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Mon, 15 Jun 2015 09:31:04 +0000 (10:31 +0100)
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src/jalview/io/JSONFile.java

index 39d713d..ff129a4 100644 (file)
@@ -38,7 +38,6 @@ import jalview.api.ComplexAlignFile;
 import jalview.api.FeatureRenderer;
 import jalview.api.FeaturesDisplayedI;
 import jalview.datamodel.AlignmentAnnotation;
-import jalview.datamodel.AlignmentI;
 import jalview.datamodel.Annotation;
 import jalview.datamodel.ColumnSelection;
 import jalview.datamodel.HiddenSequences;
@@ -46,7 +45,6 @@ import jalview.datamodel.Sequence;
 import jalview.datamodel.SequenceFeature;
 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
-import jalview.gui.AlignViewport;
 import jalview.json.binding.v1.AlignmentAnnotationPojo;
 import jalview.json.binding.v1.AlignmentPojo;
 import jalview.json.binding.v1.AlignmentPojo.JalviewBioJsColorSchemeMapper;
@@ -592,14 +590,6 @@ public class JSONFile extends AlignFile implements ComplexAlignFile
     return jalviewColor;
   }
 
-  public AlignViewportI getViewport(AlignmentI al)
-  {
-    AlignViewportI viewport = new AlignViewport(al, getColumnSelection());
-    viewport.setGlobalColourScheme(getColourScheme());
-    viewport.setShowSequenceFeatures(isShowSeqFeatures());
-    return viewport;
-  }
-
   public String getGlobalColorScheme()
   {
     return globalColorScheme;