git://source.jalview.org / jalview.git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: 8406f2c)
JAL-3383 JAL-3253-applet
authorhansonr <hansonr@STO24954W.ad.stolaf.edu>
Mon, 5 Aug 2019 14:31:27 +0000 (09:31 -0500)
committerhansonr <hansonr@STO24954W.ad.stolaf.edu>
Mon, 5 Aug 2019 14:31:27 +0000 (09:31 -0500)
-adds timing test reports.

temp/braf.jvp [new file with mode: 0644] patch | blob
temp/timing-IntervalStore.txt [new file with mode: 0644] patch | blob
temp/timing-noIntervalStore.txt [new file with mode: 0644] patch | blob

diff --git a/temp/braf.jvp b/temp/braf.jvp
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4f9642a
Binary files /dev/null and b/temp/braf.jvp differ
diff --git a/temp/timing-IntervalStore.txt b/temp/timing-IntervalStore.txt
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e12fe41
--- /dev/null
+++ b/temp/timing-IntervalStore.txt
@@ -0,0 +1,75 @@
+intervalstore
+
+Java version: 1.8.0_191
+amd64 Windows 10 10.0
+Error reading author details: java.io.FileNotFoundException: C:\Users\hansonr\git\jalview1\classes (Access is denied)
+Error reading build details: java.io.FileNotFoundException: C:\Users\hansonr\git\jalview1\classes (Access is denied)
+Jalview Version: Test
+INFO - Getting messages for lang: en_US
+File format identified as Jalview
+Platform: timer mark   8.36    8.36    J2XML features0
+Platform: timer mark   8.825   0.465   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.882   0.057   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.987   0.105   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.005   0.018   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.063   0.058   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.087   0.024   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.107   0.02    J2XML features done
+Platform: timer mark   9.123   0.016   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.132   0.009   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.306   0.174   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.355   0.049   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.366   0.011   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.415   0.049   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.434   0.019   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.456   0.022   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.473   0.017   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.482   0.009   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.523   0.041   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.557   0.034   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.584   0.027   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.606   0.022   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.622   0.016   J2XML features done
+Assuming project file with Test is compatible with Jalview version 2.8.1
+Warning - overwriting a sequenceSetId for a viewport!
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.PfamFull
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.Pdb
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.EmblSource
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.RfamSeed
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.EmblCdsSource
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.PfamSeed
+Platform: timer mark   15.436  5.814   J2XML features0
+Platform: timer mark   15.753  0.317   J2XML features done
+Platform: timer mark   15.983  0.23    J2XML features done
+Platform: timer mark   15.994  0.011   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.032  0.038   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.038  0.006   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.049  0.011   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.05   0.001   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.096  0.046   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.1    0.004   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.125  0.025   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.139  0.014   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.147  0.008   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.156  0.009   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.16   0.004   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.196  0.036   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.198  0.002   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.209  0.011   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.248  0.039   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.251  0.003   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.274  0.023   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.276  0.002   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.293  0.017   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.295  0.002   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.313  0.018   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.314  0.001   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.324  0.01    J2XML features done
+Platform: timer mark   16.362  0.038   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.4    0.038   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.402  0.002   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.434  0.032   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.437  0.003   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.464  0.027   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.493  0.029   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.967  0.474   JVP loaded
diff --git a/temp/timing-noIntervalStore.txt b/temp/timing-noIntervalStore.txt
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d4e98a7
--- /dev/null
+++ b/temp/timing-noIntervalStore.txt
@@ -0,0 +1,76 @@
+no intervalstore
+
+Java version: 1.8.0_191
+amd64 Windows 10 10.0
+Error reading author details: java.io.FileNotFoundException: C:\Users\hansonr\git\jalview1\classes (Access is denied)
+Error reading build details: java.io.FileNotFoundException: C:\Users\hansonr\git\jalview1\classes (Access is denied)
+Jalview Version: Test
+INFO - Getting messages for lang: en_US
+File format identified as Jalview
+Platform: timer mark   7.959   7.959   J2XML features0
+Platform: timer mark   8.501   0.542   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.583   0.082   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.685   0.102   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.702   0.017   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.741   0.039   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.765   0.024   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.778   0.013   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.788   0.01    J2XML features done
+Platform: timer mark   8.794   0.006   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.801   0.007   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.829   0.028   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.835   0.006   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.866   0.031   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.891   0.025   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.913   0.022   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.929   0.016   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.936   0.007   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.963   0.027   J2XML features done
+Platform: timer mark   8.99    0.027   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.019   0.029   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.038   0.019   J2XML features done
+Platform: timer mark   9.053   0.015   J2XML features done
+Assuming project file with Test is compatible with Jalview version 2.8.1
+Warning - overwriting a sequenceSetId for a viewport!
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.PfamFull
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.Pdb
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.EmblSource
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.RfamSeed
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.EmblCdsSource
+ASeqFetch jalview.ws.dbsources.PfamSeed
+Platform: timer mark   15.691  6.638   J2XML features0
+Platform: timer mark   16.055  0.364   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.125  0.07    J2XML features done
+Platform: timer mark   16.133  0.008   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.187  0.054   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.191  0.004   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.204  0.013   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.205  0.001   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.247  0.042   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.25   0.003   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.269  0.019   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.278  0.009   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.289  0.011   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.297  0.008   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.303  0.006   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.502  0.199   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.503  0.001   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.511  0.008   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.555  0.044   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.558  0.003   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.593  0.035   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.596  0.003   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.62   0.024   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.622  0.002   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.64   0.018   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.642  0.002   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.653  0.011   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.708  0.055   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.731  0.023   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.732  0.001   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.781  0.049   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.784  0.003   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.812  0.028   J2XML features done
+Platform: timer mark   16.84   0.028   J2XML features done
+Platform: timer mark   17.329  0.489   JVP loaded
+