JAL-3989 Code tidying, added JVL_HEADER for older versions of Jalview, allow time...
[jalview.git] / src / jalview / gui /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 5352 APQHandlers.java
-rw-r--r-- 7954 AlignExportOptions.java
-rw-r--r-- 175717 AlignFrame.java
-rw-r--r-- 32068 AlignViewport.java
-rw-r--r-- 49073 AlignmentPanel.java
-rw-r--r-- 17879 AnnotationChooser.java
-rw-r--r-- 13367 AnnotationColourChooser.java
-rw-r--r-- 24607 AnnotationColumnChooser.java
-rw-r--r-- 12125 AnnotationExporter.java
-rwxr-xr-x 34889 AnnotationLabels.java
-rwxr-xr-x 35493 AnnotationPanel.java
-rw-r--r-- 14509 AnnotationRowFilter.java
-rw-r--r-- 15562 AppJmol.java
-rw-r--r-- 8085 AppJmolBinding.java
-rw-r--r-- 20079 AppVarna.java
-rw-r--r-- 14214 AppVarnaBinding.java
-rw-r--r-- 7096 AquaInternalFrameManager.java
-rw-r--r-- 2788 AssociatePdbFileWithSeq.java
-rw-r--r-- 23285 BlogReader.java
-rw-r--r-- 18902 CalculationChooser.java
-rw-r--r-- 15917 ChimeraViewFrame.java
-rw-r--r-- 2462 ChimeraXViewFrame.java
-rw-r--r-- 10067 ColourMenuHelper.java
-rw-r--r-- 1871 ComboBoxTooltipRenderer.java
-rw-r--r-- 23956 Console.java
-rw-r--r-- 17424 CrossRefAction.java
-rw-r--r-- 6311 CutAndPasteHtmlTransfer.java
-rw-r--r-- 10790 CutAndPasteTransfer.java
-rw-r--r-- 101724 Desktop.java
-rw-r--r-- 3385 EditNameDialog.java
-rw-r--r-- 22863 FeatureEditor.java
-rw-r--r-- 1513 FeatureRenderer.java
-rw-r--r-- 62946 FeatureSettings.java
-rw-r--r-- 51542 FeatureTypeSettings.java
-rwxr-xr-x 11797 Finder.java
-rwxr-xr-x 12046 FontChooser.java
-rw-r--r-- 3801 Help.java
-rw-r--r-- 1795 IProgressIndicator.java
-rw-r--r-- 1218 IProgressIndicatorHandler.java
-rwxr-xr-x 15171 IdCanvas.java
-rwxr-xr-x 16297 IdPanel.java
-rwxr-xr-x 4077 IdwidthAdjuster.java
-rw-r--r-- 7727 ImageExporter.java
-rw-r--r-- 14486 JDatabaseTree.java
-rw-r--r-- 3132 JalviewBooleanRadioButtons.java
-rw-r--r-- 2992 JalviewChangeSupport.java
-rw-r--r-- 2115 JalviewChimeraBindingModel.java
-rw-r--r-- 3500 JalviewChimeraXBindingModel.java
-rw-r--r-- 2973 JalviewColourChooser.java
-rw-r--r-- 3729 JalviewDialog.java
-rw-r--r-- 21659 JvOptionPane.java
-rw-r--r-- 10707 JvSwingUtils.java
-rw-r--r-- 5927 LineartOptions.java
-rw-r--r-- 2891 MenuChooser.java
-rw-r--r-- 2376 OOMWarning.java
-rw-r--r-- 24125 OptsAndParamsPage.java
-rw-r--r-- 1023 OptsParametersContainerI.java
-rw-r--r-- 7696 OverviewCanvas.java
-rwxr-xr-x 11785 OverviewPanel.java
-rw-r--r-- 20446 PCAPanel.java
-rwxr-xr-x 6540 PaintRefresher.java
-rwxr-xr-x 5222 PairwiseAlignPanel.java
-rw-r--r-- 69317 PopupMenu.java
-rwxr-xr-x 51603 Preferences.java
-rw-r--r-- 7324 ProgressBar.java
-rw-r--r-- 4440 ProgressPanel.java
-rw-r--r-- 5952 PromptUserConfig.java
-rw-r--r-- 6709 PymolBindingModel.java
-rw-r--r-- 11325 PymolViewer.java
-rwxr-xr-x 7714 RedundancyPanel.java
-rw-r--r-- 7630 RestInputParamEditDialog.java
-rw-r--r-- 15533 RestServiceEditorPane.java
-rwxr-xr-x 22390 RotatableCanvas.java
-rwxr-xr-x 15895 ScalePanel.java
-rwxr-xr-x 64136 SeqCanvas.java
-rw-r--r-- 78174 SeqPanel.java
-rwxr-xr-x 27539 SequenceFetcher.java
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-rw-r--r-- 3604 Slider.java
-rwxr-xr-x 12089 SliderPanel.java
-rwxr-xr-x 9365 SplashScreen.java
-rw-r--r-- 33846 SplitFrame.java
-rw-r--r-- 46962 StructureChooser.java
-rw-r--r-- 10973 StructureViewer.java
-rw-r--r-- 35026 StructureViewerBase.java
-rw-r--r-- 8527 TextColourChooser.java
-rwxr-xr-x 26591 TreeCanvas.java
-rwxr-xr-x 22357 TreePanel.java
-rwxr-xr-x 26389 UserDefinedColours.java
-rw-r--r-- 5123 UserQuestionnaireCheck.java
-rw-r--r-- 35126 VamsasApplication.java
-rw-r--r-- 8238 ViewSelectionMenu.java
-rw-r--r-- 22902 WebserviceInfo.java
-rw-r--r-- 43625 WsJobParameters.java
-rw-r--r-- 10371 WsParamSetManager.java
-rw-r--r-- 17301 WsPreferences.java
drwxr-xr-x - structurechooser