git://source.jalview.org / jalview.git / commitdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | patch | inline | side by side (parent: 9a6594b)
Reference added
authoramwaterhouse <Andrew Waterhouse>
Mon, 20 Mar 2006 14:34:06 +0000 (14:34 +0000)
committeramwaterhouse <Andrew Waterhouse>
Mon, 20 Mar 2006 14:34:06 +0000 (14:34 +0000)
help/html/misc/aaproperties.html patch | blob | history
help/html/misc/properties.gif patch | blob | history

diff --git a/help/html/misc/aaproperties.html b/help/html/misc/aaproperties.html
index 01fa1eb..f424fe9 100755 (executable)
--- a/help/html/misc/aaproperties.html
+++ b/help/html/misc/aaproperties.html
@@ -1,7 +1,30 @@
 <html>\r
 <head><title>Amino Acid Properties</title>\r
 </head>\r
-<body>\r
-<div align="center"><img src="properties.gif" width="533" height="426"> </div>\r
+<body><div align="center">\r
+<h1>Amino Acid Properties</h1>\r
+  <img src="properties.gif"></div>\r
+<p><br>\r
+  Adapted from Livingstone, C. D. and Barton, G. J. (1993), <br>\r
+  "Protein Sequence Alignments: A Strategy for the Hierarchical Analysis of Residue\r
+  Conservation", Comp. Appl. Bio. Sci., 9, 745-756. </p>\r
+<div align="center">\r
+  <table width="295" border="1" cellspacing="0" cellpadding="0">\r
+    <tr>\r
+      <td width="291"><pre><font size="4" face="Courier New, Courier, mono"><strong>ILVCAGMFYWHKREQDNSTPBZX-</strong>\r
+XXXXXXXXXXX&middot;ยท&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;&middot;&middot;XX Hydrophobic\r
+&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXXXXXXXX&middot;XXXXX Polar\r
+&middot;&middot;XXXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXXX&middot;&middot;XX Small\r
+&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;&middot;XX Proline\r
+&middot;&middot;&middot;&middot;XX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;&middot;&middot;&middot;XX Tiny\r
+XXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Aliphatic\r
+&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Aromatic\r
+&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Positive\r
+&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;X&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Negative\r
+&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXX&middot;X&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Charged</font></pre></td>\r
+    </tr>\r
+  </table>\r
+  <pre>&nbsp;</pre>\r
+</div>\r
 </body>\r
 </html>\r
diff --git a/help/html/misc/properties.gif b/help/html/misc/properties.gif
index 4448046..099e13a 100755 (executable)
Binary files a/help/html/misc/properties.gif and b/help/html/misc/properties.gif differ