clean up
[jalview.git] / forester / java / src / org / forester / application /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 11993 confadd.java
-rw-r--r-- 12572 count_support.java
-rw-r--r-- 20686 decorator.java
-rw-r--r-- 3864 get_distances.java
-rw-r--r-- 9204 goac.java
-rw-r--r-- 6040 meta_ontologizer.java
-rw-r--r-- 4919 nhx_too.java
-rw-r--r-- 6498 nj.java
-rw-r--r-- 5761 obo_tool.java
-rw-r--r-- 14893 pccx.java
-rw-r--r-- 3941 pfam2go_extractor.java
-rw-r--r-- 5477 pfam_go.java
-rw-r--r-- 3943 pfamacc2go.java
-rw-r--r-- 4638 pfamacc2pfamid.java
-rw-r--r-- 19808 phyloxml_converter.java
-rw-r--r-- 3027 printAllSpecies.java
-rw-r--r-- 2955 printSameOrder.java
-rw-r--r-- 25777 rio.java
-rw-r--r-- 11276 sdi.java
-rw-r--r-- 23457 sdi_dir.java
-rw-r--r-- 13226 sdi_r.java
-rw-r--r-- 8806 sdix.java
-rw-r--r-- 3318 simple_node_processor.java
-rw-r--r-- 4876 strip.java
-rw-r--r-- 10244 support_statistics.java
-rw-r--r-- 8555 support_transfer.java
-rw-r--r-- 8813 surf_paup.java
-rw-r--r-- 182083 surfacing.java
-rw-r--r-- 180140 surfacing_hmmpfam.java
-rw-r--r-- 179026 surfacing_old.java
-rw-r--r-- 11347 ta.java