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authorjprocter <Jim Procter>
Wed, 28 Apr 2010 10:21:56 +0000 (10:21 +0000)
committerjprocter <Jim Procter>
Wed, 28 Apr 2010 10:21:56 +0000 (10:21 +0000)
help/html/webServices/dbreffetcher.html

index 516f106..7f7ec10 100644 (file)
@@ -15,7 +15,9 @@ DNA sequence.</p>
 <p><strong>Initiating reference retrieval</strong><br>\r
 The application provides three ways to access the retrieval function. Either:\r
 <ul><li>select the <strong>Discover PDB IDs</strong> option from the structure submenu of the sequence's popup menu</li>\r
-<li>Select one of the options from the alignment window's <strong>Web Services</strong> menu to fetch references from either the EBI databases plus currently selected DAS sources, or an individual database source</li>\r
+<li>Choose one of the options from the 'Fetch DB Refs' submenu in the alignment window's <strong>Web Services</strong> menu:<ul>\r
+<li><em>Standard Databases</em> will fetch references from the EBI databases plus currently selected DAS sources</li>\r
+<li>The other entries submenus leading to lists of individual database sources that Jalview can access.</li></ul></li>\r
 <li>Answer 'Yes' when asked if you wish to retrieve database references for your sequences after initiating a DAS Sequence Feature fetch.</li>\r
 </ul> \r
 <p>Jalview discovers references for a sequence by generating a set\r