+                                                        <common_name>hedgehogs, shrews, moles and others</common_name>\r
+                                                        <rank>order</rank>\r
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+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <id provider="uniprot">9365</id>\r
+                                                          <code>ERIEU</code>\r
+                                                          <scientific_name>Erinaceus europaeus</scientific_name>\r
+                                                          <common_name>Western European hedgehog</common_name>\r
+                                                          <rank>species</rank>\r
+                                                          <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d4/Igel01.jpg</uri>\r
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+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <id provider="uniprot">42254</id>\r
+                                                          <code>SORAR</code>\r
+                                                          <scientific_name>Sorex araneus</scientific_name>\r
+                                                          <common_name>Eurasian common shrew</common_name>\r
+                                                          <synonym>European shrew</synonym>\r
+                                                          <rank>species</rank>\r
+                                                          <uri>http://www.batraciens-reptiles.com/musaraigne2.jpg</uri>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <scientific_name>Atlantogenata</scientific_name>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">311790</id>\r
+                                                      <scientific_name>Afrotheria</scientific_name>\r
+                                                      <rank>superorder</rank>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <scientific_name>Paenungulata</scientific_name>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <id provider="uniprot">9785</id>\r
+                                                          <code>LOXAF</code>\r
+                                                          <scientific_name>Loxodonta africana</scientific_name>\r
+                                                          <common_name>African savanna elephant</common_name>\r
+                                                          <rank>species</rank>\r
+                                                          <uri>http://animaldiversity.ummz.umich.edu/site/resources/susan_hoffman/elephants.jpg</uri>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <id provider="uniprot">9813</id>\r
+                                                          <code>PROCA</code>\r
+                                                          <scientific_name>Procavia capensis</scientific_name>\r
+                                                          <common_name>Cape hyrax</common_name>\r
+                                                          <synonym>Rock dassie</synonym>\r
+                                                          <rank>species</rank>\r
+                                                          <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/1206/0460.jpeg</uri>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
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+                                                        <id provider="uniprot">9371</id>\r
+                                                        <code>ECHTE</code>\r
+                                                        <scientific_name>Echinops telfairi</scientific_name>\r
+                                                        <common_name>Lesser hedgehog tenrec</common_name>\r
+                                                        <rank>species</rank>\r
+                                                        <uri>http://animaldiversity.ummz.umich.edu/site/resources/david_kupitz/etelfairi.jpg</uri>\r
+                                                      </taxonomy>\r
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+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">9348</id>\r
+                                                      <scientific_name>Xenarthra</scientific_name>\r
+                                                      <synonym>Edentata</synonym>\r
+                                                      <rank>superorder</rank>\r
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+                                                        <id provider="uniprot">9358</id>\r
+                                                        <code>CHOHO</code>\r
+                                                        <scientific_name>Choloepus hoffmanni</scientific_name>\r
+                                                        <common_name>Hoffmann&apos;s two-fingered sloth</common_name>\r
+                                                        <rank>species</rank>\r
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+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <id provider="uniprot">9361</id>\r
+                                                        <code>DASNO</code>\r
+                                                        <scientific_name>Dasypus novemcinctus</scientific_name>\r
+                                                        <common_name>Nine-banded armadillo</common_name>\r
+                                                        <rank>species</rank>\r
+                                                        <uri>http://images.enature.com/mammals/mammals_l/ma0154_1l.jpg</uri>\r
+                                                        <uri>http://anthropometaphors.files.wordpress.com/2008/11/nine-banded-armadillo41.jpg</uri>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">9263</id>\r
+                                                  <scientific_name>Metatheria</scientific_name>\r
+                                                  <common_name>Marsupials</common_name>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                                <distribution>\r
+                                                  <point geodetic_datum="?" alt_unit="?">\r
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+                                                  </point>\r
+                                                </distribution>\r
+                                                <reference doi="10.1016/j.ympev.2004.05.004">\r
+                                                  <desc>First combined cladistic analysis of marsupial mammal interrelationships</desc>\r
+                                                </reference>\r
+                                                <reference>\r
+                                                </reference>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <scientific_name>Eometatheria</scientific_name>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">9315</id>\r
+                                                      <code>MACEU</code>\r
+                                                      <scientific_name>Macropus eugenii</scientific_name>\r
+                                                      <common_name>Tammar wallaby</common_name>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
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+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">9305</id>\r
+                                                      <code>SARHA</code>\r
+                                                      <scientific_name>Sarcophilus harrisii</scientific_name>\r
+                                                      <common_name>Tasmanian devil</common_name>\r
+                                                      <synonym>Sarcophilus laniarius</synonym>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
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+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">13616</id>\r
+                                                    <code>MONDO</code>\r
+                                                    <scientific_name>Monodelphis domestica</scientific_name>\r
+                                                    <common_name>Short-tailed gray opossum</common_name>\r
+                                                    <rank>species</rank>\r
+                                                    <uri>http://animaldiversity.ummz.umich.edu/site/resources/phil_myers/classic/monodelphis.jpg/medium.jpg</uri>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">9258</id>\r
+                                                <code>ORNAN</code>\r
+                                                <scientific_name>Ornithorhynchus anatinus</scientific_name>\r
+                                                <common_name>Duckbill platypus</common_name>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                                <uri>http://www.biolib.cz/IMG/GAL/39610.jpg</uri>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>Diapsida</name>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>Neognathae</name>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">8825</id>\r
+                                                <scientific_name>Neognathae</scientific_name>\r
+                                                <rank>superorder</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>Phasianidae &amp; Anatidae (waterfowl)</name>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">9005</id>\r
+                                                    <scientific_name>Phasianidae</scientific_name>\r
+                                                    <rank>family</rank>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">9031</id>\r
+                                                      <code>CHICK</code>\r
+                                                      <scientific_name>Gallus gallus</scientific_name>\r
+                                                      <common_name>Chicken</common_name>\r
+                                                      <synonym>Gallus domesticus</synonym>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
+                                                      <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f8/Rooster04_adjusted.jpg/800px-Rooster04_adjusted.jpg</uri>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">9103</id>\r
+                                                      <code>MELGA</code>\r
+                                                      <scientific_name>Meleagris gallopavo</scientific_name>\r
+                                                      <common_name>Common turkey</common_name>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
+                                                      <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/0205/0858.jpeg</uri>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">8839</id>\r
+                                                    <code>ANAPL</code>\r
+                                                    <scientific_name>Anas platyrhynchos</scientific_name>\r
+                                                    <common_name>Domestic duck</common_name>\r
+                                                    <synonym>Anas boschas</synonym>\r
+                                                    <rank>species</rank>\r
+                                                    <uri>http://content.ornith.cornell.edu/UEWebApp/images/MPR_070302_100009_L.jpg</uri>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">59729</id>\r
+                                                  <code>TAEGU</code>\r
+                                                  <scientific_name>Taeniopygia guttata</scientific_name>\r
+                                                  <common_name>Zebra finch</common_name>\r
+                                                  <synonym>Poephila guttata</synonym>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                  <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/84/Taeniopygia_guttata_-_front_view_-_dundee_wildlife_park.jpg/355px-Taeniopygia_guttata_-_front_view_-_dundee_wildlife_park.jpg</uri>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="eol">795869</id>\r
+                                                <code>ANOCA</code>\r
+                                                <scientific_name>Anolis carolinensis</scientific_name>\r
+                                                <authority>Voigt, 1832</authority>\r
+                                                <common_name>Green anole</common_name>\r
+                                                <synonym>American chameleon</synonym>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                                <uri>http://content61.eol.org/content/2009/09/20/01/05528_580_360.jpg</uri>\r
+                                                <uri>http://content61.eol.org/content/2008/10/08/13/66818_580_360.jpg</uri>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">8364</id>\r
+                                            <code>XENTR</code>\r
+                                            <scientific_name>Xenopus tropicalis</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Western clawed frog</common_name>\r
+                                            <synonym>Silurana tropicalis</synonym>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                            <uri>http://genoweb.univ-rennes1.fr/OGP/xenopus%20tropicalis.jpg</uri>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>Teleostei</name>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">32443</id>\r
+                                          <scientific_name>Teleostei</scientific_name>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">123368</id>\r
+                                            <scientific_name>Acanthomorpha</scientific_name>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">32485</id>\r
+                                              <scientific_name>Percomorpha</scientific_name>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>Smegmamorpha</name>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">69293</id>\r
+                                                  <code>GASAC</code>\r
+                                                  <scientific_name>Gasterosteus aculeatus</scientific_name>\r
+                                                  <common_name>Three-spined stickleback</common_name>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                  <uri>http://www.fiskbasen.se/images/gasterosteus_aculeatus.jpg</uri>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">8090</id>\r
+                                                  <code>ORYLA</code>\r
+                                                  <scientific_name>Oryzias latipes</scientific_name>\r
+                                                  <common_name>Medaka fish</common_name>\r
+                                                  <synonym>Japanese ricefish</synonym>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                  <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/49/Nihonmedaka.jpg</uri>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">31031</id>\r
+                                                <scientific_name>Tetraodontidae</scientific_name>\r
+                                                <common_name>puffers</common_name>\r
+                                                <rank>family</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">31033</id>\r
+                                                  <code>FUGRU</code>\r
+                                                  <scientific_name>Takifugu rubripes</scientific_name>\r
+                                                  <common_name>Japanese pufferfish</common_name>\r
+                                                  <synonym>Fugu rubripes</synonym>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                  <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/25/Fugu_in_Tank.jpg/800px-Fugu_in_Tank.jpg</uri>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">99883</id>\r
+                                                  <code>TETNG</code>\r
+                                                  <scientific_name>Tetraodon nigroviridis</scientific_name>\r
+                                                  <common_name>Green puffer</common_name>\r
+                                                  <synonym>Chelonodon nigroviridis</synonym>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                  <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b6/Tetraodon_nigroviridis_1.jpg/800px-Tetraodon_nigroviridis_1.jpg</uri>\r
+                                                </taxonomy>\r
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+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">8049</id>\r
+                                              <code>GADMO</code>\r
+                                              <scientific_name>Gadus morhua</scientific_name>\r
+                                              <common_name>Atlantic cod</common_name>\r
+                                              <rank>species</rank>\r
+                                              <uri>http://www.marinbi.com/g-morhua.jpg</uri>\r
+                                            </taxonomy>\r
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+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">7955</id>\r
+                                            <code>DANRE</code>\r
+                                            <scientific_name>Danio rerio</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Zebrafish</common_name>\r
+                                            <synonym>Brachydanio rerio</synonym>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                            <uri>http://fishbase.org.cn/images/species/Darer_m0.jpg</uri>\r
+                                          </taxonomy>\r
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+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">7868</id>\r
+                                        <code>CALMI</code>\r
+                                        <scientific_name>Callorhynchus milii</scientific_name>\r
+                                        <common_name>Australian ghost shark</common_name>\r
+                                        <synonym>Australian ghost shark</synonym>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                        <uri>http://www.tudiscovery.com/tiburones/que_es/popup_que/asset/07914907646434433_elephant_shark_380x290.jpg</uri>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">7757</id>\r
+                                      <code>PETMA</code>\r
+                                      <scientific_name>Petromyzon marinus</scientific_name>\r
+                                      <common_name>Sea lamprey</common_name>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                      <uri>http://www.uk-fish.info/pics/sealampray01.jpg</uri>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>Urochordata</name>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">7712</id>\r
+                                    <scientific_name>Urochordata</scientific_name>\r
+                                    <rank>subphylum</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">7718</id>\r
+                                      <scientific_name>Ciona</scientific_name>\r
+                                      <rank>genus</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">7719</id>\r
+                                        <code>CIOIN</code>\r
+                                        <scientific_name>Ciona intestinalis</scientific_name>\r
+                                        <common_name>Transparent sea squirt</common_name>\r
+                                        <synonym>Ascidia intestinalis</synonym>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                        <uri>http://adl.brs.gov.au/marinepests/images/Ciona_intestinalis2.jpg</uri>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">51511</id>\r
+                                        <code>CIOSA</code>\r
+                                        <scientific_name>Ciona savignyi</scientific_name>\r
+                                        <common_name>Pacific transparent sea squirt</common_name>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                        <uri>http://www.pnwscuba.com/invasives/photos/ciona4.jpg</uri>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="ncbi">34765</id>\r
+                                      <code>OIKDI</code>\r
+                                      <scientific_name>Oikopleura dioica</scientific_name>\r
+                                      <common_name>Tunicate</common_name>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                      <uri>http://jellieszone.com/images/oikopleura.jpg</uri>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">7739</id>\r
+                                  <code>BRAFL</code>\r
+                                  <scientific_name>Branchiostoma floridae</scientific_name>\r
+                                  <common_name>Florida lancelet</common_name>\r
+                                  <synonym>Amphioxus</synonym>\r
+                                  <rank>species</rank>\r
+                                  <uri>http://genome.jgi-psf.org/Brafl1/Amphioxus-1.jpg</uri>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <name>Hemichordata &amp; Echinodermata</name>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">10224</id>\r
+                                  <code>SACKO</code>\r
+                                  <scientific_name>Saccoglossus kowalevskii</scientific_name>\r
+                                  <authority>Agassiz, 1873</authority>\r
+                                  <common_name>Acorn worm</common_name>\r
+                                  <rank>species</rank>\r
+                                  <uri>http://www.amnh.org/exhibitions/hall_tour/spectrum/specimens/a158.jpg</uri>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">7668</id>\r
+                                  <code>STRPU</code>\r
+                                  <scientific_name>Strongylocentrotus purpuratus</scientific_name>\r
+                                  <common_name>Purple sea urchin</common_name>\r
+                                  <rank>species</rank>\r
+                                  <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f4/Strongylocentrotus_purpuratus_1.jpg/724px-Strongylocentrotus_purpuratus_1.jpg</uri>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <name>Protostomia</name>\r
+                            <clade>\r
+                              <name>Ecdysozoa</name>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">6656</id>\r
+                                  <scientific_name>Arthropoda</scientific_name>\r
+                                  <rank>phylum</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">197563</id>\r
+                                    <scientific_name>Mandibulata</scientific_name>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>Pancrustacea</name>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">33340</id>\r
+                                        <scientific_name>Neoptera</scientific_name>\r
+                                        <rank>subclass</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">33392</id>\r
+                                          <scientific_name>Endopterygota</scientific_name>\r
+                                          <rank>infraclass</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>Hymenoptera &amp; Lepidoptera &amp; Diptera</name>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>Lepidoptera &amp; Diptera</name>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">7147</id>\r
+                                                <scientific_name>Diptera</scientific_name>\r
+                                                <rank>order</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">7157</id>\r
+                                                  <scientific_name>Culicidae</scientific_name>\r
+                                                  <common_name>mosquitos</common_name>\r
+                                                  <rank>family</rank>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">7159</id>\r
+                                                    <code>AEDAE</code>\r
+                                                    <scientific_name>Aedes aegypti</scientific_name>\r
+                                                    <common_name>Yellowfever mosquito</common_name>\r
+                                                    <synonym>Culex aegypti</synonym>\r
+                                                    <rank>species</rank>\r
+                                                    <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/48/Aedes_aegypti_biting_human.jpg/757px-Aedes_aegypti_biting_human.jpg</uri>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">7165</id>\r
+                                                    <code>ANOGA</code>\r
+                                                    <scientific_name>Anopheles gambiae</scientific_name>\r
+                                                    <common_name>African malaria mosquito</common_name>\r
+                                                    <rank>species</rank>\r
+                                                    <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/e/e9/Anopheles_gambiae_Mosquito.jpg</uri>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">32341</id>\r
+                                                  <scientific_name>Sophophora</scientific_name>\r
+                                                  <rank>subgenus</rank>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">7227</id>\r
+                                                    <code>DROME</code>\r
+                                                    <scientific_name>Drosophila melanogaster</scientific_name>\r
+                                                    <common_name>Fruit fly</common_name>\r
+                                                    <rank>species</rank>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">46245</id>\r
+                                                    <code>DROPS</code>\r
+                                                    <scientific_name>Drosophila pseudoobscura pseudoobscura</scientific_name>\r
+                                                    <common_name>Fruit fly</common_name>\r
+                                                    <rank>subspecies</rank>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">7091</id>\r
+                                                <code>BOMMO</code>\r
+                                                <scientific_name>Bombyx mori</scientific_name>\r
+                                                <common_name>Silk moth</common_name>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">7400</id>\r
+                                              <scientific_name>Apocrita</scientific_name>\r
+                                              <common_name>wasps, ants and bees</common_name>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">7460</id>\r
+                                                <code>APIME</code>\r
+                                                <scientific_name>Apis mellifera</scientific_name>\r
+                                                <common_name>Honeybee</common_name>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">7425</id>\r
+                                                <code>NASVI</code>\r
+                                                <scientific_name>Nasonia vitripennis</scientific_name>\r
+                                                <common_name>Parasitic wasp</common_name>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">7070</id>\r
+                                            <code>TRICA</code>\r
+                                            <scientific_name>Tribolium castaneum</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Red flour beetle</common_name>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">7524</id>\r
+                                          <scientific_name>Hemiptera</scientific_name>\r
+                                          <rank>order</rank>\r
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+                                            <id provider="uniprot">7029</id>\r
+                                            <code>ACYPI</code>\r
+                                            <scientific_name>Acyrthosiphon pisum</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Pea aphid</common_name>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">13249</id>\r
+                                            <code>RHOPR</code>\r
+                                            <scientific_name>Rhodnius prolixus</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Triatomid bug</common_name>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                            <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/b/b9/Rhodnius_prolixus.jpg</uri>\r
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+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">6658</id>\r
+                                        <scientific_name>Branchiopoda</scientific_name>\r
+                                        <rank>class</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">6661</id>\r
+                                          <code>ARTSF</code>\r
+                                          <scientific_name>Artemia franciscana</scientific_name>\r
+                                          <common_name>Brine shrimp</common_name>\r
+                                          <synonym>Artemia sanfranciscana</synonym>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                          <uri>http://www.alireza-asem.ir/images/Artemia.jpg</uri>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">6669</id>\r
+                                          <code>DAPPU</code>\r
+                                          <scientific_name>Daphnia pulex</scientific_name>\r
+                                          <common_name>Water flea</common_name>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                          <uri>http://www.microscopy-uk.org.uk/mag/imgjun99/daphni.jpg</uri>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">61985</id>\r
+                                      <scientific_name>Myriapoda</scientific_name>\r
+                                      <rank>subphylum</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">7553</id>\r
+                                        <scientific_name>Diplopoda</scientific_name>\r
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+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
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+                                          <scientific_name>Helminthomorpha</scientific_name>\r
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+                                            <rank>species</rank>\r
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+                                          </taxonomy>\r
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+                                          <taxonomy>\r
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+                                            <code>NARAN</code>\r
+                                            <scientific_name>Narceus annularis</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Millipede</common_name>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                            <uri>http://i.pbase.com/g4/59/68959/2/59864073.narceus0705062large.jpg</uri>\r
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+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">52428</id>\r
+                                          <scientific_name>Polyxenus lagurus</scientific_name>\r
+                                          <common_name>bristly millipede</common_name>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                          <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/54/Polyxenus.lagurus.1.jpg</uri>\r
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+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">7540</id>\r
+                                        <scientific_name>Chilopoda</scientific_name>\r
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+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">29022</id>\r
+                                          <code>SCUCO</code>\r
+                                          <scientific_name>Scutigera coleoptrata</scientific_name>\r
+                                          <common_name>House centipede</common_name>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                          <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/1/14/Scutigera_coleoptrata.JPG</uri>\r
+                                        </taxonomy>\r
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+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
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+                                          <scientific_name>Strigamia maritima</scientific_name>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                          <uri>http://images.marinespecies.org/resized/22703_strigamia-maritima-male-loch-linnhe-scotland.jpg</uri>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">6945</id>\r
+                                    <code>IXOSC</code>\r
+                                    <scientific_name>Ixodes scapularis</scientific_name>\r
+                                    <common_name>Black-legged tick</common_name>\r
+                                    <synonym>Deer tick</synonym>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
+                                    <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/8/8c/Deertick.jpg</uri>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">119089</id>\r
+                                  <scientific_name>Chromadorea</scientific_name>\r
+                                  <rank>class</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
+                                <reference doi="10.1038/32160">\r
+                                </reference>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>nematode Clade V</name>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>Caenorhabditis</name>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">6237</id>\r
+                                      <scientific_name>Caenorhabditis</scientific_name>\r
+                                      <rank>genus</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">6238</id>\r
+                                        <code>CAEBR</code>\r
+                                        <scientific_name>Caenorhabditis briggsae</scientific_name>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">6239</id>\r
+                                        <code>CAEEL</code>\r
+                                        <scientific_name>Caenorhabditis elegans</scientific_name>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">54126</id>\r
+                                      <code>PRIPA</code>\r
+                                      <scientific_name>Pristionchus pacificus</scientific_name>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">6279</id>\r
+                                    <code>BRUMA</code>\r
+                                    <scientific_name>Brugia malayi</scientific_name>\r
+                                    <common_name>Filarial nematode worm</common_name>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <name>Lophotrochozoa</name>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>Annelida &amp; Mollusca</name>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">6340</id>\r
+                                    <scientific_name>Annelida</scientific_name>\r
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+                                  </taxonomy>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>CAP</name>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">283909</id>\r
+                                      <scientific_name>Capitella teleta</scientific_name>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">6412</id>\r
+                                      <code>HELRO</code>\r
+                                      <scientific_name>Helobdella robusta</scientific_name>\r
+                                      <common_name>Californian leech</common_name>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">225164</id>\r
+                                    <code>LOTGI</code>\r
+                                    <scientific_name>Lottia gigantea</scientific_name>\r
+                                    <common_name>Owl limpet</common_name>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">6157</id>\r
+                                  <scientific_name>Platyhelminthes</scientific_name>\r
+                                  <rank>phylum</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">6183</id>\r
+                                    <code>SCHMA</code>\r
+                                    <scientific_name>Schistosoma mansoni</scientific_name>\r
+                                    <common_name>Blood fluke</common_name>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">79327</id>\r
+                                    <code>SCHMD</code>\r
+                                    <scientific_name>Schmidtea mediterranea</scientific_name>\r
+                                    <common_name>Freshwater planarian flatworm</common_name>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <name>Cnidaria</name>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">6073</id>\r
+                            <scientific_name>Cnidaria</scientific_name>\r
+                            <rank>phylum</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">6102</id>\r
+                              <scientific_name>Hexacorallia</scientific_name>\r
+                              <synonym>Ceriantipatharia</synonym>\r
+                              <synonym>Zoantharia</synonym>\r
+                              <rank>subclass</rank>\r
+                            </taxonomy>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
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+                                <code>NEMVE</code>\r
+                                <scientific_name>Nematostella vectensis</scientific_name>\r
+                                <common_name>Starlet sea anemone</common_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">70779</id>\r
+                                <code>ACRDI</code>\r
+                                <scientific_name>Acropora digitifera</scientific_name>\r
+                                <common_name>Staghorn coral</common_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                                <uri>http://www.botany.hawaii.edu/basch/uhnpscesu/htms/NPSAcorl/images/acropori/acrdigitif7.jpg</uri>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="eol">9119928</id>\r
+                              <code>HYDMA</code>\r
+                              <scientific_name>Hydra magnipapillata</scientific_name>\r
+                              <authority>Ito, 1947</authority>\r
+                              <rank>species</rank>\r
+                              <uri>http://www.nig.ac.jp/labs/OntoGen/magni.html</uri>\r
+                            </taxonomy>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">10228</id>\r
+                          <code>TRIAD</code>\r
+                          <scientific_name>Trichoplax adhaerens</scientific_name>\r
+                          <synonym>Trichoplax reptans</synonym>\r
+                          <rank>species</rank>\r
+                        </taxonomy>\r
+                        <reference doi="10.1073/pnas.0602076103">\r
+                        </reference>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
+                      <taxonomy>\r
+                        <id provider="uniprot">400682</id>\r
+                        <code>AMPQU</code>\r
+                        <scientific_name>Amphimedon queenslandica</scientific_name>\r
+                        <rank>species</rank>\r
+                      </taxonomy>\r
+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
+                  <clade>\r
+                    <taxonomy>\r
+                      <id provider="uniprot">81524</id>\r
+                      <scientific_name>Codonosigidae</scientific_name>\r
+                      <rank>family</rank>\r
+                    </taxonomy>\r
+                    <clade>\r
+                      <taxonomy>\r
+                        <id provider="uniprot">81824</id>\r
+                        <code>MONBE</code>\r
+                        <scientific_name>Monosiga brevicollis</scientific_name>\r
+                        <common_name>Choanoflagellate</common_name>\r
+                        <rank>species</rank>\r
+                      </taxonomy>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
+                      <taxonomy>\r
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+                        <code>SALS5</code>\r
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+                        <synonym>Salpingoeca sp. ATCC 50818</synonym>\r
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+                    <reference>\r
+                    </reference>\r
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+                              </reference>\r
+                              <clade>\r
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+                                    <reference doi="0.3852/mycologia.98.6.1018">\r
+                                      <desc>A five-gene phylogeny of Pezizomycotina</desc>\r
+                                    </reference>\r
+                                    <reference>\r
+                                    </reference>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
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+                                                        <id provider="uniprot">29875</id>\r
+                                                        <code>TRIVE</code>\r
+                                                        <scientific_name>Trichoderma virens</scientific_name>\r
+                                                        <common_name>Gliocladium virens</common_name>\r
+                                                        <synonym>Trichoderma virens</synonym>\r
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+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
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+                                                      <code>MAGGR</code>\r
+                                                      <scientific_name>Magnaporthe grisea</scientific_name>\r
+                                                      <common_name>Rice blast fungus</common_name>\r
+                                                      <synonym>Pyricularia grisea</synonym>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
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+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">5139</id>\r
+                                                    <scientific_name>Sordariales</scientific_name>\r
+                                                    <rank>order</rank>\r
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+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
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+                                                      <scientific_name>Chaetomiaceae</scientific_name>\r
+                                                      <rank>family</rank>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <id provider="uniprot">35719</id>\r
+                                                        <scientific_name>Thielavia</scientific_name>\r
+                                                        <rank>genus</rank>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>MYCTHE</name>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <id provider="uniprot">573728</id>\r
+                                                          <scientific_name>Myceliophthora thermophila</scientific_name>\r
+                                                          <authority>(Apinis) Oorschot 1977</authority>\r
+                                                          <synonym>Sporotrichum thermophilum</synonym>\r
+                                                          <synonym>anamorph of Thielavia heterothallica</synonym>\r
+                                                          <rank>species</rank>\r
+                                                          <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Spoth2/Spoth0.jpg</uri>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                      <clade>\r
+                                                        <name>THITER</name>\r
+                                                        <taxonomy>\r
+                                                          <id provider="eol">193532</id>\r
+                                                          <scientific_name>Thielavia terrestris</scientific_name>\r
+                                                          <authority>Malloch &amp; Cain 1972</authority>\r
+                                                          <synonym>Acremonium alabamense</synonym>\r
+                                                          <rank>species</rank>\r
+                                                          <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Thite2/Thite1.jpg</uri>\r
+                                                        </taxonomy>\r
+                                                      </clade>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <id provider="eol">1029505</id>\r
+                                                        <code>CHAGB</code>\r
+                                                        <scientific_name>Chaetomium globosum</scientific_name>\r
+                                                        <authority>Kunze 1817</authority>\r
+                                                        <common_name>Soil fungus</common_name>\r
+                                                        <rank>species</rank>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">5141</id>\r
+                                                      <code>NEUCR</code>\r
+                                                      <scientific_name>Neurospora crassa</scientific_name>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">147548</id>\r
+                                                  <scientific_name>Leotiomycetes</scientific_name>\r
+                                                  <rank>class</rank>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">28983</id>\r
+                                                    <scientific_name>Sclerotiniaceae</scientific_name>\r
+                                                    <rank>family</rank>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">40559</id>\r
+                                                      <code>BOTFU</code>\r
+                                                      <scientific_name>Botryotinia fuckeliana</scientific_name>\r
+                                                      <common_name>Noble rot fungus</common_name>\r
+                                                      <synonym>Botrytis cinerea</synonym>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">5180</id>\r
+                                                      <code>SCLSC</code>\r
+                                                      <scientific_name>Sclerotinia sclerotiorum</scientific_name>\r
+                                                      <common_name>White mold</common_name>\r
+                                                      <synonym>Whetzelinia sclerotiorum</synonym>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>OIDMAI</name>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">78148</id>\r
+                                                    <scientific_name>Oidiodendron maius</scientific_name>\r
+                                                    <rank>species</rank>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">388435</id>\r
+                                                <scientific_name>Lecanoromycetidae</scientific_name>\r
+                                                <rank>subclass</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>CLAGRA</name>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">27339</id>\r
+                                                  <scientific_name>Cladonia grayi</scientific_name>\r
+                                                  <synonym>Cladonia grayi Merr</synonym>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                  <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/b/b6/Cladonia_grayi-11.jpg</uri>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>XANPAR</name>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">107463</id>\r
+                                                  <scientific_name>Xanthoria parietina</scientific_name>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                  <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/70/Xanthoria_parietina_%2806_03_31%29.jpg/800px-Xanthoria_parietina_%2806_03_31%29.jpg</uri>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">147541</id>\r
+                                              <scientific_name>Dothideomycetes</scientific_name>\r
+                                              <rank>class</rank>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                            <reference doi="10.3114/sim.2009.64.01">\r
+                                              <desc>A class-wide phylogenetic assessment of Dothideomycetes</desc>\r
+                                            </reference>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">134362</id>\r
+                                                <scientific_name>Capnodiales</scientific_name>\r
+                                                <rank>order</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">41254</id>\r
+                                                  <scientific_name>Mycosphaerella</scientific_name>\r
+                                                  <rank>genus</rank>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>MYCFI</name>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">83344</id>\r
+                                                    <scientific_name>Mycosphaerella fijiensis</scientific_name>\r
+                                                    <rank>species</rank>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>MYCPOP</name>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">85929</id>\r
+                                                    <scientific_name>Mycosphaerella populorum</scientific_name>\r
+                                                    <synonym>Septoria musiva</synonym>\r
+                                                    <rank>species</rank>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>BAUCOM</name>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">430998</id>\r
+                                                  <scientific_name>Baudoinia compniacensis</scientific_name>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                  <uri>http://www.diark.org/img/species_pict/Baudoinia_compniacensis</uri>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">715340</id>\r
+                                                <scientific_name>Pleosporineae</scientific_name>\r
+                                                <rank>suborder</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">28556</id>\r
+                                                  <scientific_name>Pleosporaceae</scientific_name>\r
+                                                  <rank>family</rank>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>Cochliobolus &amp; Setosphaeria</name>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">5015</id>\r
+                                                      <scientific_name>Cochliobolus</scientific_name>\r
+                                                      <rank>genus</rank>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <id provider="uniprot">5016</id>\r
+                                                        <code>COCHE</code>\r
+                                                        <scientific_name>Cochliobolus heterostrophus</scientific_name>\r
+                                                        <synonym>Drechslera maydis</synonym>\r
+                                                        <rank>species</rank>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                    <clade>\r
+                                                      <taxonomy>\r
+                                                        <id provider="uniprot">45130</id>\r
+                                                        <code>COCSA</code>\r
+                                                        <scientific_name>Cochliobolus sativus</scientific_name>\r
+                                                        <synonym>Bipolaris sorokiniana</synonym>\r
+                                                        <rank>species</rank>\r
+                                                        <uri>http://www.plantmanagementnetwork.org/pub/php/diagnosticguide/2003/rootrot/image/mathre6sm.jpg</uri>\r
+                                                      </taxonomy>\r
+                                                    </clade>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">93612</id>\r
+                                                      <code>SETTU</code>\r
+                                                      <scientific_name>Setosphaeria turcica</scientific_name>\r
+                                                      <authority>(Luttr.) K.J. Leonard &amp; Suggs, (1974)</authority>\r
+                                                      <common_name>Northern corn leaf blight disease fungus</common_name>\r
+                                                      <synonym>Exserohilum turcicum</synonym>\r
+                                                      <synonym>Helminthosporium turcicum</synonym>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
+                                                      <uri>http://www.pflanzenkrankheiten.ch/diseases/STU/figures_STU/HTU_Mais_Mik_7_k.jpg</uri>\r
+                                                      <uri>http://www.pflanzenkrankheiten.ch/diseases/STU/figures_STU/Exserohilum_turcicum_001_k.jpg</uri>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <id provider="uniprot">426418</id>\r
+                                                    <code>PYRTR</code>\r
+                                                    <scientific_name>Pyrenophora tritici-repentis (strain Pt-1C-BFP)</scientific_name>\r
+                                                    <common_name>Wheat tan spot fungus</common_name>\r
+                                                    <synonym>Drechslera tritici-repentis</synonym>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">13684</id>\r
+                                                  <code>PHANO</code>\r
+                                                  <scientific_name>Phaeosphaeria nodorum</scientific_name>\r
+                                                  <common_name>Glume blotch fungus</common_name>\r
+                                                  <synonym>Septoria nodorum</synonym>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">28568</id>\r
+                                            <scientific_name>Trichocomaceae</scientific_name>\r
+                                            <rank>family</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>Neosartorya_Emericella</name>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="eol">195546</id>\r
+                                                <code>EMENI</code>\r
+                                                <scientific_name>Emericella nidulans</scientific_name>\r
+                                                <authority>Vuill. 1927</authority>\r
+                                                <synonym>Aspergillus nidulans</synonym>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">331117</id>\r
+                                                <code>NEOFI</code>\r
+                                                <scientific_name>Neosartorya fischeri (strain ATCC 1020 / DSM 3700 / FGSC A1164 / NRRL 181)</scientific_name>\r
+                                                <synonym>Aspergillus fischerianus</synonym>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">5052</id>\r
+                                              <scientific_name>Aspergillus</scientific_name>\r
+                                              <rank>genus</rank>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">5059</id>\r
+                                                <code>ASPFL</code>\r
+                                                <scientific_name>Aspergillus flavus</scientific_name>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">5061</id>\r
+                                                <code>ASPNG</code>\r
+                                                <scientific_name>Aspergillus niger</scientific_name>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">33183</id>\r
+                                          <scientific_name>Onygenales</scientific_name>\r
+                                          <rank>order</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">5501</id>\r
+                                            <code>COCIM</code>\r
+                                            <scientific_name>Coccidioides immitis</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Valley fever fungus</common_name>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">336963</id>\r
+                                            <code>UNCRE</code>\r
+                                            <scientific_name>Uncinocarpus reesii (strain UAMH 1704)</scientific_name>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">656061</id>\r
+                                        <code>TUBMM</code>\r
+                                        <scientific_name>Tuber melanosporum (strain Mel28)</scientific_name>\r
+                                        <common_name>Perigord black truffle</common_name>\r
+                                        <synonym>Tuber melanosporum Mel28</synonym>\r
+                                        <uri>http://www.gmvmonza.org/images%20parco/Tuber%20melanosporum%20p106.jpg</uri>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">4892</id>\r
+                                      <scientific_name>Saccharomycetales</scientific_name>\r
+                                      <common_name>budding yeasts</common_name>\r
+                                      <rank>order</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>Candida &amp; Debaryomyces &amp; Saccharomycetacea</name>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">4893</id>\r
+                                          <scientific_name>Saccharomycetaceae</scientific_name>\r
+                                          <rank>family</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>Saccharomyces_Pichia</name>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>Saccharomyces</name>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">27288</id>\r
+                                                <code>SACCA</code>\r
+                                                <scientific_name>Saccharomyces castellii</scientific_name>\r
+                                                <common_name>Yeast</common_name>\r
+                                                <synonym>Saccharomyces castellii</synonym>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">4932</id>\r
+                                                <code>YEAST</code>\r
+                                                <scientific_name>Saccharomyces cerevisiae</scientific_name>\r
+                                                <common_name>Baker&apos;s yeast</common_name>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">4905</id>\r
+                                              <code>PICAN</code>\r
+                                              <scientific_name>Pichia angusta</scientific_name>\r
+                                              <common_name>Yeast</common_name>\r
+                                              <synonym>Hansenula polymorpha</synonym>\r
+                                              <rank>species</rank>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>Kluyveromyces &amp; Ashbya</name>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>Kluyveromyces</name>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">28985</id>\r
+                                                <code>KLULA</code>\r
+                                                <scientific_name>Kluyveromyces lactis</scientific_name>\r
+                                                <common_name>Yeast</common_name>\r
+                                                <synonym>Candida sphaerica</synonym>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">4914</id>\r
+                                                <code>KLUWA</code>\r
+                                                <scientific_name>Kluyveromyces waltii</scientific_name>\r
+                                                <common_name>Yeast</common_name>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">33169</id>\r
+                                              <code>ASHGO</code>\r
+                                              <scientific_name>Ashbya gossypii</scientific_name>\r
+                                              <common_name>Yeast</common_name>\r
+                                              <synonym>Eremothecium gossypii</synonym>\r
+                                              <rank>species</rank>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>Candida &amp; Debaryomyces</name>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">5475</id>\r
+                                            <scientific_name>Candida</scientific_name>\r
+                                            <rank>genus</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">5476</id>\r
+                                              <code>CANAL</code>\r
+                                              <scientific_name>Candida albicans</scientific_name>\r
+                                              <common_name>Yeast</common_name>\r
+                                              <rank>species</rank>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">5482</id>\r
+                                              <code>CANTR</code>\r
+                                              <scientific_name>Candida tropicalis</scientific_name>\r
+                                              <common_name>Yeast</common_name>\r
+                                              <rank>species</rank>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">4959</id>\r
+                                            <code>DEBHA</code>\r
+                                            <scientific_name>Debaryomyces hansenii</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Yeast</common_name>\r
+                                            <synonym>Torulaspora hansenii</synonym>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">4952</id>\r
+                                        <code>YARLI</code>\r
+                                        <scientific_name>Yarrowia lipolytica</scientific_name>\r
+                                        <synonym>Candida lipolytica</synonym>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">451866</id>\r
+                                    <scientific_name>Taphrinomycotina</scientific_name>\r
+                                    <rank>subphylum</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>Pneumocystidomycetes &amp; Schizosaccharomycetes</name>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">4895</id>\r
+                                        <scientific_name>Schizosaccharomyces</scientific_name>\r
+                                        <rank>genus</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">4897</id>\r
+                                          <code>SCHJP</code>\r
+                                          <scientific_name>Schizosaccharomyces japonicus</scientific_name>\r
+                                          <common_name>Fission yeast</common_name>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">4896</id>\r
+                                          <code>SCHPO</code>\r
+                                          <scientific_name>Schizosaccharomyces pombe</scientific_name>\r
+                                          <common_name>Fission yeast</common_name>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">4754</id>\r
+                                        <code>PNECA</code>\r
+                                        <scientific_name>Pneumocystis carinii</scientific_name>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>SAICOM</name>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">5606</id>\r
+                                      <scientific_name>Saitoella complicata</scientific_name>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">5204</id>\r
+                                  <scientific_name>Basidiomycota</scientific_name>\r
+                                  <rank>phylum</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>Agaricomycotina &amp; Ustilaginomycotina &amp; Pucciniomycotina</name>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>Agaricomycotina &amp; Ustilaginomycotina</name>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">5302</id>\r
+                                        <scientific_name>Agaricomycotina</scientific_name>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">155619</id>\r
+                                          <scientific_name>Homobasidiomycetes</scientific_name>\r
+                                          <rank>class</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                        <reference doi="10.1098/rspb.2002.2123">\r
+                                          <desc>Evolution of complex fruiting–body morphologies in homobasidiomycetes</desc>\r
+                                        </reference>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>Agaricomycetidae &amp; Gloeophyllum &amp; Aphyllophorales</name>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <name>Agaricomycetidae &amp; Gloeophyllum</name>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">452333</id>\r
+                                                <scientific_name>Agaricomycetidae</scientific_name>\r
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+                                                            <scientific_name>Agaricus bisporus var. burnettii</scientific_name>\r
+                                                            <uri>http://www.mykoweb.com/CAF/photos/Agaricus_bisporus(fs-03).jpg</uri>\r
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+                                                            <id provider="uniprot">5346</id>\r
+                                                            <code>COPCI</code>\r
+                                                            <scientific_name>Coprinopsis cinerea</scientific_name>\r
+                                                            <common_name>Inky cap fungus</common_name>\r
+                                                            <synonym>Hormographiella aspergillata</synonym>\r
+                                                            <rank>species</rank>\r
+                                                            <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/e/e9/Coprinopsis.cinerea.-.lindsey.jpg</uri>\r
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+                                                          <code>LACBI</code>\r
+                                                          <scientific_name>Laccaria bicolor</scientific_name>\r
+                                                          <common_name>Bicoloured deceiver</common_name>\r
+                                                          <synonym>Laccaria laccata var. bicolor</synonym>\r
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+                                                          <uri>https://www.llnl.gov/news/newsreleases/2006/images/Laccaria_big.jpg</uri>\r
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+                                                      <name>GYMLUX</name>\r
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+                                                        <uri>http://www.mushroomexpert.com/images/kuo3/gymnopus_luxurians_02.jpg</uri>\r
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+                                                      <code>PLEOS</code>\r
+                                                      <scientific_name>Pleurotus ostreatus</scientific_name>\r
+                                                      <common_name>Oyster mushroom</common_name>\r
+                                                      <synonym>White-rot fungus</synonym>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
+                                                      <uri>http://botit.botany.wisc.edu/toms_fungi/images/post1.jpg</uri>\r
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+                                                <clade>\r
+                                                  <taxonomy>\r
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+                                                    <synonym>Melanogastrales</synonym>\r
+                                                    <synonym>Sclerodermatales</synonym>\r
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+                                                      <rank>suborder</rank>\r
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+                                                        <authority>Schum. ex Fries</authority>\r
+                                                        <common_name>cellar fungus</common_name>\r
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+                                                        <common_name>dry rot fungus</common_name>\r
+                                                        <rank>species</rank>\r
+                                                        <uri>http://www.biolib.cz/IMG/GAL/BIG/18135.jpg</uri>\r
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+                                                      <common_name>Spiny dry rot fungus</common_name>\r
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+                                                      <uri>http://mycoweb-stv.narod.ru/fungi/Submitted/STV1/Hydnomerulius_pinastri_1_STV_20100913.jpg</uri>\r
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+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
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+                                                  <scientific_name>Jaapia argillacea</scientific_name>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                  <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f4/Jaapia-argillacea.jpeg/640px-Jaapia-argillacea.jpeg</uri>\r
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+                                                <code>GLOTR</code>\r
+                                                <scientific_name>Gloeophyllum trabeum</scientific_name>\r
+                                                <common_name>Brown rot fungus</common_name>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                                <uri>http://www.cbs.knaw.nl/images/Images_CBSFungi/CD/0001/0008/Gloeophyllum_trabeum.jpg</uri>\r
+                                              </taxonomy>\r
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+                                          <clade>\r
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+                                              <id provider="uniprot">5303</id>\r
+                                              <scientific_name>Aphyllophorales</scientific_name>\r
+                                              <authority>Gäum. (1926)</authority>\r
+                                              <common_name>Shelf Fungi</common_name>\r
+                                              <synonym>Polyporales</synonym>\r
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+                                                <scientific_name>Coriolaceae</scientific_name>\r
+                                                <rank>family</rank>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                              <reference doi="10.1017/S1477200005001623">\r
+                                                <desc>The phylogenetic distribution of resupinate forms across the major clades of mushroom-forming fungi (Homobasidiomycetes)</desc>\r
+                                              </reference>\r
+                                              <reference>\r
+                                              </reference>\r
+                                              <reference>\r
+                                              </reference>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <name>Postia &amp; Fomitopsis &amp; Wolfiporia &amp; Trametes</name>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>Antrodia clade</name>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <common_name>Antrodia clade</common_name>\r
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+                                                    <name>FOMPIN</name>\r
+                                                    <taxonomy>\r
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+                                                      <scientific_name>Fomitopsis pinicola</scientific_name>\r
+                                                      <authority>P. Karst. 1881</authority>\r
+                                                      <common_name>Red banded polypore</common_name>\r
+                                                      <synonym>Fomes pinicola</synonym>\r
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+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>POSPL</name>\r
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+                                                      <scientific_name>Postia placenta</scientific_name>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
+                                                      <uri>http://www.commanster.eu/commanster/Mushrooms/Polypore/SuPolypore/Postia.placenta.jpg</uri>\r
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+                                                </clade>\r
+                                                <clade>\r
+                                                  <name>core polyporoid clade</name>\r
+                                                  <taxonomy>\r
+                                                    <common_name>core polyporoid clade</common_name>\r
+                                                  </taxonomy>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">5325</id>\r
+                                                      <code>TRAVE</code>\r
+                                                      <scientific_name>Trametes versicolor</scientific_name>\r
+                                                      <authority>(L.) Lloyd 1921</authority>\r
+                                                      <common_name>White-rot fungus</common_name>\r
+                                                      <synonym>Coriolus versicolor</synonym>\r
+                                                      <synonym>Bjerkandera versicolor</synonym>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
+                                                      <uri>http://www.mykoweb.com/CAF/photos/Trametes_versicolor(bab-1).jpg</uri>\r
+                                                      <uri>http://www.mykoweb.com/CAF/photos/Trametes_versicolor(bab-2).jpg</uri>\r
+                                                      <uri>http://www.mykoweb.com/CAF/photos/Trametes_versicolor(mgw-01).jpg</uri>\r
+                                                      <uri>http://genome.jgi-psf.org/public/Trave1/Trametes_versicolor.JPG</uri>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                  <clade>\r
+                                                    <name>WOLCOC</name>\r
+                                                    <taxonomy>\r
+                                                      <id provider="uniprot">81056</id>\r
+                                                      <scientific_name>Wolfiporia cocos</scientific_name>\r
+                                                      <rank>species</rank>\r
+                                                      <uri>http://toolate.s7.coreserver.jp/kinoko/fungi/wolfiporia_cocos/w_cocos_002.jpg</uri>\r
+                                                    </taxonomy>\r
+                                                  </clade>\r
+                                                </clade>\r
+                                              </clade>\r
+                                              <clade>\r
+                                                <taxonomy>\r
+                                                  <id provider="uniprot">42742</id>\r
+                                                  <code>CERSU</code>\r
+                                                  <scientific_name>Ceriporiopsis subvermispora</scientific_name>\r
+                                                  <rank>species</rank>\r
+                                                </taxonomy>\r
+                                              </clade>\r
+                                            </clade>\r
+                                            <clade>\r
+                                              <name>DICSQU</name>\r
+                                              <taxonomy>\r
+                                                <id provider="uniprot">114155</id>\r
+                                                <scientific_name>Dichomitus squalens</scientific_name>\r
+                                                <authority>(P. Karst.) D. A. Reid 1965</authority>\r
+                                                <common_name>Red rot</common_name>\r
+                                                <synonym>Polyporus anceps</synonym>\r
+                                                <rank>species</rank>\r
+                                                <uri>http://www.fs.fed.us/r3/resources/health/field-guide/images/large/sds-f199-large.jpg</uri>\r
+                                              </taxonomy>\r
+                                            </clade>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">13563</id>\r
+                                            <code>HETAN</code>\r
+                                            <scientific_name>Heterobasidion annosum</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Root rot fungus</common_name>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">5215</id>\r
+                                          <scientific_name>Tremellaceae</scientific_name>\r
+                                          <rank>family</rank>\r
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+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">5207</id>\r
+                                            <code>CRYNE</code>\r
+                                            <scientific_name>Cryptococcus neoformans</scientific_name>\r
+                                            <synonym>Filobasidiella neoformans</synonym>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="eol">1029985</id>\r
+                                            <code>TREME</code>\r
+                                            <scientific_name>Tremella mesenterica</scientific_name>\r
+                                            <authority>Pers. 1800</authority>\r
+                                            <common_name>Jelly fungus</common_name>\r
+                                            <synonym>Yellow Brain</synonym>\r
+                                            <synonym>Tremella lutescens</synonym>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
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+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">452284</id>\r
+                                        <scientific_name>Ustilaginomycotina</scientific_name>\r
+                                        <rank>subphylum</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">425265</id>\r
+                                          <code>MALGO</code>\r
+                                          <scientific_name>Malassezia globosa (strain ATCC MYA-4612 / CBS 7966)</scientific_name>\r
+                                          <common_name>Dandruff-associated fungus</common_name>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">5270</id>\r
+                                          <code>USTMA</code>\r
+                                          <scientific_name>Ustilago maydis</scientific_name>\r
+                                          <common_name>Smut fungus</common_name>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">29000</id>\r
+                                      <scientific_name>Pucciniomycotina</scientific_name>\r
+                                      <rank>subphylum</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">5258</id>\r
+                                        <scientific_name>Pucciniales</scientific_name>\r
+                                        <common_name>rusts</common_name>\r
+                                        <rank>order</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="eol">156696</id>\r
+                                          <code>MELLP</code>\r
+                                          <scientific_name>Melampsora laricis-populina</scientific_name>\r
+                                          <authority>Kleb. 1902</authority>\r
+                                          <synonym>Melampsora larici-populina</synonym>\r
+                                          <synonym>Melampsora laricipopulina</synonym>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="eol">1029947</id>\r
+                                          <code>PUCGR</code>\r
+                                          <scientific_name>Puccinia graminis</scientific_name>\r
+                                          <authority>Pers. 1794</authority>\r
+                                          <common_name>Black stem rust fungus</common_name>\r
+                                          <synonym>Wheat rust</synonym>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">89013</id>\r
+                                        <scientific_name>mitosporic Sporidiobolales</scientific_name>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">29898</id>\r
+                                          <code>RHOGR</code>\r
+                                          <scientific_name>Rhodotorula graminis</scientific_name>\r
+                                          <common_name>Yeast</common_name>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>SPORO</name>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="eol">1013696</id>\r
+                                          <scientific_name>Sporobolomyces roseus</scientific_name>\r
+                                          <authority>Kluyver &amp; C. B. Niel 1924</authority>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">148960</id>\r
+                                    <code>WALSE</code>\r
+                                    <scientific_name>Wallemia sebi</scientific_name>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">451507</id>\r
+                                <scientific_name>Mucoromycotina</scientific_name>\r
+                                <rank>subphylum</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">34489</id>\r
+                                  <scientific_name>Mucoraceae</scientific_name>\r
+                                  <rank>family</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">36080</id>\r
+                                    <code>MUCCI</code>\r
+                                    <scientific_name>Mucor circinelloides</scientific_name>\r
+                                    <synonym>Mucor griseo-roseus</synonym>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
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+                                  <taxonomy>\r
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+                                    <rank>species</rank>\r
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+                                <name>MORVER</name>\r
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+                                  <scientific_name>Mortierella verticillata</scientific_name>\r
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+                                  <uri>http://www.diark.org/img/species_pict/Mortierella_verticillata</uri>\r
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+                            <authority>A. Fisch. 1892</authority>\r
+                            <rank>species</rank>\r
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+                <clade>\r
+                  <name>Fonticula &amp; Nucleariidae</name>\r
+                  <reference doi="10.1093/molbev/msp185">\r
+                  </reference>\r
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+                    <name>FONALB</name>\r
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+                      <scientific_name>Fonticula alba</scientific_name>\r
+                      <synonym>Fonticula alba Worley, Raper &amp; Hohl. 1979</synonym>\r
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+        </clade>\r
+        <clade>\r
+          <name>Bikonta</name>\r
+          <reference doi="10.1099/ijs.0.63216-0">\r
+          </reference>\r
+          <clade>\r
+            <name>Corticata</name>\r
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+                                    <name>Rosales &amp; Cucurbitales</name>\r
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+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">3745</id>\r
+                                        <scientific_name>Rosaceae</scientific_name>\r
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+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">57918</id>\r
+                                          <code>FRAVE</code>\r
+                                          <scientific_name>Fragaria vesca</scientific_name>\r
+                                          <common_name>Woodland strawberry</common_name>\r
+                                          <synonym>Fragaria vesca L.</synonym>\r
+                                          <synonym>European strawberry</synonym>\r
+                                          <synonym>alpine strawberry</synonym>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                          <uri>http://www.boga.ruhr-uni-bochum.de/html/Fragaria.vesca.ja6.jpg</uri>\r
+                                          <uri>http://caliban.mpiz-koeln.mpg.de/thome/band3/tafel_092_small.jpg</uri>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">3760</id>\r
+                                          <code>PRUPE</code>\r
+                                          <scientific_name>Prunus persica</scientific_name>\r
+                                          <common_name>Peach</common_name>\r
+                                          <synonym>Persica vulgaris</synonym>\r
+                                          <synonym>Amygdalus persica</synonym>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                          <uri>http://www.mezhenskyjv.narod.ru/foto_sortov/dokaz.jpg</uri>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">3659</id>\r
+                                        <code>CUCSA</code>\r
+                                        <scientific_name>Cucumis sativus</scientific_name>\r
+                                        <common_name>Cucumber</common_name>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">3814</id>\r
+                                      <scientific_name>Papilionoideae</scientific_name>\r
+                                      <rank>subfamily</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">3847</id>\r
+                                        <code>SOYBN</code>\r
+                                        <scientific_name>Glycine max</scientific_name>\r
+                                        <authority>cv. Wye</authority>\r
+                                        <common_name>Soybean</common_name>\r
+                                        <synonym>Glycine hispida</synonym>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">3880</id>\r
+                                        <code>MEDTR</code>\r
+                                        <scientific_name>Medicago truncatula</scientific_name>\r
+                                        <common_name>Barrel medic</common_name>\r
+                                        <synonym>Medicago tribuloides</synonym>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                        <uri>http://crdp.ac-besancon.fr/flore/FABACEAE/photos/medicago_truncatula_30.jpg</uri>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">3646</id>\r
+                                    <scientific_name>Malpighiales</scientific_name>\r
+                                    <rank>order</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">3977</id>\r
+                                      <scientific_name>Euphorbiaceae</scientific_name>\r
+                                      <rank>family</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">3983</id>\r
+                                        <code>MANES</code>\r
+                                        <scientific_name>Manihot esculenta</scientific_name>\r
+                                        <common_name>Tapioca</common_name>\r
+                                        <synonym>Jatropha manihot</synonym>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                        <uri>http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/9/99/Iwata_kenichi_cassava.jpg</uri>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">3988</id>\r
+                                        <code>RICCO</code>\r
+                                        <scientific_name>Ricinus communis</scientific_name>\r
+                                        <common_name>Castor bean</common_name>\r
+                                        <synonym>Ricinus sanguineus</synonym>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                        <uri>http://nmorganics.net/wp-content/uploads/2011/09/castor.jpg</uri>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">3694</id>\r
+                                      <code>POPTR</code>\r
+                                      <scientific_name>Populus trichocarpa</scientific_name>\r
+                                      <common_name>Western balsam poplar</common_name>\r
+                                      <synonym>Populus balsamifera subsp. trichocarpa</synonym>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">91836</id>\r
+                                  <scientific_name>malvids</scientific_name>\r
+                                </taxonomy>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>Brassicales &amp; Sapindales</name>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">3699</id>\r
+                                      <scientific_name>Brassicales</scientific_name>\r
+                                      <rank>order</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">3700</id>\r
+                                        <scientific_name>Brassicaceae</scientific_name>\r
+                                        <rank>family</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">3701</id>\r
+                                          <scientific_name>Arabidopsis</scientific_name>\r
+                                          <rank>genus</rank>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">59689</id>\r
+                                            <code>ARALY</code>\r
+                                            <scientific_name>Arabidopsis lyrata</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Lyre-leaved rock-cress</common_name>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">3702</id>\r
+                                            <code>ARATH</code>\r
+                                            <scientific_name>Arabidopsis thaliana</scientific_name>\r
+                                            <common_name>Mouse-ear cress</common_name>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
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+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">98038</id>\r
+                                          <code>THEHA</code>\r
+                                          <scientific_name>Thellungiella halophila</scientific_name>\r
+                                          <common_name>Salt cress</common_name>\r
+                                          <rank>species</rank>\r
+                                          <uri>http://thellungiella.org/images/thellun1.jpg</uri>\r
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+                                    <clade>\r
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+                                        <id provider="uniprot">3649</id>\r
+                                        <code>CARPA</code>\r
+                                        <scientific_name>Carica papaya</scientific_name>\r
+                                        <common_name>Papaya</common_name>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                        <uri>http://www.biopix.com/photos/jko-carica-papaya-00412.jpg</uri>\r
+                                        <uri>http://www.texasriviera.com/greenthumbs/papaya10.jpg</uri>\r
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+                                      <scientific_name>Citrus</scientific_name>\r
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+                                        <scientific_name>Citrus clementina</scientific_name>\r
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+                                        <uri>http://palmen-bolschetz.de/images/citrus%20clementine.jpg</uri>\r
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+                                        <code>CITSI</code>\r
+                                        <scientific_name>Citrus sinensis</scientific_name>\r
+                                        <common_name>Sweet orange</common_name>\r
+                                        <synonym>Citrus x sinensis</synonym>\r
+                                        <synonym>Citrus aurantium var. sinensis</synonym>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                        <uri>http://www.west-crete.com/flowers/photos/citrus_sinensis-1.jpg</uri>\r
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+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">71139</id>\r
+                                    <code>EUCGR</code>\r
+                                    <scientific_name>Eucalyptus grandis</scientific_name>\r
+                                    <common_name>Flooded gum</common_name>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
+                                    <uri>http://www.calflora.net/losangelesarboretum/images/eucalyptus_grandis.jpg</uri>\r
+                                    <uri>http://www.anbg.gov.au/projects/eucalypts/images/eucalyptus-grandis-bark.jpg</uri>\r
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+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="eol">582304</id>\r
+                                <code>VITVI</code>\r
+                                <scientific_name>Vitis vinifera</scientific_name>\r
+                                <common_name>Grape</common_name>\r
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+                                      <code>SOLLC</code>\r
+                                      <scientific_name>Solanum lycopersicum</scientific_name>\r
+                                      <common_name>Tomato</common_name>\r
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+                                    </taxonomy>\r
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+                                      <id provider="uniprot">4084</id>\r
+                                      <code>SOLPI</code>\r
+                                      <scientific_name>Solanum pimpinellifolium</scientific_name>\r
+                                      <common_name>Currant tomato</common_name>\r
+                                      <synonym>Lycopersicon pimpinellifolium</synonym>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                      <uri>http://botany.csdl.tamu.edu/FLORA/hdwimages2/hdwt4-14.jpg</uri>\r
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+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="4113">uniprot</id>\r
+                                    <code>SOLTU</code>\r
+                                    <scientific_name>Solanum tuberosum</scientific_name>\r
+                                    <common_name>Potato</common_name>\r
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+                                  <code>TOBAC</code>\r
+                                  <scientific_name>Nicotiana tabacum</scientific_name>\r
+                                  <common_name>Common tobacco</common_name>\r
+                                  <rank>species</rank>\r
+                                  <uri>http://calphotos.berkeley.edu/imgs/512x768/0000_0000/0105/2073.jpeg</uri>\r
+                                </taxonomy>\r
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+                            <clade>\r
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+                                <id provider="uniprot">4155</id>\r
+                                <code>MIMGU</code>\r
+                                <scientific_name>Mimulus guttatus</scientific_name>\r
+                                <common_name>Yellow monkey flower</common_name>\r
+                                <synonym>Yellow monkey flower</synonym>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
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+                          </clade>\r
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+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">218851</id>\r
+                            <code>AQUCA</code>\r
+                            <scientific_name>Aquilegia caerulea</scientific_name>\r
+                            <authority>E.James</authority>\r
+                            <common_name>Rocky mountain columbine</common_name>\r
+                            <synonym>Aquilegia coerulea</synonym>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                            <uri>http://content9.eol.org/content/2010/01/01/03/15137_large.jpg</uri>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
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+                      <code>PHYPA</code>\r
+                      <scientific_name>Physcomitrella patens subsp. patens</scientific_name>\r
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+                    </clade>\r
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+                          <scientific_name>Micromonas pusilla (strain CCMP1545)</scientific_name>\r
+                          <common_name>Picoplanktonic green alga</common_name>\r
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+                          <scientific_name>Micromonas sp. (strain RCC299 / NOUM17)</scientific_name>\r
+                          <common_name>Picoplanktonic green alga</common_name>\r
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+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
+                  <clade>\r
+                    <name>Trebouxiophyceae &amp; Chlorophyceae</name>\r
+                    <clade>\r
+                      <taxonomy>\r
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+                      <clade>\r
+                        <name>CHLVUL</name>\r
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+                          <id provider="uniprot">574566</id>\r
+                          <scientific_name>Coccomyxa sp. C-169</scientific_name>\r
+                          <synonym>Chlorella vulgaris C-169</synonym>\r
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+                          <code>CHLRE</code>\r
+                          <scientific_name>Chlamydomonas reinhardtii</scientific_name>\r
+                          <synonym>Chlamydomonas smithii</synonym>\r
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+                          <code>VOLCA</code>\r
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+                  <code>CYAME</code>\r
+                  <scientific_name>Cyanidioschyzon merolae</scientific_name>\r
+                  <common_name>Red alga</common_name>\r
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+              <name>Chromalveolate</name>\r
+              <reference doi="10.1073/pnas.0712248105">\r
+              </reference>\r
+              <clade>\r
+                <name>Heterokonta_Alveolata</name>\r
+                <clade>\r
+                  <name>Alveolata</name>\r
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+                          <taxonomy>\r
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+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
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+                            <scientific_name>Cryptosporidium parvum</scientific_name>\r
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+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <name>Eimeria &amp; Toxoplasma</name>\r
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+                          </point>\r
+                        </distribution>\r
+                        <reference doi="10.1093/molbev/msn213">\r
+                          <desc>The Apicomplexan Whole-Genome Phylogeny: An Analysis of Incongruence among Gene Trees</desc>\r
+                        </reference>\r
+                        <reference>\r
+                        </reference>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">5802</id>\r
+                            <code>EIMTE</code>\r
+                            <scientific_name>Eimeria tenella</scientific_name>\r
+                            <common_name>Coccidian parasite</common_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                            <uri>http://www.k-state.edu/parasitology/625tutorials/FIGtenella.jpg</uri>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
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+                            <code>TOXGO</code>\r
+                            <scientific_name>Toxoplasma gondii</scientific_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
+                  <clade>\r
+                    <taxonomy>\r
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+                    </taxonomy>\r
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+                      <taxonomy>\r
+                        <id provider="uniprot">5888</id>\r
+                        <code>PARTE</code>\r
+                        <scientific_name>Paramecium tetraurelia</scientific_name>\r
+                        <rank>species</rank>\r
+                      </taxonomy>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
+                      <taxonomy>\r
+                        <id provider="uniprot">5911</id>\r
+                        <code>TETTH</code>\r
+                        <scientific_name>Tetrahymena thermophila</scientific_name>\r
+                        <rank>species</rank>\r
+                      </taxonomy>\r
+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
+                </clade>\r
+                <clade>\r
+                  <name>Heterokonta</name>\r
+                  <taxonomy>\r
+                    <id provider="uniprot">33634</id>\r
+                    <scientific_name>stramenopiles</scientific_name>\r
+                    <synonym>Chromophyta</synonym>\r
+                  </taxonomy>\r
+                  <clade>\r
+                    <name>Pelagophyceae_Bacillariophyta</name>\r
+                    <clade>\r
+                      <taxonomy>\r
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+                        <scientific_name>Bacillariophyta</scientific_name>\r
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+                      <clade>\r
+                        <taxonomy>\r
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+                          <scientific_name>Bacillariophycidae</scientific_name>\r
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+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="eol">911694</id>\r
+                            <code>FRACY</code>\r
+                            <scientific_name>Fragilariopsis cylindrus</scientific_name>\r
+                            <authority>Krieger</authority>\r
+                            <synonym>Nitzschia cylindrus</synonym>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
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+                            <code>PHATR</code>\r
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+                          <authority>Hasle &amp; Heimdal</authority>\r
+                          <common_name>Marine diatom</common_name>\r
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+                        <authority>Hargraves &amp; Sieburth</authority>\r
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+            </reference>\r
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+              <name>Kinetoplastida_Heterolobosea</name>\r
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+                          </clade>\r
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+                                  <scientific_name>Methanoregula boonei (strain 6A8)</scientific_name>\r
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+                                  <code>METHU</code>\r
+                                  <scientific_name>Methanospirillum hungatei</scientific_name>\r
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+                                <code>METMJ</code>\r
+                                <scientific_name>Methanoculleus marisnigri (strain ATCC 35101 / DSM 1498 / JR1)</scientific_name>\r
+                              </taxonomy>\r
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+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
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+                            <scientific_name>Methanocorpusculum labreanum (strain ATCC 43576 / DSM 4855 / Z)</scientific_name>\r
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+                          <scientific_name>Methanosaeta thermophila (strain DSM 6194 / PT)</scientific_name>\r
+                          <synonym>Methanothrix thermophila (strain DSM 6194 / PT)</synonym>\r
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+                              <synonym>Halobacterium marismortui</synonym>\r
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+                              <scientific_name>Natronomonas pharaonis</scientific_name>\r
+                              <common_name>Natronobacterium pharaonis</common_name>\r
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+                              <scientific_name>Halobacterium salinarum (strain ATCC 29341 / DSM 671 / R1)</scientific_name>\r
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+                      <clade>\r
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+                          <scientific_name>Haloquadratum walsbyi (strain DSM 16790)</scientific_name>\r
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+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
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+                      <code>ARCFU</code>\r
+                      <scientific_name>Archaeoglobus fulgidus</scientific_name>\r
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+                      <clade>\r
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+                            <scientific_name>Methanococcus vannielii (strain SB / ATCC 35089 / DSM 1224)</scientific_name>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
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+                            <scientific_name>Methanobrevibacter smithii (strain PS / ATCC 35061 / DSM 861)</scientific_name>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
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+                          <taxonomy>\r
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+                            <code>METST</code>\r
+                            <scientific_name>Methanosphaera stadtmanae (strain DSM 3091)</scientific_name>\r
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+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
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+                  </clade>\r
+                  <clade>\r
+                    <taxonomy>\r
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+              <clade>\r
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+                  <clade>\r
+                    <taxonomy>\r
+                      <id provider="uniprot">2261</id>\r
+                      <code>PYRFU</code>\r
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+                    </taxonomy>\r
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+                  <clade>\r
+                    <taxonomy>\r
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+                      <code>PYRKO</code>\r
+                      <scientific_name>Pyrococcus kodakaraensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1)</scientific_name>\r
+                      <synonym>Thermococcus kodakaraensis (strain KOD1)</synonym>\r
+                    </taxonomy>\r
+                  </clade>\r
+                </clade>\r
+                <clade>\r
+                  <name>a_50</name>\r
+                  <taxonomy>\r
+                    <id provider="uniprot">2260</id>\r
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+                      <code>PYRAB</code>\r
+                      <scientific_name>Pyrococcus abyssi</scientific_name>\r
+                      <rank>species</rank>\r
+                    </taxonomy>\r
+                  </clade>\r
+                  <clade>\r
+                    <taxonomy>\r
+                      <id provider="uniprot">53953</id>\r
+                      <code>PYRHO</code>\r
+                      <scientific_name>Pyrococcus horikoshii</scientific_name>\r
+                      <rank>species</rank>\r
+                    </taxonomy>\r
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+                <scientific_name>Picrophilus torridus (strain ATCC 700027 / DSM 9790 / JCM 10055 / NBRC 100828)</scientific_name>\r
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+                    <scientific_name>Hyperthermus butylicus (strain DSM 5456 / JCM 9403)</scientific_name>\r
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+                  <scientific_name>Ignicoccus hospitalis (strain KIN4/I / DSM 18386 / JCM 14125)</scientific_name>\r
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+              <scientific_name>Korarchaeum cryptofilum (strain OPF8)</scientific_name>\r
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+      </clade>\r
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+                        <clade>\r
+                          <name>b_44</name>\r
+                          <clade>\r
+                            <name>b_30</name>\r
+                            <clade>\r
+                              <name>b_24</name>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">1236</id>\r
+                                <scientific_name>Gammaproteobacteria</scientific_name>\r
+                                <rank>class</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>b_16</name>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>b_10</name>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">543</id>\r
+                                    <scientific_name>Enterobacteriaceae</scientific_name>\r
+                                    <rank>family</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>b_8</name>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <name>b_6</name>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <name>b_4</name>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <name>b_2</name>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">561</id>\r
+                                            <scientific_name>Escherichia</scientific_name>\r
+                                            <rank>genus</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">83333</id>\r
+                                              <code>ECOLI</code>\r
+                                              <scientific_name>Escherichia coli (strain K12)</scientific_name>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                          <clade>\r
+                                            <taxonomy>\r
+                                              <id provider="uniprot">83334</id>\r
+                                              <code>ECO57</code>\r
+                                              <scientific_name>Escherichia coli O157:H7</scientific_name>\r
+                                            </taxonomy>\r
+                                          </clade>\r
+                                        </clade>\r
+                                        <clade>\r
+                                          <taxonomy>\r
+                                            <id provider="uniprot">623</id>\r
+                                            <code>SHIFL</code>\r
+                                            <scientific_name>Shigella flexneri</scientific_name>\r
+                                            <rank>species</rank>\r
+                                          </taxonomy>\r
+                                        </clade>\r
+                                      </clade>\r
+                                      <clade>\r
+                                        <taxonomy>\r
+                                          <id provider="uniprot">90371</id>\r
+                                          <code>SALTY</code>\r
+                                          <scientific_name>Salmonella typhimurium</scientific_name>\r
+                                        </taxonomy>\r
+                                      </clade>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">632</id>\r
+                                        <code>YERPE</code>\r
+                                        <scientific_name>Yersinia pestis</scientific_name>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">29488</id>\r
+                                      <code>PHOLU</code>\r
+                                      <scientific_name>Photorhabdus luminescens</scientific_name>\r
+                                      <synonym>Xenorhabdus luminescens</synonym>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>b_15</name>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>b_13</name>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">641</id>\r
+                                      <scientific_name>Vibrionaceae</scientific_name>\r
+                                      <rank>family</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">74109</id>\r
+                                        <code>PHOPR</code>\r
+                                        <scientific_name>Photobacterium profundum</scientific_name>\r
+                                        <synonym>Photobacterium sp. (strain SS9)</synonym>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">666</id>\r
+                                        <code>VIBCH</code>\r
+                                        <scientific_name>Vibrio cholerae</scientific_name>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">318161</id>\r
+                                      <code>SHEDO</code>\r
+                                      <scientific_name>Shewanella denitrificans (strain OS217 / ATCC BAA-1090 / DSM 15013)</scientific_name>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>b_23</name>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>b_21</name>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">286</id>\r
+                                    <scientific_name>Pseudomonas</scientific_name>\r
+                                    <rank>genus</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>b_19</name>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">220664</id>\r
+                                        <code>PSEF5</code>\r
+                                        <scientific_name>Pseudomonas fluorescens (strain Pf-5 / ATCC BAA-477)</scientific_name>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">205922</id>\r
+                                        <code>PSEPF</code>\r
+                                        <scientific_name>Pseudomonas fluorescens (strain Pf0-1)</scientific_name>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">287</id>\r
+                                      <code>PSEAE</code>\r
+                                      <scientific_name>Pseudomonas aeruginosa</scientific_name>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">290398</id>\r
+                                    <code>CHRSD</code>\r
+                                    <scientific_name>Chromohalobacter salexigens (strain DSM 3043 / ATCC BAA-138 / NCIMB 13768)</scientific_name>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <name>b_29</name>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">28216</id>\r
+                                <scientific_name>Betaproteobacteria</scientific_name>\r
+                                <rank>class</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                              <clade>\r
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+                                  <code>DECAR</code>\r
+                                  <scientific_name>Dechloromonas aromatica (strain RCB)</scientific_name>\r
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+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
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+                                  <scientific_name>Ralstonia metallidurans (strain CH34 / ATCC 43123 / DSM 2839)</scientific_name>\r
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+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <name>b_43</name>\r
+                            <clade>\r
+                              <name>b_41</name>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>b_35</name>\r
+                                <taxonomy>\r
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+                                  <scientific_name>Betaproteobacteria</scientific_name>\r
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+                                  <name>b_33</name>\r
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+                                    <scientific_name>Nitrosomonadaceae</scientific_name>\r
+                                    <rank>family</rank>\r
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+                                      <code>NITEU</code>\r
+                                      <scientific_name>Nitrosomonas europaea</scientific_name>\r
+                                      <rank>species</rank>\r
+                                    </taxonomy>\r
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+                                      <code>NITMU</code>\r
+                                      <scientific_name>Nitrosospira multiformis (strain ATCC 25196 / NCIMB 11849)</scientific_name>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">36861</id>\r
+                                    <code>THIDE</code>\r
+                                    <scientific_name>Thiobacillus denitrificans</scientific_name>\r
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+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>b_40</name>\r
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+                                  <scientific_name>Chromatiales</scientific_name>\r
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+                                  <name>b_38</name>\r
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+                                    <taxonomy>\r
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+                                      <code>ALHEH</code>\r
+                                      <scientific_name>Alkalilimnicola ehrlichei (strain MLHE-1)</scientific_name>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">349124</id>\r
+                                      <code>HALHL</code>\r
+                                      <scientific_name>Halorhodospira halophila (strain DSM 244 / SL1)</scientific_name>\r
+                                      <synonym>Ectothiorhodospira halophila (strain DSM 244 / SL1)</synonym>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">323261</id>\r
+                                    <code>NITOC</code>\r
+                                    <scientific_name>Nitrosococcus oceani (strain ATCC 19707 / NCIMB 11848)</scientific_name>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">317025</id>\r
+                                <code>THICR</code>\r
+                                <scientific_name>Thiomicrospira crunogena (strain XCL-2)</scientific_name>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <name>b_51</name>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">1236</id>\r
+                            <scientific_name>Gammaproteobacteria</scientific_name>\r
+                            <rank>class</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                          <clade>\r
+                            <name>b_47</name>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">135577</id>\r
+                                <code>IDILO</code>\r
+                                <scientific_name>Idiomarina loihiensis</scientific_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">446</id>\r
+                                <code>LEGPN</code>\r
+                                <scientific_name>Legionella pneumophila</scientific_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <name>b_50</name>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">32033</id>\r
+                              <scientific_name>Xanthomonadaceae</scientific_name>\r
+                              <rank>family</rank>\r
+                            </taxonomy>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">92829</id>\r
+                                <code>XANAC</code>\r
+                                <scientific_name>Xanthomonas axonopodis pv. citri</scientific_name>\r
+                                <common_name>Citrus canker</common_name>\r
+                              </taxonomy>\r
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+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">183190</id>\r
+                                <code>XYLFT</code>\r
+                                <scientific_name>Xylella fastidiosa (strain Temecula1 / ATCC 700964)</scientific_name>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <name>b_71</name>\r
+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">28211</id>\r
+                          <scientific_name>Alphaproteobacteria</scientific_name>\r
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+                        </taxonomy>\r
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+                          <name>b_67</name>\r
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+                            <name>b_65</name>\r
+                            <clade>\r
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+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">356</id>\r
+                                <scientific_name>Rhizobiales</scientific_name>\r
+                                <rank>order</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
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+                                <name>b_57</name>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">227290</id>\r
+                                  <scientific_name>Rhizobium/Agrobacterium group</scientific_name>\r
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+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">176299</id>\r
+                                    <code>AGRT5</code>\r
+                                    <scientific_name>Agrobacterium tumefaciens (strain C58 / ATCC 33970)</scientific_name>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">347834</id>\r
+                                    <code>RHIEC</code>\r
+                                    <scientific_name>Rhizobium etli (strain CFN 42 / ATCC 51251)</scientific_name>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
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+                              <clade>\r
+                                <name>b_60</name>\r
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+                                  <id provider="uniprot">41294</id>\r
+                                  <scientific_name>Bradyrhizobiaceae</scientific_name>\r
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+                                </taxonomy>\r
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+                                  <taxonomy>\r
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+                                    <code>BRAJA</code>\r
+                                    <scientific_name>Bradyrhizobium japonicum</scientific_name>\r
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+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">395960</id>\r
+                                    <code>RHOPT</code>\r
+                                    <scientific_name>Rhodopseudomonas palustris (strain TIE-1)</scientific_name>\r
+                                  </taxonomy>\r
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+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <name>b_64</name>\r
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+                                <id provider="uniprot">31989</id>\r
+                                <scientific_name>Rhodobacteraceae</scientific_name>\r
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+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">349101</id>\r
+                                  <code>RHOS1</code>\r
+                                  <scientific_name>Rhodobacter sphaeroides (strain ATCC 17029 / ATH 2.4.9)</scientific_name>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">375451</id>\r
+                                  <code>ROSDO</code>\r
+                                  <scientific_name>Roseobacter denitrificans (strain ATCC 33942 / OCh 114)</scientific_name>\r
+                                  <common_name>Erythrobacter sp. (strain OCh 114)</common_name>\r
+                                  <synonym>Roseobacter denitrificans</synonym>\r
+                                </taxonomy>\r
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+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">155892</id>\r
+                              <code>CAUCR</code>\r
+                              <scientific_name>Caulobacter crescentus</scientific_name>\r
+                              <synonym>Caulobacter vibrioides</synonym>\r
+                              <rank>species</rank>\r
+                            </taxonomy>\r
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+                        <clade>\r
+                          <name>b_70</name>\r
+                          <taxonomy>\r
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+                            <scientific_name>Rhodospirillales</scientific_name>\r
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+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">524</id>\r
+                              <code>ACICY</code>\r
+                              <scientific_name>Acidiphilium cryptum</scientific_name>\r
+                              <rank>species</rank>\r
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+                          <clade>\r
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+                              <id provider="uniprot">1085</id>\r
+                              <code>RHORU</code>\r
+                              <scientific_name>Rhodospirillum rubrum</scientific_name>\r
+                              <rank>species</rank>\r
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+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
+                      <name>b_79</name>\r
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+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">747</id>\r
+                              <code>PASMU</code>\r
+                              <scientific_name>Pasteurella multocida</scientific_name>\r
+                              <rank>species</rank>\r
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+                        </clade>\r
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+                          <taxonomy>\r
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+                            <code>NEIME</code>\r
+                            <scientific_name>Neisseria meningitidis</scientific_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
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+                        <taxonomy>\r
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+                          <code>ACIFE</code>\r
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+                            <scientific_name>Syntrophus aciditrophicus (strain SB)</scientific_name>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
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+                            <code>GEOME</code>\r
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+                            <rank>species</rank>\r
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+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">35554</id>\r
+                            <code>GEOSL</code>\r
+                            <scientific_name>Geobacter sulfurreducens</scientific_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
+                      <name>b_102</name>\r
+                      <clade>\r
+                        <name>b_98</name>\r
+                        <clade>\r
+                          <name>b_94</name>\r
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+                            <scientific_name>Myxococcaceae</scientific_name>\r
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+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">290397</id>\r
+                              <code>ANADE</code>\r
+                              <scientific_name>Anaeromyxobacter dehalogenans (strain 2CP-C)</scientific_name>\r
+                            </taxonomy>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">34</id>\r
+                              <code>MYXXA</code>\r
+                              <scientific_name>Myxococcus xanthus</scientific_name>\r
+                              <rank>species</rank>\r
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+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <name>b_97</name>\r
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+                            <id provider="uniprot">57723</id>\r
+                            <scientific_name>Acidobacteria</scientific_name>\r
+                            <rank>phylum</rank>\r
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+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">204669</id>\r
+                              <code>ACIBL</code>\r
+                              <scientific_name>Acidobacteria bacterium (strain Ellin345)</scientific_name>\r
+                            </taxonomy>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">332163</id>\r
+                              <code>SOLUS</code>\r
+                              <scientific_name>Solibacter usitatus</scientific_name>\r
+                              <rank>species</rank>\r
+                            </taxonomy>\r
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+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">265606</id>\r
+                          <code>RHOBA</code>\r
+                          <scientific_name>Rhodopirellula baltica</scientific_name>\r
+                          <rank>species</rank>\r
+                        </taxonomy>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
+                </clade>\r
+                <clade>\r
+                  <name>b_193</name>\r
+                  <clade>\r
+                    <name>b_163</name>\r
+                    <clade>\r
+                      <name>b_133</name>\r
+                      <clade>\r
+                        <name>Chloroflexi &amp; Actinobacteria</name>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">200795</id>\r
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+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">32061</id>\r
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+                              <rank>class</rank>\r
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+                              <name>b_122</name>\r
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+                                <id provider="uniprot">1106</id>\r
+                                <scientific_name>Chloroflexaceae</scientific_name>\r
+                                <common_name>filamentous anoxygenic phototrophic bacteria</common_name>\r
+                                <rank>family</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">1108</id>\r
+                                  <code>CHLAU</code>\r
+                                  <scientific_name>Chloroflexus aurantiacus</scientific_name>\r
+                                  <rank>species</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">383372</id>\r
+                                  <code>ROSCS</code>\r
+                                  <scientific_name>Roseiflexus castenholzii (strain DSM 13941 / HLO8)</scientific_name>\r
+                                  <rank>species</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">65</id>\r
+                                <code>HERAU</code>\r
+                                <scientific_name>Herpetosiphon aurantiacus</scientific_name>\r
+                                <synonym>Herpetosiphon giganteus</synonym>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">479434</id>\r
+                              <code>SPHTD</code>\r
+                              <scientific_name>Sphaerobacter thermophilus (strain DSM 20745 / S 6022)</scientific_name>\r
+                              <rank>strain</rank>\r
+                            </taxonomy>\r
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+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">201174</id>\r
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+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">2037</id>\r
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+                              <name>b_115</name>\r
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+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">266940</id>\r
+                                  <code>KINRD</code>\r
+                                  <scientific_name>Kineococcus radiotolerans (strain ATCC BAA-149 / DSM 14245 / SRS30216)</scientific_name>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">1032480</id>\r
+                                  <code>MICPN</code>\r
+                                  <scientific_name>Microlunatus phosphovorus (strain ATCC 700054 / DSM 10555 / JCM 9379 / NBRC 101784 / NCIMB 13414 / VKM Ac-1990 / NM-1)</scientific_name>\r
+                                  <common_name>Microlunatus phosphovorus NM-1</common_name>\r
+                                  <rank>strain</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
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+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">85007</id>\r
+                                <scientific_name>Corynebacterineae</scientific_name>\r
+                                <rank>suborder</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                              <clade>\r
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+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">1769</id>\r
+                                    <code>MYCLE</code>\r
+                                    <scientific_name>Mycobacterium leprae</scientific_name>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
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+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">1773</id>\r
+                                    <code>MYCTU</code>\r
+                                    <scientific_name>Mycobacterium tuberculosis</scientific_name>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
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+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
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+                                  <code>RHOOB</code>\r
+                                  <scientific_name>Rhodococcus opacus (strain B4)</scientific_name>\r
+                                  <rank>strain</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">266117</id>\r
+                              <code>RUBXD</code>\r
+                              <scientific_name>Rubrobacter xylanophilus (strain DSM 9941 / NBRC 16129)</scientific_name>\r
+                            </taxonomy>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <name>b_132</name>\r
+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">188787</id>\r
+                          <scientific_name>Deinococci</scientific_name>\r
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+                        </taxonomy>\r
+                        <clade>\r
+                          <name>b_130</name>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">1298</id>\r
+                            <scientific_name>Deinococcus</scientific_name>\r
+                            <rank>genus</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">319795</id>\r
+                              <code>DEIGD</code>\r
+                              <scientific_name>Deinococcus geothermalis (strain DSM 11300)</scientific_name>\r
+                            </taxonomy>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">1299</id>\r
+                              <code>DEIRA</code>\r
+                              <scientific_name>Deinococcus radiodurans</scientific_name>\r
+                              <rank>species</rank>\r
+                            </taxonomy>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">274</id>\r
+                            <code>THETH</code>\r
+                            <scientific_name>Thermus thermophilus</scientific_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
+                      <name>b_162</name>\r
+                      <taxonomy>\r
+                        <id provider="uniprot">1117</id>\r
+                        <scientific_name>Cyanobacteria</scientific_name>\r
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+                      <clade>\r
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+                        <clade>\r
+                          <name>b_152</name>\r
+                          <clade>\r
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+                              <name>b_144</name>\r
+                              <clade>\r
+                                <name>b_142</name>\r
+                                <clade>\r
+                                  <name>b_138</name>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">1162</id>\r
+                                    <scientific_name>Nostocaceae</scientific_name>\r
+                                    <rank>family</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <name>b_136</name>\r
+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">1172</id>\r
+                                        <code>ANAVA</code>\r
+                                        <scientific_name>Anabaena variabilis</scientific_name>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
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+                                    <clade>\r
+                                      <taxonomy>\r
+                                        <id provider="uniprot">28072</id>\r
+                                        <code>NOSS7</code>\r
+                                        <scientific_name>Nostoc sp. (strain PCC 7524)</scientific_name>\r
+                                        <rank>species</rank>\r
+                                      </taxonomy>\r
+                                    </clade>\r
+                                  </clade>\r
+                                  <clade>\r
+                                    <taxonomy>\r
+                                      <id provider="uniprot">63737</id>\r
+                                      <code>NOSP7</code>\r
+                                      <scientific_name>Nostoc punctiforme (strain ATCC 29133 / PCC 73102)</scientific_name>\r
+                                    </taxonomy>\r
+                                  </clade>\r
+                                </clade>\r
+                                <clade>\r
+                                  <taxonomy>\r
+                                    <id provider="uniprot">155978</id>\r
+                                    <code>ACAMR</code>\r
+                                    <scientific_name>Acaryochloris marina</scientific_name>\r
+                                    <rank>species</rank>\r
+                                  </taxonomy>\r
+                                </clade>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">449447</id>\r
+                                  <code>MICAN</code>\r
+                                  <scientific_name>Microcystis aeruginosa (strain NIES-843)</scientific_name>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">1206</id>\r
+                                <code>TRIER</code>\r
+                                <scientific_name>Trichodesmium erythraeum</scientific_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <name>b_149</name>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">1118</id>\r
+                              <scientific_name>Chroococcales</scientific_name>\r
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+                            </taxonomy>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">32046</id>\r
+                                <code>SYNEL</code>\r
+                                <scientific_name>Synechococcus elongatus</scientific_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">1148</id>\r
+                                <code>SYNY3</code>\r
+                                <scientific_name>Synechocystis sp. (strain PCC 6803)</scientific_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">33072</id>\r
+                            <code>GLOVI</code>\r
+                            <scientific_name>Gloeobacter violaceus</scientific_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <name>b_161</name>\r
+                        <clade>\r
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+                          <taxonomy>\r
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+                          <clade>\r
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+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">1219</id>\r
+                                <code>PROMA</code>\r
+                                <scientific_name>Prochlorococcus marinus</scientific_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">59919</id>\r
+                                <code>PROMP</code>\r
+                                <scientific_name>Prochlorococcus marinus subsp. pastoris (strain CCMP1986 / MED4)</scientific_name>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">74547</id>\r
+                              <code>PROMM</code>\r
+                              <scientific_name>Prochlorococcus marinus (strain MIT 9313)</scientific_name>\r
+                            </taxonomy>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">64471</id>\r
+                            <code>SYNS3</code>\r
+                            <scientific_name>Synechococcus sp. (strain CC9311)</scientific_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
+                  <clade>\r
+                    <name>b_192</name>\r
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+                      <name>b_190</name>\r
+                      <clade>\r
+                        <name>b_178</name>\r
+                        <clade>\r
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+                            <scientific_name>Chlorobiaceae</scientific_name>\r
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+                            <clade>\r
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+                                  <code>CHLPB</code>\r
+                                  <scientific_name>Chlorobium phaeobacteroides (strain BS1)</scientific_name>\r
+                                </taxonomy>\r
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+                                <taxonomy>\r
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+                                  <code>PROAE</code>\r
+                                  <scientific_name>Prosthecochloris aestuarii</scientific_name>\r
+                                  <rank>species</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
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+                            <clade>\r
+                              <name>b_169</name>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">274493</id>\r
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+                                  <code>PELLU</code>\r
+                                  <scientific_name>Pelodictyon luteolum</scientific_name>\r
+                                  <rank>species</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
+                                  <id provider="uniprot">290318</id>\r
+                                  <code>PROVI</code>\r
+                                  <scientific_name>Prosthecochloris vibrioformis (strain DSM 265)</scientific_name>\r
+                                  <common_name>Chlorobium vibrioforme subsp. thiosulfatophilum (strain DSM 265)</common_name>\r
+                                  <synonym>Chlorobium phaeovibrioides (strain DSM 265)</synonym>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <name>b_175</name>\r
+                            <clade>\r
+                              <name>b_173</name>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">256319</id>\r
+                                <scientific_name>Chlorobaculum</scientific_name>\r
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+                                  <scientific_name>Chlorobaculum parvum (strain NCIB 8327)</scientific_name>\r
+                                  <synonym>Chlorobium vibrioforme subsp. thiosulfatophilum (strain DSM 263 / NCIB 8327)</synonym>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                              <clade>\r
+                                <taxonomy>\r
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+                                  <code>CHLTE</code>\r
+                                  <scientific_name>Chlorobium tepidum</scientific_name>\r
+                                  <rank>species</rank>\r
+                                </taxonomy>\r
+                              </clade>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">340177</id>\r
+                                <code>CHLCH</code>\r
+                                <scientific_name>Chlorobium chlorochromatii (strain CaD3)</scientific_name>\r
+                              </taxonomy>\r
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+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">315277</id>\r
+                            <code>CHLTA</code>\r
+                            <scientific_name>Chlamydia trachomatis serovar A (strain HAR-13 / ATCC VR-571B)</scientific_name>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <name>b_189</name>\r
+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">976</id>\r
+                          <scientific_name>Bacteroidetes</scientific_name>\r
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+                            <taxonomy>\r
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+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">986</id>\r
+                                <code>FLAJO</code>\r
+                                <scientific_name>Flavobacterium johnsoniae</scientific_name>\r
+                                <synonym>Cytophaga johnsonae</synonym>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">411154</id>\r
+                                <code>GRAFK</code>\r
+                                <scientific_name>Gramella forsetii (strain KT0803)</scientific_name>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">269798</id>\r
+                              <code>CYTH3</code>\r
+                              <scientific_name>Cytophaga hutchinsonii (strain ATCC 33406 / NCIMB 9469)</scientific_name>\r
+                            </taxonomy>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <name>b_188</name>\r
+                          <taxonomy>\r
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+                            <name>b_186</name>\r
+                            <taxonomy>\r
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+                                <id provider="uniprot">817</id>\r
+                                <code>BACFR</code>\r
+                                <scientific_name>Bacteroides fragilis</scientific_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
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+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">818</id>\r
+                                <code>BACTN</code>\r
+                                <scientific_name>Bacteroides thetaiotaomicron</scientific_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">837</id>\r
+                              <code>PORGI</code>\r
+                              <scientific_name>Porphyromonas gingivalis</scientific_name>\r
+                              <synonym>Bacteroides gingivalis</synonym>\r
+                              <rank>species</rank>\r
+                            </taxonomy>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
+                      <taxonomy>\r
+                        <id provider="uniprot">309807</id>\r
+                        <code>SALRD</code>\r
+                        <scientific_name>Salinibacter ruber (strain DSM 13855 / M31)</scientific_name>\r
+                      </taxonomy>\r
+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
+                </clade>\r
+              </clade>\r
+              <clade>\r
+                <name>b_199</name>\r
+                <clade>\r
+                  <name>b_197</name>\r
+                  <taxonomy>\r
+                    <scientific_name>Verrucomicrobia</scientific_name>\r
+                  </taxonomy>\r
+                  <clade>\r
+                    <taxonomy>\r
+                      <id provider="uniprot">349741</id>\r
+                      <code>AKKM8</code>\r
+                      <scientific_name>Akkermansia muciniphila (strain ATCC BAA-835)</scientific_name>\r
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+                      <scientific_name>Methylacidiphilum infernorum (isolate V4)</scientific_name>\r
+                      <synonym>Methylokorus infernorum (strain V4)</synonym>\r
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+                    <code>LEPIC</code>\r
+                    <scientific_name>Leptospira interrogans serogroup Icterohaemorrhagiae serovar copenhageni</scientific_name>\r
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+                      <scientific_name>Fervidobacterium nodosum (strain ATCC 35602 / DSM 5306 / Rt17-B1)</scientific_name>\r
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+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                            <clade>\r
+                              <taxonomy>\r
+                                <id provider="uniprot">2104</id>\r
+                                <code>MYCPN</code>\r
+                                <scientific_name>Mycoplasma pneumoniae</scientific_name>\r
+                                <rank>species</rank>\r
+                              </taxonomy>\r
+                            </clade>\r
+                          </clade>\r
+                          <clade>\r
+                            <taxonomy>\r
+                              <id provider="uniprot">2151</id>\r
+                              <code>MESFL</code>\r
+                              <scientific_name>Mesoplasma florum</scientific_name>\r
+                              <synonym>Acholeplasma florum</synonym>\r
+                              <rank>species</rank>\r
+                            </taxonomy>\r
+                          </clade>\r
+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">134821</id>\r
+                            <code>UREPA</code>\r
+                            <scientific_name>Ureaplasma parvum</scientific_name>\r
+                            <synonym>Ureaplasma urealyticum biotype 1</synonym>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <name>b_236</name>\r
+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">137</id>\r
+                          <scientific_name>Spirochaetaceae</scientific_name>\r
+                          <rank>family</rank>\r
+                        </taxonomy>\r
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+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">139</id>\r
+                            <code>BORBU</code>\r
+                            <scientific_name>Borrelia burgdorferi</scientific_name>\r
+                            <common_name>Lyme disease spirochete</common_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
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+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
+                            <id provider="uniprot">160</id>\r
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+                            <scientific_name>Treponema pallidum</scientific_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
+                      <name>b_244</name>\r
+                      <clade>\r
+                        <name>b_242</name>\r
+                        <taxonomy>\r
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+                            </taxonomy>\r
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+                          <clade>\r
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+                              <scientific_name>Chlamydophila felis (strain Fe/C-56)</scientific_name>\r
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+                        </clade>\r
+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
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+                            <scientific_name>Chlamydia muridarum</scientific_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">785</id>\r
+                          <code>RICTY</code>\r
+                          <scientific_name>Rickettsia typhi</scientific_name>\r
+                          <rank>species</rank>\r
+                        </taxonomy>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
+                  <clade>\r
+                    <taxonomy>\r
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+                    </taxonomy>\r
+                    <clade>\r
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+                        <code>BARHE</code>\r
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+                        <rank>species</rank>\r
+                      </taxonomy>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
+                      <taxonomy>\r
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+                      <clade>\r
+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">452659</id>\r
+                          <code>RICRO</code>\r
+                          <scientific_name>Rickettsia rickettsii (strain Iowa)</scientific_name>\r
+                          <rank>strain</rank>\r
+                        </taxonomy>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">391896</id>\r
+                          <code>RICB8</code>\r
+                          <scientific_name>Rickettsia bellii (strain OSU 85-389)</scientific_name>\r
+                        </taxonomy>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
+                </clade>\r
+                <clade>\r
+                  <taxonomy>\r
+                    <id provider="uniprot">263</id>\r
+                    <code>FRATU</code>\r
+                    <scientific_name>Francisella tularensis</scientific_name>\r
+                    <rank>species</rank>\r
+                  </taxonomy>\r
+                </clade>\r
+              </clade>\r
+              <clade>\r
+                <name>b_262</name>\r
+                <clade>\r
+                  <name>b_260</name>\r
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+                    <name>b_258</name>\r
+                    <taxonomy>\r
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+                      <scientific_name>Lactobacillales</scientific_name>\r
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+                    </taxonomy>\r
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+                      <name>b_256</name>\r
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+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">1301</id>\r
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+                          <taxonomy>\r
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+                        <clade>\r
+                          <taxonomy>\r
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+                            <code>STRPY</code>\r
+                            <scientific_name>Streptococcus pyogenes</scientific_name>\r
+                            <rank>species</rank>\r
+                          </taxonomy>\r
+                        </clade>\r
+                      </clade>\r
+                      <clade>\r
+                        <taxonomy>\r
+                          <id provider="uniprot">1360</id>\r
+                          <code>LACLA</code>\r
+                          <scientific_name>Lactococcus lactis subsp. lactis</scientific_name>\r
+                          <synonym>Streptococcus lactis</synonym>\r
+                          <rank>subspecies</rank>\r
+                        </taxonomy>\r
+                      </clade>\r
+                    </clade>\r
+                    <clade>\r
+                      <taxonomy>\r
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+                        <code>LACAC</code>\r
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+                        <rank>species</rank>\r
+                      </taxonomy>\r
+                    </clade>\r
+                  </clade>\r
+                  <clade>\r
+                    <taxonomy>\r
+                      <id provider="uniprot">216816</id>\r
+                      <code>BIFLO</code>\r
+                      <scientific_name>Bifidobacterium longum</scientific_name>\r
+                      <rank>species</rank>\r
+                    </taxonomy>\r
+                  </clade>\r
+                </clade>\r
+                <clade>\r
+                  <taxonomy>\r
+                    <id provider="uniprot">851</id>\r
+                    <code>FUSNU</code>\r
+                    <scientific_name>Fusobacterium nucleatum</scientific_name>\r
+                    <rank>species</rank>\r
+                  </taxonomy>\r
+                </clade>\r
+              </clade>\r
+            </clade>\r
+            <clade>\r
+              <name>b_266</name>\r
+              <taxonomy>\r
+                <id provider="uniprot">61434</id>\r
+                <scientific_name>Dehalococcoides</scientific_name>\r
+                <rank>genus</rank>\r
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