JAL-2591 More rationalising of hiddencols
authorkiramt <k.mourao@dundee.ac.uk>
Wed, 7 Jun 2017 09:25:03 +0000 (10:25 +0100)
committerkiramt <k.mourao@dundee.ac.uk>
Wed, 7 Jun 2017 09:25:03 +0000 (10:25 +0100)
src/jalview/appletgui/AlignFrame.java
src/jalview/gui/AlignFrame.java

index 02d30bb..a75adbb 100644 (file)
@@ -1926,8 +1926,7 @@ public class AlignFrame extends EmbmenuFrame implements ActionListener,
     {
       copiedHiddenColumns = new Vector();
       int hiddenOffset = viewport.getSelectionGroup().getStartRes();
-      for (int[] region : viewport.getAlignment().getHiddenColumns()
-              .getHiddenRegions())
+      for (int[] region : viewport.getAlignment().getHiddenColumns())
       {
         copiedHiddenColumns.addElement(new int[] {
             region[0] - hiddenOffset, region[1] - hiddenOffset });
index 5ec9db9..e79e303 100644 (file)
@@ -1887,8 +1887,7 @@ public class AlignFrame extends GAlignFrame implements DropTargetListener,
       hiddenColumns = new ArrayList<>();
       int hiddenOffset = viewport.getSelectionGroup().getStartRes(),
               hiddenCutoff = viewport.getSelectionGroup().getEndRes();
-      for (int[] region : viewport.getAlignment().getHiddenColumns()
-              .getHiddenRegions())
+      for (int[] region : viewport.getAlignment().getHiddenColumns())
       {
         if (region[0] >= hiddenOffset && region[1] <= hiddenCutoff)
         {