2.1 updates
authoramwaterhouse <Andrew Waterhouse>
Fri, 11 Aug 2006 14:20:28 +0000 (14:20 +0000)
committeramwaterhouse <Andrew Waterhouse>
Fri, 11 Aug 2006 14:20:28 +0000 (14:20 +0000)
help/html/menus/wsmenu.html

index 66f864c..9dbfe81 100755 (executable)
         <em> Submits the alignment or currently selected region for re-alignment \r
         with clustal W. Use this if you have added some new sequences to an existing \r
         alignment.</em></li>\r
+      <li><strong>MAFFT Multiple Sequence Alignment</strong><br>\r
+        <em>Submits all, or just the currently selected region for alignment with \r
+        MAFFT. </em> </li>\r
       <li><strong>Muscle Multiple Protein Sequence Alignment</strong><br>\r
-        <em> Submits all, or jut the currently selected sequences for alignment \r
+        <em> Submits all, or just the currently selected sequences for alignment \r
         using Muscle. Do not use this if you are working with nucleic acid sequences.</em></li>\r
     </ul>\r
   </li>\r
@@ -36,8 +39,8 @@
         detection and prediction. </em></li>\r
       <li><em>If a set of sequences are selected, and they appear to be aligned, \r
         then the alignment will be used for a Jnet prediction on the <strong>first</strong> \r
-        sequence in the set (that is, the one that appears first in\r
-        the alignment window). </em> </li>\r
+        sequence in the set (that is, the one that appears first in the alignment \r
+        window). </em> </li>\r
     </ul>\r
   </li>\r
 </ul>\r