JAL-3848 SlivkaParamSet: reformat code and add service description.
authorMateusz Warowny <mmzwarowny@dundee.ac.uk>
Thu, 8 Jul 2021 13:39:16 +0000 (15:39 +0200)
committerMateusz Warowny <mmzwarowny@dundee.ac.uk>
Thu, 8 Jul 2021 13:46:25 +0000 (15:46 +0200)
src/jalview/ws/slivkaws/SlivkaParamSet.java

index 8a1d382..9b74585 100644 (file)
@@ -1,17 +1,16 @@
 package jalview.ws.slivkaws;
 
+import java.io.IOException;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.Collections;
+import java.util.List;
+
 import jalview.ws.params.ArgumentI;
 import jalview.ws.params.WsParamSetI;
 import jalview.ws.params.simple.BooleanOption;
 import jalview.ws.params.simple.DoubleParameter;
 import jalview.ws.params.simple.IntegerParameter;
 import jalview.ws.params.simple.StringParameter;
-
-import java.io.IOException;
-import java.util.ArrayList;
-import java.util.Collections;
-import java.util.List;
-
 import uk.ac.dundee.compbio.slivkaclient.Parameter;
 import uk.ac.dundee.compbio.slivkaclient.SlivkaService;
 
@@ -26,7 +25,8 @@ public class SlivkaParamSet implements WsParamSetI
     this.service = service;
     for (Parameter param : service.getParameters())
     {
-      Object defaultValue = param.getDefault() instanceof List ? ((List<?>) param.getDefault()).get(0)
+      Object defaultValue = param.getDefault() instanceof List
+          ? ((List<?>) param.getDefault()).get(0)
           : param.getDefault();
       if (param instanceof Parameter.FlagParameter)
       {
@@ -42,7 +42,9 @@ public class SlivkaParamSet implements WsParamSetI
       {
         Integer min = ((Parameter.IntegerParameter) param).getMin();
         Integer max = ((Parameter.IntegerParameter) param).getMax();
-        Integer defVal = defaultValue != null ? ((Number) defaultValue).intValue() : null;
+        Integer defVal = defaultValue != null
+            ? ((Number) defaultValue).intValue()
+            : null;
         args.add(new IntegerParameter(param.getId(), param.getDescription(),
             param.isRequired(), defVal, (min == null) ? Integer.MIN_VALUE : min,
             (max == null) ? Integer.MAX_VALUE : max));
@@ -51,7 +53,9 @@ public class SlivkaParamSet implements WsParamSetI
       {
         Double min = ((Parameter.DecimalParameter) param).getMin();
         Double max = ((Parameter.DecimalParameter) param).getMax();
-        Double defVal = defaultValue != null ? ((Number) defaultValue).doubleValue() : null;
+        Double defVal = defaultValue != null
+            ? ((Number) defaultValue).doubleValue()
+            : null;
         args.add(new DoubleParameter(param.getId(), param.getDescription(),
             param.isRequired(), defVal, (min == null) ? -Double.MAX_VALUE : min,
             (max == null) ? Double.MAX_VALUE : max));
@@ -106,7 +110,7 @@ public class SlivkaParamSet implements WsParamSetI
   @Override
   public String getDescription()
   {
-    return "";
+    return service.getDescription();
   }
 
   @Override