2.08, not 2.07
authoramwaterhouse <Andrew Waterhouse>
Mon, 10 Apr 2006 15:16:46 +0000 (15:16 +0000)
committeramwaterhouse <Andrew Waterhouse>
Mon, 10 Apr 2006 15:16:46 +0000 (15:16 +0000)
help/html/features/seqfeatures.html

index d7ff008..5283e38 100755 (executable)
@@ -14,7 +14,7 @@ from the same database (such as Uniprot features), or generated by the
 same analysis process (as might be specified in a <a\r
 href="featuresFormat.html">sequence features file</a>).</p>\r
 <p><strong>Sequence Feature Inheritance</strong></p>\r
-<p>Since Jalview 2.07, sequence features are <em>global</em> to a set of\r
+<p>Since Jalview 2.08, sequence features are <em>global</em> to a set of\r
 sequences appearing (independently or together) in many different\r
 alignments. Practically, this means features loaded onto one alignment\r
 can be viewed in any alignments involving the same sequences. The same\r
@@ -35,14 +35,14 @@ automatically try to fetch sequence features (as described below).</p>
   features differently in different alignment views.</p>\r
 <p><strong>View&#8594;Fetch Sequence Features</strong></p>\r
 <p>When this option is selected, sequence features extracted from the\r
-  <a href="http://www.ebi.uniprot.org/index.html">Uniprot (http://www.ebi.unprot.org/index.html)</a> \r
+  <a href="http://www.ebi.uniprot.org/index.html">Uniprot (http://www.ebi.unprot.org/index.html)</a>\r
   record for each sequence are displayed on the alignment.</p>\r
-<p>Jalview will attempt to retrieve sequence features from Uniprot files using \r
+<p>Jalview will attempt to retrieve sequence features from Uniprot files using\r
   the EBI dbFetch web service using the given sequence names (or\r
-  Uniprot ID, if available). A 100% match with \r
+  Uniprot ID, if available). A 100% match with\r
   the Uniprot record is required for Uniprot features to be view on a sequence.</p>\r
-<p>More information about the feature is given in a tooltip, which is viewed by \r
-  moving the mouse pointer over a sequence feature. The description associated \r
+<p>More information about the feature is given in a tooltip, which is viewed by\r
+  moving the mouse pointer over a sequence feature. The description associated\r
   with the feature will then be displayed in a small label near the pointer.</p>\r
 <p><strong>The Sequence Identification Process</strong>\r
 \r
@@ -63,7 +63,7 @@ automatically try to fetch sequence features (as described below).</p>
 \r
   </p>\r
 \r
-  <p> \r
+  <p>\r
   In some cases, the ID used to retrieve Uniprot records may be out of\r
   date and you will be notified of that a 100% match between the\r
   sequence and a Uniprot record was identified, but the sequence name\r
@@ -71,12 +71,12 @@ automatically try to fetch sequence features (as described below).</p>
   <strong>Sequence&#8594;Edit Name</strong>), before Jalview will show its sequence\r
   features.\r
 <ul>\r
-  <li>remember to save your alignment if you have updated any of the sequence \r
+  <li>remember to save your alignment if you have updated any of the sequence\r
     IDs! </li>\r
 </ul>\r
-<p>Precalculated Sequence Features may be added to an alignment from the command \r
-  line, drag and drop, or from the &quot;File-&gt;Load Features / Annotations&quot; \r
-  menu item. See the <a href="featuresFormat.html">Features File Format</a> for \r
+<p>Precalculated Sequence Features may be added to an alignment from the command\r
+  line, drag and drop, or from the &quot;File-&gt;Load Features / Annotations&quot;\r
+  menu item. See the <a href="featuresFormat.html">Features File Format</a> for\r
   more details.</p>\r
 </body>\r
 </html>\r