JAL-1641 updated json help doc
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Tue, 11 Aug 2015 16:28:59 +0000 (17:28 +0100)
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help/html/features/bioJsonFormat.html

index a91955b..23a4aa2 100644 (file)
 <title>BioJSON-1.0</title>
 </head>
 <body>
-       <h1>BioJSON</h1>
-       BioJSON is a standardise JavaScript Object Notation (JSON) format for exchange of Bio-informatics Sequence Alignment data.      
-       BioJSON-1.0 schema/documentation is available at <a href="#">http://www.jalview.org/builds/develop/examples/biojson-doc/</a>.
-       You can keep up to date with BioJSON development and latest news at <a href="#">https://github.com/jalview/biojson/wiki</a>.
+       <h1>BioJSON 1.0</h1>
+       BioJSON is a JavaScript Object Notation (JSON) specification for the representation and exchange of bioinformatics data. 
+       The first version of the specification was developed in 2015 and implemented in Jalview 2.9. Find out more about BioJSON 
+       at <a href="http://jalview.github.io/biojson/">http://jalview.github.io/biojson/</a>.
        
        <h2>Features supported</h2>
-       Export/Import of the following alignment elements are supported in BioJSON-1.0:
+       Export and import of a single alignment along with it's properties listed below:
        <ul>
                <li>Alignment Annotations</li>
                <li>Alignment Features</li>
        </ul>
 
        <h2>Features not yet supported</h2>
-       Export/Import of the following alignment elements are not supported in BioJSON-1.0:
+       The following features are not supported in BioJSON-1.0:
        <ul>
-               <li>Reference sequence</li>
-               <li>Representative sequence</li>
-               <li>Trees</li>
-               <li>3D Structures</li>
+               <li>Export and import of Reference sequence</li>
+               <li>Export and import of Representative sequence</li>
+               <li>Export and import of Trees</li>
+               <li>Export and import of 3D Structures</li>
        </ul>
 </body>
 </html>